More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0087 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0087  methionine synthase  100 
 
 
1149 aa  2318    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.834345  normal  0.210518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5363  methionine synthase  44.47 
 
 
1169 aa  859    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.816675 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  40.26 
 
 
1136 aa  750    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10061  putative methionine synthase  38.67 
 
 
1182 aa  820    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0164665 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.44 
 
 
1132 aa  733    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  37.34 
 
 
1191 aa  760    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.11 
 
 
1132 aa  725    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.19 
 
 
1133 aa  725    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.19 
 
 
1133 aa  724    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1549  methionine synthase  45.05 
 
 
1156 aa  867    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.217391 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  52.68 
 
 
1196 aa  1163    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  44.78 
 
 
1158 aa  889    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0333  putative methionine synthase  38.76 
 
 
1182 aa  818    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1488  methionine synthase  38.49 
 
 
1156 aa  765    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.128181  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  42.87 
 
 
1168 aa  817    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  41.41 
 
 
1178 aa  817    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2445  methionine synthase  41.78 
 
 
1199 aa  790    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.795669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.19 
 
 
1132 aa  724    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  43.77 
 
 
1178 aa  849    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  40.57 
 
 
1208 aa  795    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  41.79 
 
 
1208 aa  827    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.71 
 
 
1132 aa  744    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  41.1 
 
 
1191 aa  853    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.11 
 
 
1132 aa  725    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.47 
 
 
1163 aa  791    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0923  putative methionine synthase  37.57 
 
 
1188 aa  780    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1372  methionine synthase (B12-dependent)  42.7 
 
 
1190 aa  820    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.477278 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3349  methionine synthase  41.39 
 
 
1214 aa  754    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1531  methionine synthase (B12-dependent)  42.24 
 
 
1182 aa  780    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2786  methionine synthase  44.65 
 
 
1195 aa  855    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000283973  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  88.51 
 
 
1150 aa  2028    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  40.8 
 
 
1191 aa  849    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  52.36 
 
 
1180 aa  1162    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09841  putative methionine synthase  37.26 
 
 
1188 aa  772    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3230  methionine synthase  40.87 
 
 
1183 aa  835    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2325  methionine synthase  44.48 
 
 
1171 aa  850    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0940297  hitchhiker  0.00240742 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  40.95 
 
 
1136 aa  753    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09821  putative methionine synthase  37.65 
 
 
1188 aa  760    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  40.13 
 
 
1176 aa  802    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3878  methionine synthase  52.33 
 
 
1208 aa  1152    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00387489  normal  0.106452 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.38 
 
 
1132 aa  731    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0102  methionine synthase  87.82 
 
 
1150 aa  1988    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14891  putative methionine synthase  38.76 
 
 
1214 aa  785    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.123192 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1700  methionine synthase  42.57 
 
 
1171 aa  811    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16010  methionine synthase (B12-dependent)  44.29 
 
 
1176 aa  817    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471767  normal  0.0779461 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1854  methionine synthase  45.63 
 
 
1154 aa  902    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.516902 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12156  5-methyltetrahydrofolate-homocystein methyltransferase metH  42.4 
 
 
1192 aa  842    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.726643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5917  methionine synthase  44.09 
 
 
1154 aa  882    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0712476  normal  0.0446229 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09591  putative methionine synthase  37.12 
 
 
1187 aa  759    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2171  methionine synthase  44.79 
 
 
1167 aa  844    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.657352  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0723  methionine synthase  45.54 
 
 
1151 aa  837    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.830371  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3503  methionine synthase  41.76 
 
 
1212 aa  830    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.929135  normal  0.479801 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27020  methionine synthase (B12-dependent)  42.7 
 
 
1184 aa  838    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12372  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1073  methionine synthase (B12-dependent)  39.29 
 
 
1197 aa  785    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  40.66 
 
 
1224 aa  810    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  43.62 
 
 
1215 aa  855    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4499  methionine synthase  44.1 
 
 
1173 aa  852    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.629663  hitchhiker  0.00843884 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  40.66 
 
 
1169 aa  756    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0064  methionine synthase  52 
 
 
1254 aa  1154    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.496444 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  43.09 
 
 
1223 aa  851    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3627  methionine synthase (B12-dependent)  41.73 
 
 
1216 aa  753    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  38.23 
 
 
1132 aa  735    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  51.99 
 
 
1189 aa  1125    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  37.94 
 
 
1132 aa  729    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  44.46 
 
 
1158 aa  879    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  38.19 
 
 
1132 aa  736    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1940  methionine synthase  44.26 
 
 
1193 aa  805    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.092673  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1267  methionine synthase  44.89 
 
 
832 aa  697    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2292  methionine synthase  44.16 
 
 
1157 aa  858    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0622799  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1418  methionine synthase  41.86 
 
 
1181 aa  785    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.156555  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0092  methionine synthase  87.73 
 
 
1150 aa  1986    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5287  methionine synthase  35.82 
 
 
1266 aa  632  1e-179  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212227  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0298  B12-dependent methionine synthase  34.35 
 
 
1230 aa  605  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.183205  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  35.73 
 
 
1236 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0650  B12-dependent methionine synthase  34.88 
 
 
1250 aa  601  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0368  B12-dependent methionine synthase  34.05 
 
 
1231 aa  601  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.488667  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4490  B12-dependent methionine synthase  34.39 
 
 
1209 aa  600  1e-170  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.816383  normal  0.548116 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3923  B12-dependent methionine synthase  34.13 
 
 
1230 aa  600  1e-170  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3474  B12-dependent methionine synthase  35.62 
 
 
1251 aa  602  1e-170  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1206  B12-dependent methionine synthase  33.74 
 
 
1232 aa  596  1e-169  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1123  B12-dependent methionine synthase  35.87 
 
 
1246 aa  598  1e-169  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.833597 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0222  B12-dependent methionine synthase  34.08 
 
 
1227 aa  596  1e-169  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4526  B12-dependent methionine synthase  34.44 
 
 
1227 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.267598  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2804  methionine synthase  33.73 
 
 
1274 aa  594  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.294328 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03891  B12-dependent methionine synthase  34.36 
 
 
1227 aa  592  1e-167  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3978  methionine synthase  34.36 
 
 
1227 aa  591  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4472  B12-dependent methionine synthase  34.28 
 
 
1227 aa  590  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.346478 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4011  B12-dependent methionine synthase  34.36 
 
 
1227 aa  592  1e-167  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.960796  normal  0.0169283 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5489  B12-dependent methionine synthase  34.28 
 
 
1227 aa  590  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4366  B12-dependent methionine synthase  35.78 
 
 
1247 aa  591  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.778137  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4401  B12-dependent methionine synthase  34.44 
 
 
1227 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.90979  normal  0.334358 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03851  hypothetical protein  34.36 
 
 
1227 aa  592  1e-167  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2808  B12-dependent methionine synthase  33.8 
 
 
1226 aa  590  1e-167  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4563  B12-dependent methionine synthase  34.36 
 
 
1227 aa  592  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4255  B12-dependent methionine synthase  34.36 
 
 
1227 aa  592  1e-167  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0705471  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002355  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  33.61 
 
 
1226 aa  592  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3775  B12-dependent methionine synthase  33.89 
 
 
1227 aa  590  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03712  B12-dependent methionine synthase  33.14 
 
 
1226 aa  586  1e-166  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4435  B12-dependent methionine synthase  34.3 
 
 
1227 aa  588  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3545  B12-dependent methionine synthase  35.28 
 
 
1245 aa  588  1e-166  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.229259 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>