More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_2983 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03891  B12-dependent methionine synthase  37.22 
 
 
1227 aa  735    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3978  methionine synthase  37.13 
 
 
1227 aa  735    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2808  B12-dependent methionine synthase  38.47 
 
 
1226 aa  775    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2375  B12-dependent methionine synthase  38.86 
 
 
1235 aa  748    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1545  B12-dependent methionine synthase  38.08 
 
 
1237 aa  775    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.396086  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2171  methionine synthase  37.07 
 
 
1167 aa  732    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.657352  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09841  putative methionine synthase  37.4 
 
 
1188 aa  729    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  90.28 
 
 
1132 aa  2133    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1101  B12-dependent methionine synthase  38.26 
 
 
1230 aa  753    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875071  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0188  B12-dependent methionine synthase  36.26 
 
 
1261 aa  689    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1030  B12-dependent methionine synthase  37.79 
 
 
1244 aa  757    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2732  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.43 
 
 
1239 aa  722    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0346659  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  89.66 
 
 
1132 aa  2121    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  89.49 
 
 
1133 aa  2117    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  89.75 
 
 
1133 aa  2126    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2464  B12-dependent methionine synthase  36.88 
 
 
1239 aa  714    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.782684  normal  0.0191622 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0403  B12-dependent methionine synthase  37.43 
 
 
1271 aa  745    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0459446  hitchhiker  0.000026899 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0046  B12-dependent methionine synthase  38.06 
 
 
1220 aa  733    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.61869 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  38.84 
 
 
1158 aa  754    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0333  putative methionine synthase  37.47 
 
 
1182 aa  741    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2870  B12-dependent methionine synthase  37.67 
 
 
1257 aa  720    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0197  B12-dependent methionine synthase  37.54 
 
 
1263 aa  705    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0234  B12-dependent methionine synthase  37.29 
 
 
1237 aa  716    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.545849  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0283  B12-dependent methionine synthase  36.95 
 
 
1290 aa  689    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.383841  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  40.15 
 
 
1178 aa  770    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12156  5-methyltetrahydrofolate-homocystein methyltransferase metH  38.46 
 
 
1192 aa  757    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.726643 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2154  B12-dependent methionine synthase  39.01 
 
 
1228 aa  788    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1206  B12-dependent methionine synthase  38.69 
 
 
1232 aa  776    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3107  B12-dependent methionine synthase  38.66 
 
 
1236 aa  744    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45056  B12 dependent methionine synthase  35.52 
 
 
1252 aa  665    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00353368  normal  0.902557 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7061  B12-dependent methionine synthase  37.67 
 
 
1287 aa  695    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2159  B12-dependent methionine synthase  38.16 
 
 
1236 aa  744    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.088857 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0315  B12-dependent methionine synthase  39.28 
 
 
1225 aa  757    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170465 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.87 
 
 
1208 aa  770    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1692  B12-dependent methionine synthase  37.21 
 
 
1224 aa  715    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  39.26 
 
 
1208 aa  783    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0595  B12-dependent methionine synthase  37.95 
 
 
1272 aa  753    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14891  putative methionine synthase  36.97 
 
 
1214 aa  736    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.123192 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0172  B12-dependent methionine synthase  38.91 
 
 
1239 aa  778    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.432955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  89.66 
 
 
1132 aa  2121    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  36.53 
 
 
1163 aa  719    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0923  putative methionine synthase  37.51 
 
 
1188 aa  731    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1372  methionine synthase (B12-dependent)  38.65 
 
 
1190 aa  751    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.477278 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0045  B12-dependent methionine synthase  38.38 
 
 
1267 aa  750    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1531  methionine synthase (B12-dependent)  38.03 
 
 
1182 aa  717    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3320  B12-dependent methionine synthase  38.89 
 
 
1235 aa  746    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.487541 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09591  putative methionine synthase  37.01 
 
 
1187 aa  733    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  38.15 
 
 
1150 aa  716    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0112  B12-dependent methionine synthase  36.25 
 
 
1259 aa  681    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.937971  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1764  B12-dependent methionine synthase  37.21 
 
 
1304 aa  687    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.075059  normal  0.0106397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3161  B12-dependent methionine synthase  36.63 
 
 
1264 aa  696    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.95608 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3368  B12-dependent methionine synthase  37.09 
 
 
1233 aa  752    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2010  B12-dependent methionine synthase  37.38 
 
 
1233 aa  729    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3735  B12-dependent methionine synthase  37.22 
 
 
1286 aa  678    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.391435  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2509  B12-dependent methionine synthase  37.13 
 
 
1262 aa  733    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2832  B12-dependent methionine synthase  37.33 
 
 
1271 aa  725    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.192266 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3878  methionine synthase  37.85 
 
 
1208 aa  729    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00387489  normal  0.106452 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0087  methionine synthase  37.92 
 
 
1149 aa  700    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.834345  normal  0.210518 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1115  B12-dependent methionine synthase  37.21 
 
 
1241 aa  737    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3541  B12-dependent methionine synthase  37.91 
 
 
1293 aa  690    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0988023  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1889  B12-dependent methionine synthase  36.94 
 
 
1245 aa  737    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0363  B12-dependent methionine synthase  36.77 
 
 
1261 aa  655    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0449  B12-dependent methionine synthase  37.51 
 
 
1271 aa  744    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37086  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3449  B12-dependent methionine synthase  38.39 
 
 
1234 aa  740    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.625644  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  39.23 
 
 
1176 aa  786    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1336  B12-dependent methionine synthase  37.26 
 
 
1226 aa  716    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.262937  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0298  B12-dependent methionine synthase  37.99 
 
 
1230 aa  758    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.183205  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09821  putative methionine synthase  37.99 
 
 
1188 aa  725    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2169  methionine synthase  37.13 
 
 
1245 aa  719    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.205577  normal  0.226732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3149  B12-dependent methionine synthase  36.62 
 
 
1220 aa  693    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3138  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0328  B12-dependent methionine synthase  38.24 
 
 
1264 aa  726    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10061  putative methionine synthase  37.22 
 
 
1182 aa  736    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0164665 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03712  B12-dependent methionine synthase  39.31 
 
 
1226 aa  779    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1073  methionine synthase (B12-dependent)  38.69 
 
 
1197 aa  773    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  37.94 
 
 
1224 aa  765    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0838  B12-dependent methionine synthase  38.32 
 
 
1244 aa  765    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3184  B12-dependent methionine synthase  38.23 
 
 
1244 aa  766    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2132  B12-dependent methionine synthase  37.76 
 
 
1245 aa  758    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.638146 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0872  B12-dependent methionine synthase  37.7 
 
 
1238 aa  751    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3053  B12-dependent methionine synthase  36.21 
 
 
1251 aa  689    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.453999 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0710  B12-dependent methionine synthase  38.74 
 
 
1240 aa  770    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0182  B12-dependent methionine synthase  36.26 
 
 
1261 aa  689    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40670  B12-dependent methionine synthase  38.06 
 
 
1234 aa  737    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0754274  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3627  methionine synthase (B12-dependent)  37.61 
 
 
1216 aa  695    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0973  B12-dependent methionine synthase  37.18 
 
 
1244 aa  752    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3690  B12-dependent methionine synthase  37.73 
 
 
1220 aa  725    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3282  B12-dependent methionine synthase  38.15 
 
 
1244 aa  764    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  39.35 
 
 
1158 aa  762    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1700  methionine synthase  37.82 
 
 
1171 aa  717    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2102  B12-dependent methionine synthase  38.13 
 
 
1249 aa  735    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.876734  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1935  B12-dependent methionine synthase  37.25 
 
 
1250 aa  706    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.688432  normal  0.0193285 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2631  B12-dependent methionine synthase  36.24 
 
 
1244 aa  696    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0960245  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0758  B12-dependent methionine synthase  37.8 
 
 
1246 aa  751    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.659122  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3211  B12-dependent methionine synthase  36.63 
 
 
1264 aa  697    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.509178 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0113  B12-dependent methionine synthase  37.56 
 
 
1227 aa  765    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.352445  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3474  B12-dependent methionine synthase  36.84 
 
 
1251 aa  702    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1526  B12-dependent methionine synthase  38.45 
 
 
1232 aa  741    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  100 
 
 
1132 aa  2326    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0064  methionine synthase  37.79 
 
 
1254 aa  739    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.496444 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2965  B12-dependent methionine synthase  37.68 
 
 
1244 aa  761    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>