More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1854 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_27020  methionine synthase (B12-dependent)  65.03 
 
 		 1184 aa  1553    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12372  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  70.89 
 
 		 1178 aa  1661    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  50.37 
 
 		 1215 aa  1127    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10061  putative methionine synthase  46.3 
 
 		 1182 aa  1059    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0164665 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39.43 
 
 		 1132 aa  774    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  50.51 
 
 		 1168 aa  1100    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39.52 
 
 		 1132 aa  774    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39.52 
 
 		 1133 aa  772    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39.52 
 
 		 1133 aa  774    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  49.39 
 
 		 1223 aa  1092    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  39.23 
 
 		 1132 aa  764    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  46.08 
 
 		 1191 aa  1050    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  76.53 
 
 		 1158 aa  1818    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0333  putative methionine synthase  46.3 
 
 		 1182 aa  1058    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09591  putative methionine synthase  44.21 
 
 		 1187 aa  1034    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0064  methionine synthase  42.53 
 
 		 1254 aa  887    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496444 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1488  methionine synthase  41.92 
 
 		 1156 aa  891    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.128181  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2445  methionine synthase  64.58 
 
 		 1199 aa  1506    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.795669  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  48.93 
 
 		 1178 aa  1080    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  39.09 
 
 		 1132 aa  768    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1418  methionine synthase  63.54 
 
 		 1181 aa  1485    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.156555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  47.27 
 
 		 1208 aa  1043    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  42.94 
 
 		 1196 aa  874    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  49.03 
 
 		 1208 aa  1078    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0087  methionine synthase  45.23 
 
 		 1149 aa  861    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.834345  normal  0.210518 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39.52 
 
 		 1132 aa  774    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  42.55 
 
 		 1163 aa  928    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0923  putative methionine synthase  44.3 
 
 		 1188 aa  1042    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1372  methionine synthase (B12-dependent)  49.49 
 
 		 1190 aa  1068    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.477278 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  48.33 
 
 		 1176 aa  1070    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1531  methionine synthase (B12-dependent)  49.29 
 
 		 1182 aa  1057    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  45.13 
 
 		 1150 aa  886    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  39 
 
 		 1132 aa  762    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2325  methionine synthase  68.61 
 
 		 1171 aa  1598    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0940297  hitchhiker  0.00240742 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  48.02 
 
 		 1191 aa  1084    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  48.1 
 
 		 1191 aa  1088    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0723  methionine synthase  55.39 
 
 		 1151 aa  1208    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.830371  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4499  methionine synthase  66.64 
 
 		 1173 aa  1571    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.629663  hitchhiker  0.00843884 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3349  methionine synthase  61.19 
 
 		 1214 aa  1433    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1700  methionine synthase  50.43 
 
 		 1171 aa  1080    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  41.31 
 
 		 1180 aa  873    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3230  methionine synthase  50.43 
 
 		 1183 aa  1129    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1854  methionine synthase  100 
 
 		 1154 aa  2353    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516902 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3503  methionine synthase  47.63 
 
 		 1212 aa  1056    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.929135  normal  0.479801 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09841  putative methionine synthase  44.38 
 
 		 1188 aa  1039    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  42.58 
 
 		 1136 aa  820    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1549  methionine synthase  72.58 
 
 		 1156 aa  1741    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.217391 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3878  methionine synthase  42.7 
 
 		 1208 aa  890    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00387489  normal  0.106452 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2171  methionine synthase  68.38 
 
 		 1167 aa  1592    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.657352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  42.91 
 
 		 1189 aa  873    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39.52 
 
 		 1132 aa  774    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1073  methionine synthase (B12-dependent)  46.51 
 
 		 1197 aa  1042    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  46.37 
 
 		 1224 aa  1060    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1940  methionine synthase  64.95 
 
 		 1193 aa  1518    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.092673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5917  methionine synthase  81.54 
 
 		 1154 aa  1993    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0712476  normal  0.0446229 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0102  methionine synthase  45.38 
 
 		 1150 aa  869    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39.43 
 
 		 1132 aa  773    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09821  putative methionine synthase  44.3 
 
 		 1188 aa  1026    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16010  methionine synthase (B12-dependent)  66.92 
 
 		 1176 aa  1589    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471767  normal  0.0779461 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3627  methionine synthase (B12-dependent)  61.84 
 
 		 1216 aa  1441    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12156  5-methyltetrahydrofolate-homocystein methyltransferase metH  65.62 
 
 		 1192 aa  1572    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.726643 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0092  methionine synthase  45.38 
 
 		 1150 aa  868    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2786  methionine synthase  69.41 
 
 		 1195 aa  1602    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000283973  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  68.81 
 
 		 1158 aa  1581    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  41.4 
 
 		 1169 aa  836    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5363  methionine synthase  72.61 
 
 		 1169 aa  1716    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.816675 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  40.65 
 
 		 1136 aa  796    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2292  methionine synthase  78.39 
 
 		 1157 aa  1864    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0622799  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14891  putative methionine synthase  47.15 
 
 		 1214 aa  1053    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.123192 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39.76 
 
 		 1132 aa  778    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5287  methionine synthase  34.47 
 
 		 1266 aa  623  1e-177  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212227  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1545  B12-dependent methionine synthase  35.46 
 
 		 1237 aa  617  1e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.396086  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2804  methionine synthase  33.49 
 
 		 1274 aa  608  9.999999999999999e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.294328 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2808  B12-dependent methionine synthase  33.33 
 
 		 1226 aa  606  9.999999999999999e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002355  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  33.58 
 
 		 1226 aa  605  1.0000000000000001e-171  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2132  B12-dependent methionine synthase  35.47 
 
 		 1245 aa  605  1.0000000000000001e-171  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638146 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  35.21 
 
 		 1236 aa  605  1.0000000000000001e-171  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0298  B12-dependent methionine synthase  34.49 
 
 		 1230 aa  597  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.183205  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1206  B12-dependent methionine synthase  34.76 
 
 		 1232 aa  597  1e-169  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3923  B12-dependent methionine synthase  34.57 
 
 		 1230 aa  597  1e-169  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0368  B12-dependent methionine synthase  34.49 
 
 		 1231 aa  598  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.488667  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2010  B12-dependent methionine synthase  33.47 
 
 		 1233 aa  593  1e-168  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2732  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  33.96 
 
 		 1239 aa  589  1e-167  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0346659  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0369  B12-dependent methionine synthase  33.67 
 
 		 1228 aa  591  1e-167  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.789152  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0113  B12-dependent methionine synthase  33.47 
 
 		 1227 aa  589  1e-167  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.352445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3107  B12-dependent methionine synthase  34.42 
 
 		 1236 aa  588  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03712  B12-dependent methionine synthase  34.26 
 
 		 1226 aa  587  1e-166  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4250  methionine synthase  33.01 
 
 		 1261 aa  587  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.49174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0442  B12-dependent methionine synthase  32.4 
 
 		 1226 aa  588  1e-166  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0222  B12-dependent methionine synthase  33.85 
 
 		 1227 aa  587  1e-166  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4401  B12-dependent methionine synthase  34.29 
 
 		 1227 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.90979  normal  0.334358 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4526  B12-dependent methionine synthase  34.26 
 
 		 1227 aa  588  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.267598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0650  B12-dependent methionine synthase  34.29 
 
 		 1250 aa  588  1e-166  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4523  B12-dependent methionine synthase  34.18 
 
 		 1227 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.413038 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29240  B12-dependent methionine synthase  34.66 
 
 		 1278 aa  586  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4599  B12-dependent methionine synthase  34.07 
 
 		 1227 aa  585  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.972582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0315  B12-dependent methionine synthase  34.79 
 
 		 1225 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170465 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0172  B12-dependent methionine synthase  33.2 
 
 		 1239 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.432955  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4435  B12-dependent methionine synthase  33.99 
 
 		 1227 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1115  B12-dependent methionine synthase  33.91 
 
 		 1241 aa  582  1e-164  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>