More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1442 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  54.37 
 
 		 804 aa  797    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  61.44 
 
 		 841 aa  925    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  43.79 
 
 		 804 aa  653    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  54.71 
 
 		 803 aa  800    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  64.71 
 
 		 818 aa  1004    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  100 
 
 		 802 aa  1615    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  66.25 
 
 		 804 aa  1012    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  43.6 
 
 		 800 aa  601  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  43.54 
 
 		 801 aa  600  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  40.52 
 
 		 804 aa  575  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  40.15 
 
 		 813 aa  566  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  37.86 
 
 		 841 aa  566  1e-160  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  40.55 
 
 		 839 aa  567  1e-160  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  41.16 
 
 		 806 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  41.92 
 
 		 804 aa  560  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  38.7 
 
 		 807 aa  560  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  42.63 
 
 		 804 aa  561  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  40.27 
 
 		 801 aa  555  1e-156  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  40.34 
 
 		 811 aa  552  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  38.07 
 
 		 791 aa  544  1e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23490  methionine synthase (B12-dependent)  40.23 
 
 		 820 aa  531  1e-149  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.136684  hitchhiker  0.0000158862 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  36 
 
 		 819 aa  499  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  39.61 
 
 		 816 aa  463  1e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  36.08 
 
 		 768 aa  451  1e-125  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  36.08 
 
 		 768 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  33.29 
 
 		 780 aa  431  1e-119  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  32.79 
 
 		 774 aa  417  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0729  homocysteine S-methyltransferase  32.92 
 
 		 781 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  35.24 
 
 		 1150 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.01 
 
 		 1132 aa  369  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  30.81 
 
 		 793 aa  368  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0087  methionine synthase  34.71 
 
 		 1149 aa  364  3e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.834345  normal  0.210518 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  33.49 
 
 		 1196 aa  364  4e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.93 
 
 		 1132 aa  363  8e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0102  methionine synthase  34.76 
 
 		 1150 aa  362  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0092  methionine synthase  34.63 
 
 		 1150 aa  362  1e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  31.22 
 
 		 1132 aa  362  2e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  31.95 
 
 		 1223 aa  361  3e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.56 
 
 		 1132 aa  360  6e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  30.82 
 
 		 1132 aa  359  9e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.56 
 
 		 1132 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.56 
 
 		 1133 aa  357  5e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.56 
 
 		 1132 aa  357  5.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  31.35 
 
 		 1132 aa  357  5.999999999999999e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.56 
 
 		 1132 aa  357  5.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  32.51 
 
 		 1169 aa  357  6.999999999999999e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3878  methionine synthase  32.29 
 
 		 1208 aa  353  7e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00387489  normal  0.106452 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.44 
 
 		 1133 aa  352  2e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0064  methionine synthase  31.2 
 
 		 1254 aa  351  4e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496444 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  32.16 
 
 		 1178 aa  350  6e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0046  B12-dependent methionine synthase  32.01 
 
 		 1220 aa  350  8e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.61869 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  32.2 
 
 		 1189 aa  347  3e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  31.52 
 
 		 1180 aa  347  5e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3107  B12-dependent methionine synthase  31.29 
 
 		 1236 aa  345  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2010  B12-dependent methionine synthase  30.32 
 
 		 1233 aa  342  2e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  31.36 
 
 		 1168 aa  341  2.9999999999999998e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  31.63 
 
 		 1158 aa  341  4e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0172  B12-dependent methionine synthase  30.74 
 
 		 1239 aa  338  2.9999999999999997e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.432955  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2159  B12-dependent methionine synthase  31.69 
 
 		 1236 aa  337  5e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.088857 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  31.49 
 
 		 1136 aa  337  5.999999999999999e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  31.17 
 
 		 1191 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0606  B12-dependent methionine synthase  32.8 
 
 		 1232 aa  336  1e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  30.9 
 
 		 1215 aa  335  2e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29240  B12-dependent methionine synthase  31.52 
 
 		 1278 aa  335  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  31.17 
 
 		 1191 aa  335  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1935  B12-dependent methionine synthase  31.9 
 
 		 1250 aa  334  4e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.688432  normal  0.0193285 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1940  methionine synthase  33.06 
 
 		 1193 aa  333  7.000000000000001e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.092673  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1854  methionine synthase  30.81 
 
 		 1154 aa  333  7.000000000000001e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516902 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  31.08 
 
 		 1136 aa  333  7.000000000000001e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2375  B12-dependent methionine synthase  30.99 
 
 		 1235 aa  333  8e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1889  B12-dependent methionine synthase  31.59 
 
 		 1245 aa  332  2e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3320  B12-dependent methionine synthase  30.87 
 
 		 1235 aa  332  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.487541 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1700  methionine synthase  31.34 
 
 		 1171 aa  331  3e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0234  B12-dependent methionine synthase  30.92 
 
 		 1237 aa  331  4e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.545849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2154  B12-dependent methionine synthase  30.94 
 
 		 1228 aa  331  4e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.01 
 
 		 1208 aa  330  6e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  30.25 
 
 		 1208 aa  328  2.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  31.34 
 
 		 1224 aa  328  2.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  30.86 
 
 		 1158 aa  328  3e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1888  B12-dependent methionine synthase  30.63 
 
 		 1235 aa  328  3e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0650  B12-dependent methionine synthase  31.34 
 
 		 1250 aa  328  3e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3230  methionine synthase  30.36 
 
 		 1183 aa  328  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1545  B12-dependent methionine synthase  31.15 
 
 		 1237 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.396086  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4366  B12-dependent methionine synthase  31.36 
 
 		 1247 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.778137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3282  B12-dependent methionine synthase  29.36 
 
 		 1244 aa  328  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1101  B12-dependent methionine synthase  30.83 
 
 		 1230 aa  327  5e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875071  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2464  B12-dependent methionine synthase  30.51 
 
 		 1239 aa  326  9e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.782684  normal  0.0191622 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2732  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  30.41 
 
 		 1239 aa  326  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0346659  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1336  B12-dependent methionine synthase  31.18 
 
 		 1226 aa  326  1e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.262937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3184  B12-dependent methionine synthase  29.29 
 
 		 1244 aa  326  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40670  B12-dependent methionine synthase  31.24 
 
 		 1234 aa  326  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0754274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3690  B12-dependent methionine synthase  31.25 
 
 		 1220 aa  326  1e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1982  B12-dependent methionine synthase  30.52 
 
 		 1235 aa  326  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0368395  normal  0.238169 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0182  methionine synthase  29.77 
 
 		 1263 aa  325  2e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  31.16 
 
 		 1178 aa  325  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0838  B12-dependent methionine synthase  29.29 
 
 		 1244 aa  325  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3449  B12-dependent methionine synthase  31.05 
 
 		 1234 aa  325  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.625644  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1030  B12-dependent methionine synthase  29.17 
 
 		 1244 aa  325  3e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0222  B12-dependent methionine synthase  29.63 
 
 		 1227 aa  324  4e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1073  methionine synthase (B12-dependent)  30.26 
 
 		 1197 aa  324  4e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>