More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1940 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0092  methionine synthase  44.01 
 
 
1150 aa  798    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4499  methionine synthase  61.69 
 
 
1173 aa  1472    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.629663  hitchhiker  0.00843884 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  38.31 
 
 
1132 aa  757    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.64 
 
 
1132 aa  761    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.56 
 
 
1132 aa  761    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1418  methionine synthase  73.34 
 
 
1181 aa  1733    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.156555  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3230  methionine synthase  46.35 
 
 
1183 aa  1048    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0102  methionine synthase  43.82 
 
 
1150 aa  797    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.64 
 
 
1132 aa  759    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.56 
 
 
1133 aa  758    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.64 
 
 
1133 aa  762    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3503  methionine synthase  45.87 
 
 
1212 aa  1013    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.929135  normal  0.479801 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  39.15 
 
 
1136 aa  763    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  38.84 
 
 
1169 aa  794    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  66.75 
 
 
1158 aa  1576    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0333  putative methionine synthase  43.27 
 
 
1182 aa  993    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10061  putative methionine synthase  43.36 
 
 
1182 aa  993    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0164665 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1488  methionine synthase  41.26 
 
 
1156 aa  872    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.128181  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  48.96 
 
 
1168 aa  1027    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  47.18 
 
 
1178 aa  1048    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27020  methionine synthase (B12-dependent)  60.68 
 
 
1184 aa  1434    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12372  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5917  methionine synthase  65.38 
 
 
1154 aa  1547    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0712476  normal  0.0446229 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16010  methionine synthase (B12-dependent)  75.72 
 
 
1176 aa  1782    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471767  normal  0.0779461 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  46.67 
 
 
1176 aa  1038    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  40.02 
 
 
1180 aa  802    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  47.48 
 
 
1223 aa  1055    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  45 
 
 
1208 aa  979    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  46.47 
 
 
1208 aa  1008    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3878  methionine synthase  41.54 
 
 
1208 aa  818    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00387489  normal  0.106452 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2171  methionine synthase  62.9 
 
 
1167 aa  1466    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.657352  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.64 
 
 
1132 aa  759    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  40.02 
 
 
1163 aa  863    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0923  putative methionine synthase  41.71 
 
 
1188 aa  966    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1372  methionine synthase (B12-dependent)  47.7 
 
 
1190 aa  1030    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.477278 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2786  methionine synthase  63.5 
 
 
1195 aa  1457    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000283973  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1531  methionine synthase (B12-dependent)  47.77 
 
 
1182 aa  1004    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2445  methionine synthase  61.25 
 
 
1199 aa  1427    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.795669  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  43.97 
 
 
1150 aa  818    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  44.87 
 
 
1191 aa  1030    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  40.52 
 
 
1136 aa  781    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3349  methionine synthase  72.59 
 
 
1214 aa  1705    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5363  methionine synthase  65.06 
 
 
1169 aa  1536    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.816675 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  41.12 
 
 
1196 aa  805    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09591  putative methionine synthase  41.81 
 
 
1187 aa  957    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.54 
 
 
1132 aa  756    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2325  methionine synthase  62.93 
 
 
1171 aa  1473    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0940297  hitchhiker  0.00240742 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  41.58 
 
 
1189 aa  815    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0723  methionine synthase  51.88 
 
 
1151 aa  1090    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.830371  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  38.12 
 
 
1132 aa  745    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09841  putative methionine synthase  41.62 
 
 
1188 aa  957    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  63.24 
 
 
1178 aa  1486    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0064  methionine synthase  41.54 
 
 
1254 aa  813    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.496444 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  44.95 
 
 
1191 aa  1031    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09821  putative methionine synthase  42.29 
 
 
1188 aa  968    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  47.87 
 
 
1215 aa  1050    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1073  methionine synthase (B12-dependent)  46.04 
 
 
1197 aa  1037    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  45.57 
 
 
1224 aa  1052    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1854  methionine synthase  64.76 
 
 
1154 aa  1545    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.516902 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1549  methionine synthase  64.59 
 
 
1156 aa  1517    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.217391 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0087  methionine synthase  43.86 
 
 
1149 aa  797    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.834345  normal  0.210518 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12156  5-methyltetrahydrofolate-homocystein methyltransferase metH  61.73 
 
 
1192 aa  1472    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.726643 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3627  methionine synthase (B12-dependent)  71.81 
 
 
1216 aa  1685    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2292  methionine synthase  67.15 
 
 
1157 aa  1599    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0622799  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  43.47 
 
 
1191 aa  981    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  62.21 
 
 
1158 aa  1447    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1940  methionine synthase  100 
 
 
1193 aa  2412    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.092673  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.56 
 
 
1132 aa  761    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14891  putative methionine synthase  45.73 
 
 
1214 aa  1009    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.123192 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  38.31 
 
 
1132 aa  762    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1700  methionine synthase  48.28 
 
 
1171 aa  1005    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5287  methionine synthase  34.91 
 
 
1266 aa  624  1e-177  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212227  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2132  B12-dependent methionine synthase  34.95 
 
 
1245 aa  610  1e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.638146 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1545  B12-dependent methionine synthase  34.18 
 
 
1237 aa  596  1e-169  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.396086  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0606  B12-dependent methionine synthase  34.96 
 
 
1232 aa  594  1e-168  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1115  B12-dependent methionine synthase  34.01 
 
 
1241 aa  591  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0650  B12-dependent methionine synthase  34 
 
 
1250 aa  590  1e-167  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0758  B12-dependent methionine synthase  33.36 
 
 
1246 aa  590  1e-167  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.659122  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2062  B12-dependent methionine synthase  34.78 
 
 
1228 aa  591  1e-167  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.458303  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3545  B12-dependent methionine synthase  34.38 
 
 
1245 aa  586  1e-166  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.229259 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3474  B12-dependent methionine synthase  34.66 
 
 
1251 aa  587  1e-166  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2509  B12-dependent methionine synthase  33.62 
 
 
1262 aa  586  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0872  B12-dependent methionine synthase  33.39 
 
 
1238 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2144  methionine synthase  34.44 
 
 
1243 aa  585  1.0000000000000001e-165  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.212238  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0657  methionine synthase  33.88 
 
 
1238 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1336  B12-dependent methionine synthase  34.62 
 
 
1226 aa  580  1e-164  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.262937  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3161  B12-dependent methionine synthase  34.93 
 
 
1264 aa  581  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.95608 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  34.68 
 
 
1236 aa  580  1e-164  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1123  B12-dependent methionine synthase  34.79 
 
 
1246 aa  580  1e-164  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.833597 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3211  B12-dependent methionine synthase  35.01 
 
 
1264 aa  581  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.509178 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0113  B12-dependent methionine synthase  32.84 
 
 
1227 aa  582  1e-164  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.352445  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0234  B12-dependent methionine synthase  33.17 
 
 
1237 aa  579  1.0000000000000001e-163  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.545849  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4250  methionine synthase  31.82 
 
 
1261 aa  578  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.49174  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1935  B12-dependent methionine synthase  33.87 
 
 
1250 aa  578  1.0000000000000001e-163  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.688432  normal  0.0193285 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0368  B12-dependent methionine synthase  32.5 
 
 
1231 aa  574  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.488667  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0172  B12-dependent methionine synthase  32.79 
 
 
1239 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.432955  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3923  B12-dependent methionine synthase  32.5 
 
 
1230 aa  573  1.0000000000000001e-162  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3149  B12-dependent methionine synthase  34.86 
 
 
1220 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3138  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3282  B12-dependent methionine synthase  32.69 
 
 
1244 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1030  B12-dependent methionine synthase  32.66 
 
 
1244 aa  570  1e-161  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0298  B12-dependent methionine synthase  32.5 
 
 
1230 aa  572  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.183205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>