More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0923 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0102  methionine synthase  37.32 
 
 		 1150 aa  757    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  37.62 
 
 		 1132 aa  715    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5917  methionine synthase  43.34 
 
 		 1154 aa  1026    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0712476  normal  0.0446229 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09841  putative methionine synthase  98.32 
 
 		 1188 aa  2377    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.17 
 
 		 1132 aa  712    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.09 
 
 		 1132 aa  701    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  35.41 
 
 		 1189 aa  758    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.09 
 
 		 1132 aa  700    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.17 
 
 		 1133 aa  702    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.26 
 
 		 1133 aa  702    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  37.62 
 
 		 1132 aa  717    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2786  methionine synthase  43.42 
 
 		 1195 aa  992    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000283973  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  37.52 
 
 		 1132 aa  716    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  45.02 
 
 		 1158 aa  1052    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0333  putative methionine synthase  65.18 
 
 		 1182 aa  1551    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10061  putative methionine synthase  65.46 
 
 		 1182 aa  1553    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0164665 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.28 
 
 		 1132 aa  712    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  59.63 
 
 		 1178 aa  1439    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27020  methionine synthase (B12-dependent)  45.37 
 
 		 1184 aa  1036    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12372  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1418  methionine synthase  43.02 
 
 		 1181 aa  959    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.156555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0087  methionine synthase  37.62 
 
 		 1149 aa  733    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.834345  normal  0.210518 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09591  putative methionine synthase  82.83 
 
 		 1187 aa  2042    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2171  methionine synthase  42.57 
 
 		 1167 aa  973    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.657352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2445  methionine synthase  43.01 
 
 		 1199 aa  976    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.795669  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  61.39 
 
 		 1208 aa  1543    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  60.67 
 
 		 1208 aa  1547    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0064  methionine synthase  35.28 
 
 		 1254 aa  744    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496444 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12156  5-methyltetrahydrofolate-homocystein methyltransferase metH  43.63 
 
 		 1192 aa  1002    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.726643 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.09 
 
 		 1132 aa  700    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  40.12 
 
 		 1163 aa  836    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0923  putative methionine synthase  100 
 
 		 1188 aa  2418    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1372  methionine synthase (B12-dependent)  59.61 
 
 		 1190 aa  1454    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.477278 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1531  methionine synthase (B12-dependent)  44.15 
 
 		 1182 aa  978    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16010  methionine synthase (B12-dependent)  41.9 
 
 		 1176 aa  962    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471767  normal  0.0779461 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  36.66 
 
 		 1150 aa  750    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2325  methionine synthase  42.56 
 
 		 1171 aa  974    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0940297  hitchhiker  0.00240742 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  44.15 
 
 		 1215 aa  1012    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3503  methionine synthase  58.17 
 
 		 1212 aa  1450    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.929135  normal  0.479801 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  59.93 
 
 		 1191 aa  1465    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  37.92 
 
 		 1136 aa  724    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  60.18 
 
 		 1191 aa  1464    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1940  methionine synthase  41.71 
 
 		 1193 aa  944    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.092673  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5363  methionine synthase  44.29 
 
 		 1169 aa  1013    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.816675 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  36.47 
 
 		 1180 aa  780    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  38.62 
 
 		 1169 aa  753    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4499  methionine synthase  43.23 
 
 		 1173 aa  986    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.629663  hitchhiker  0.00843884 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  43.36 
 
 		 1168 aa  996    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  58.97 
 
 		 1176 aa  1449    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3878  methionine synthase  34.38 
 
 		 1208 aa  735    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00387489  normal  0.106452 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3230  methionine synthase  60.18 
 
 		 1183 aa  1459    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.51 
 
 		 1132 aa  731    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  63.62 
 
 		 1191 aa  1537    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09821  putative methionine synthase  95.12 
 
 		 1188 aa  2295    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1073  methionine synthase (B12-dependent)  59.75 
 
 		 1197 aa  1450    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  57.81 
 
 		 1224 aa  1409    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  43.48 
 
 		 1178 aa  1018    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1488  methionine synthase  39.53 
 
 		 1156 aa  833    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.128181  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2292  methionine synthase  44.12 
 
 		 1157 aa  1011    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0622799  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  37.96 
 
 		 1136 aa  734    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1549  methionine synthase  43.62 
 
 		 1156 aa  1003    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.217391 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0723  methionine synthase  43.85 
 
 		 1151 aa  962    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.830371  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3627  methionine synthase (B12-dependent)  40.99 
 
 		 1216 aa  901    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1854  methionine synthase  44.3 
 
 		 1154 aa  1042    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516902 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  43.48 
 
 		 1158 aa  1004    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1700  methionine synthase  43.82 
 
 		 1171 aa  986    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  43.44 
 
 		 1223 aa  1013    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3349  methionine synthase  41.5 
 
 		 1214 aa  907    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0092  methionine synthase  37.32 
 
 		 1150 aa  757    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14891  putative methionine synthase  61.65 
 
 		 1214 aa  1540    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.123192 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  36.39 
 
 		 1196 aa  754    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5287  methionine synthase  30.82 
 
 		 1266 aa  571  1e-161  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4250  methionine synthase  30.81 
 
 		 1261 aa  553  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.49174  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2144  methionine synthase  30.75 
 
 		 1243 aa  551  1e-155  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.212238  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3474  B12-dependent methionine synthase  30.79 
 
 		 1251 aa  550  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  30.35 
 
 		 1236 aa  546  1e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2651  B12-dependent methionine synthase  30.61 
 
 		 1257 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3161  B12-dependent methionine synthase  30.97 
 
 		 1264 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.95608 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2093  B12-dependent methionine synthase  31.75 
 
 		 1227 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.883808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3149  B12-dependent methionine synthase  31 
 
 		 1220 aa  542  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3211  B12-dependent methionine synthase  30.97 
 
 		 1264 aa  542  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.509178 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3053  B12-dependent methionine synthase  30.89 
 
 		 1251 aa  539  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.453999 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2911  B12-dependent methionine synthase  30.52 
 
 		 1257 aa  538  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0328  B12-dependent methionine synthase  30.93 
 
 		 1264 aa  536  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1526  B12-dependent methionine synthase  30.37 
 
 		 1232 aa  539  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0872  B12-dependent methionine synthase  30.55 
 
 		 1238 aa  535  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2832  B12-dependent methionine synthase  30.17 
 
 		 1271 aa  535  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.192266 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2804  methionine synthase  30.37 
 
 		 1274 aa  532  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.294328 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0172  B12-dependent methionine synthase  30.49 
 
 		 1239 aa  530  1e-149  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.432955  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4490  B12-dependent methionine synthase  29.48 
 
 		 1209 aa  531  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.816383  normal  0.548116 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0222  B12-dependent methionine synthase  30.27 
 
 		 1227 aa  532  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0182  methionine synthase  29.68 
 
 		 1263 aa  531  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4435  B12-dependent methionine synthase  30.68 
 
 		 1227 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2467  methionine synthase  30.42 
 
 		 1261 aa  529  1e-148  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3368  B12-dependent methionine synthase  30.64 
 
 		 1233 aa  529  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1101  B12-dependent methionine synthase  30.68 
 
 		 1230 aa  528  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875071  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4401  B12-dependent methionine synthase  30.43 
 
 		 1227 aa  528  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.90979  normal  0.334358 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4526  B12-dependent methionine synthase  30.45 
 
 		 1227 aa  528  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.267598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0657  methionine synthase  30.31 
 
 		 1238 aa  529  1e-148  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2966  B12-dependent methionine synthase  30.86 
 
 		 1257 aa  524  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4366  B12-dependent methionine synthase  30.23 
 
 		 1247 aa  523  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.778137  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>