More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1531 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  39.42 
 
 		 1136 aa  767    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5917  methionine synthase  49.66 
 
 		 1154 aa  1105    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0712476  normal  0.0446229 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0102  methionine synthase  41.41 
 
 		 1150 aa  768    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3503  methionine synthase  46.42 
 
 		 1212 aa  1046    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.929135  normal  0.479801 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  38.68 
 
 		 1136 aa  756    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.03 
 
 		 1132 aa  738    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1940  methionine synthase  47.76 
 
 		 1193 aa  1014    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.092673  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  46.67 
 
 		 1176 aa  1035    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.86 
 
 		 1132 aa  727    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.03 
 
 		 1133 aa  732    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.94 
 
 		 1133 aa  729    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  39.36 
 
 		 1196 aa  788    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  49.87 
 
 		 1158 aa  1105    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0333  putative methionine synthase  43.32 
 
 		 1182 aa  986    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  46.26 
 
 		 1215 aa  1033    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  47.23 
 
 		 1178 aa  1035    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  37.49 
 
 		 1132 aa  729    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  38.57 
 
 		 1189 aa  764    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  48.96 
 
 		 1178 aa  1051    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2786  methionine synthase  48.96 
 
 		 1195 aa  1035    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000283973  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2171  methionine synthase  48.62 
 
 		 1167 aa  1051    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.657352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4499  methionine synthase  48.58 
 
 		 1173 aa  1058    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.629663  hitchhiker  0.00843884 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  47.02 
 
 		 1208 aa  1047    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  39.01 
 
 		 1180 aa  786    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  48.6 
 
 		 1208 aa  1087    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0087  methionine synthase  41.3 
 
 		 1149 aa  764    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.834345  normal  0.210518 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27020  methionine synthase (B12-dependent)  47.52 
 
 		 1184 aa  1009    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12372  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.86 
 
 		 1132 aa  727    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  41.74 
 
 		 1163 aa  908    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0923  putative methionine synthase  44.15 
 
 		 1188 aa  1021    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1372  methionine synthase (B12-dependent)  47.11 
 
 		 1190 aa  1032    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.477278 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1531  methionine synthase (B12-dependent)  100 
 
 		 1182 aa  2417    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3878  methionine synthase  38.7 
 
 		 1208 aa  783    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00387489  normal  0.106452 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  41.56 
 
 		 1150 aa  784    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16010  methionine synthase (B12-dependent)  49.25 
 
 		 1176 aa  1058    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471767  normal  0.0779461 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1418  methionine synthase  48.15 
 
 		 1181 aa  1030    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.156555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10061  putative methionine synthase  43.65 
 
 		 1182 aa  989    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0164665 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  46.4 
 
 		 1191 aa  1066    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1700  methionine synthase  67.09 
 
 		 1171 aa  1568    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09821  putative methionine synthase  44.06 
 
 		 1188 aa  1001    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0723  methionine synthase  45.85 
 
 		 1151 aa  944    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.830371  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  43.18 
 
 		 1191 aa  976    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3230  methionine synthase  47.8 
 
 		 1183 aa  1083    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1854  methionine synthase  49.29 
 
 		 1154 aa  1093    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516902 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  66.1 
 
 		 1168 aa  1572    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3349  methionine synthase  47.24 
 
 		 1214 aa  1019    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12156  5-methyltetrahydrofolate-homocystein methyltransferase metH  49.5 
 
 		 1192 aa  1068    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.726643 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  40.08 
 
 		 1169 aa  778    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0092  methionine synthase  41.41 
 
 		 1150 aa  769    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09591  putative methionine synthase  44.22 
 
 		 1187 aa  1001    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1073  methionine synthase (B12-dependent)  46.83 
 
 		 1197 aa  1062    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  44.56 
 
 		 1224 aa  993    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2445  methionine synthase  47.9 
 
 		 1199 aa  1015    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.795669  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1549  methionine synthase  47.87 
 
 		 1156 aa  1040    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.217391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5363  methionine synthase  50.59 
 
 		 1169 aa  1118    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.816675 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  46.01 
 
 		 1223 aa  1033    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0064  methionine synthase  38.15 
 
 		 1254 aa  779    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496444 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  38.15 
 
 		 1132 aa  728    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  46.24 
 
 		 1191 aa  1067    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3627  methionine synthase (B12-dependent)  48.1 
 
 		 1216 aa  1025    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  37.94 
 
 		 1132 aa  729    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1488  methionine synthase  41.28 
 
 		 1156 aa  903    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.128181  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  48.91 
 
 		 1158 aa  1031    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.03 
 
 		 1132 aa  744    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2292  methionine synthase  48.36 
 
 		 1157 aa  1080    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0622799  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2325  methionine synthase  48.5 
 
 		 1171 aa  1054    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0940297  hitchhiker  0.00240742 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.03 
 
 		 1132 aa  737    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.86 
 
 		 1132 aa  726    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14891  putative methionine synthase  45.69 
 
 		 1214 aa  1028    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.123192 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09841  putative methionine synthase  44.4 
 
 		 1188 aa  1019    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5287  methionine synthase  33.12 
 
 		 1266 aa  589  1e-167  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2804  methionine synthase  32.45 
 
 		 1274 aa  591  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.294328 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4366  B12-dependent methionine synthase  33.82 
 
 		 1247 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.778137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4918  B12-dependent methionine synthase  33.6 
 
 		 1248 aa  571  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2123  B12-dependent methionine synthase  33.17 
 
 		 1250 aa  570  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.607854 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2467  methionine synthase  32.43 
 
 		 1261 aa  569  1e-161  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0172  B12-dependent methionine synthase  32.96 
 
 		 1239 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.432955  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3545  B12-dependent methionine synthase  32.98 
 
 		 1245 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.229259 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1601  B12-dependent methionine synthase  32.74 
 
 		 1250 aa  560  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179961 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1638  B12-dependent methionine synthase  32.87 
 
 		 1250 aa  559  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3799  methionine synthase  32.76 
 
 		 1219 aa  562  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1889  B12-dependent methionine synthase  33.06 
 
 		 1245 aa  558  1e-157  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1336  B12-dependent methionine synthase  34.12 
 
 		 1226 aa  558  1e-157  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.262937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1882  B12-dependent methionine synthase  32.74 
 
 		 1250 aa  559  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.820569 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2832  B12-dependent methionine synthase  33.14 
 
 		 1271 aa  558  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.192266 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1123  B12-dependent methionine synthase  32.77 
 
 		 1246 aa  559  1e-157  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.833597 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2966  B12-dependent methionine synthase  32.82 
 
 		 1257 aa  555  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2010  B12-dependent methionine synthase  32.01 
 
 		 1233 aa  554  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2808  B12-dependent methionine synthase  31.92 
 
 		 1226 aa  556  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1526  B12-dependent methionine synthase  32.66 
 
 		 1232 aa  553  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0298  B12-dependent methionine synthase  32.02 
 
 		 1230 aa  550  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.183205  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4526  B12-dependent methionine synthase  32.72 
 
 		 1227 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.267598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3951  B12-dependent methionine synthase  31.72 
 
 		 1227 aa  553  1e-155  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360627  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2062  B12-dependent methionine synthase  31.49 
 
 		 1228 aa  550  1e-155  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.458303  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3775  B12-dependent methionine synthase  31.26 
 
 		 1227 aa  551  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  33.55 
 
 		 1236 aa  551  1e-155  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2911  B12-dependent methionine synthase  32.36 
 
 		 1257 aa  550  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0222  B12-dependent methionine synthase  32.07 
 
 		 1227 aa  551  1e-155  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2651  B12-dependent methionine synthase  32.96 
 
 		 1257 aa  550  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3923  B12-dependent methionine synthase  31.85 
 
 		 1230 aa  546  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>