More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1101 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03891  B12-dependent methionine synthase  68.11 
 
 		 1227 aa  1734    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3978  methionine synthase  67.94 
 
 		 1227 aa  1729    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2375  B12-dependent methionine synthase  63.53 
 
 		 1235 aa  1611    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1545  B12-dependent methionine synthase  64.5 
 
 		 1237 aa  1658    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.396086  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0294  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  60.47 
 
 		 905 aa  1090    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0433  methionine synthase  60.44 
 
 		 905 aa  1108    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0790009  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.79 
 
 		 1132 aa  752    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1101  B12-dependent methionine synthase  100 
 
 		 1230 aa  2545    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875071  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0188  B12-dependent methionine synthase  60.28 
 
 		 1261 aa  1494    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1030  B12-dependent methionine synthase  64.92 
 
 		 1244 aa  1672    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2732  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  63.09 
 
 		 1239 aa  1610    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0346659  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.96 
 
 		 1132 aa  744    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.04 
 
 		 1133 aa  745    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  38.04 
 
 		 1133 aa  747    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2464  B12-dependent methionine synthase  62.89 
 
 		 1239 aa  1598    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.782684  normal  0.0191622 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0403  B12-dependent methionine synthase  61.73 
 
 		 1271 aa  1533    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0459446  hitchhiker  0.000026899 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0046  B12-dependent methionine synthase  62.76 
 
 		 1220 aa  1534    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.61869 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2159  B12-dependent methionine synthase  65.43 
 
 		 1236 aa  1666    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.088857 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0710  B12-dependent methionine synthase  65.3 
 
 		 1240 aa  1651    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0413  methionine synthase  60.56 
 
 		 905 aa  1110    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0119  methionine synthase (B12-dependent)  60.46 
 
 		 915 aa  1083    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0234  B12-dependent methionine synthase  64.54 
 
 		 1237 aa  1620    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.545849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0283  B12-dependent methionine synthase  58.55 
 
 		 1290 aa  1485    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.383841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2399  methionine synthase (B12-dependent)  58.37 
 
 		 902 aa  1015    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.561826 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0594  methionine synthase  60.56 
 
 		 905 aa  1110    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52198  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2997  methionine synthase  59.82 
 
 		 908 aa  1062    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.199846 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1206  B12-dependent methionine synthase  65.66 
 
 		 1232 aa  1688    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3107  B12-dependent methionine synthase  64.16 
 
 		 1236 aa  1606    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3346  methionine synthase (B12-dependent)  60.16 
 
 		 908 aa  1067    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0117  methionine synthase  58.86 
 
 		 939 aa  1087    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0603491 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3053  B12-dependent methionine synthase  59.61 
 
 		 1251 aa  1499    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.453999 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6260  methionine synthase (B12-dependent)  60.8 
 
 		 901 aa  1094    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0315  B12-dependent methionine synthase  57.63 
 
 		 1225 aa  1469    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7061  B12-dependent methionine synthase  60.23 
 
 		 1287 aa  1493    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1692  B12-dependent methionine synthase  56.36 
 
 		 1224 aa  1422    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0595  B12-dependent methionine synthase  59.85 
 
 		 1272 aa  1503    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0172  B12-dependent methionine synthase  62.52 
 
 		 1239 aa  1619    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.432955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.96 
 
 		 1132 aa  744    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3219  methionine synthase  60.56 
 
 		 905 aa  1110    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2965  B12-dependent methionine synthase  65.4 
 
 		 1244 aa  1673    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3320  B12-dependent methionine synthase  63.61 
 
 		 1235 aa  1612    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.487541 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0045  B12-dependent methionine synthase  60.64 
 
 		 1267 aa  1556    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3658  hypothetical protein  60.56 
 
 		 900 aa  1054    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0544622 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0357  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  60.89 
 
 		 905 aa  1090    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.569337  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1979  methionine synthase  60.24 
 
 		 916 aa  1074    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2808  B12-dependent methionine synthase  69.62 
 
 		 1226 aa  1785    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0112  B12-dependent methionine synthase  52.44 
 
 		 1259 aa  1247    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.937971  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1764  B12-dependent methionine synthase  58.95 
 
 		 1304 aa  1484    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.075059  normal  0.0106397 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3206  methionine synthase (B12-dependent)  57.14 
 
 		 878 aa  988    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.336651  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0147  methionine synthase (B12-dependent)  60.18 
 
 		 912 aa  1070    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.287887  normal  0.989958 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0466  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  55.24 
 
 		 965 aa  1028    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2010  B12-dependent methionine synthase  64.07 
 
 		 1233 aa  1603    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3735  B12-dependent methionine synthase  57.26 
 
 		 1286 aa  1452    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.391435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2509  B12-dependent methionine synthase  58.48 
 
 		 1262 aa  1486    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0250  methionine synthase  60.56 
 
 		 905 aa  1110    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.344603  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0174  methionine synthase (B12-dependent)  57.59 
 
 		 944 aa  1055    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.106933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1344  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  60.56 
 
 		 905 aa  1110    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.471509  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4243  methionine synthase (B12-dependent)  60.38 
 
 		 905 aa  1083    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16214 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1115  B12-dependent methionine synthase  64.59 
 
 		 1241 aa  1674    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3541  B12-dependent methionine synthase  59.33 
 
 		 1293 aa  1466    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0988023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1889  B12-dependent methionine synthase  63.89 
 
 		 1245 aa  1650    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0363  B12-dependent methionine synthase  59.05 
 
 		 1261 aa  1462    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0449  B12-dependent methionine synthase  61.23 
 
 		 1271 aa  1529    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3368  B12-dependent methionine synthase  65.1 
 
 		 1233 aa  1658    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0088  methionine synthase (B12-dependent)  60.68 
 
 		 915 aa  1110    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.3983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1848  methionine synthase (B12-dependent)  58.05 
 
 		 909 aa  1071    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1336  B12-dependent methionine synthase  57.28 
 
 		 1226 aa  1366    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.262937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0168  methionine synthase (B12-dependent)  59.19 
 
 		 923 aa  1071    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.616802 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3618  methionine synthase (B12-dependent)  60.38 
 
 		 913 aa  1093    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.279732  hitchhiker  0.0036931 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0037  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  57.7 
 
 		 873 aa  989    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0357424  normal  0.645269 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2154  B12-dependent methionine synthase  60.49 
 
 		 1228 aa  1521    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2303  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  61.02 
 
 		 905 aa  1121    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3149  B12-dependent methionine synthase  60.67 
 
 		 1220 aa  1523    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3138  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0328  B12-dependent methionine synthase  60.56 
 
 		 1264 aa  1504    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0014  methionine synthase  57.77 
 
 		 911 aa  1029    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0698387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1434  methionine synthase (B12-dependent)  59.21 
 
 		 897 aa  1061    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.162327 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1510  methionine synthase  58.92 
 
 		 891 aa  1058    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0838  B12-dependent methionine synthase  65.65 
 
 		 1244 aa  1690    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3184  B12-dependent methionine synthase  65.81 
 
 		 1244 aa  1692    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2132  B12-dependent methionine synthase  63.12 
 
 		 1245 aa  1630    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638146 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0872  B12-dependent methionine synthase  65.16 
 
 		 1238 aa  1686    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2436  methionine synthase  59.41 
 
 		 885 aa  1046    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0619597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0214  methionine synthase (B12-dependent)  58.98 
 
 		 907 aa  1066    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0222  B12-dependent methionine synthase  67.29 
 
 		 1227 aa  1727    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2966  methionine synthase  61.02 
 
 		 905 aa  1095    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40670  B12-dependent methionine synthase  64.28 
 
 		 1234 aa  1627    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0754274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3161  B12-dependent methionine synthase  60.59 
 
 		 1264 aa  1524    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.95608 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45056  B12 dependent methionine synthase  52.35 
 
 		 1252 aa  1315    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00353368  normal  0.902557 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2917  methionine synthase  61.02 
 
 		 905 aa  1121    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.978169  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3690  B12-dependent methionine synthase  57.01 
 
 		 1220 aa  1411    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3282  B12-dependent methionine synthase  65.65 
 
 		 1244 aa  1695    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0182  B12-dependent methionine synthase  60.28 
 
 		 1261 aa  1494    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2102  B12-dependent methionine synthase  57 
 
 		 1249 aa  1466    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.876734  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1935  B12-dependent methionine synthase  59.67 
 
 		 1250 aa  1452    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.688432  normal  0.0193285 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2631  B12-dependent methionine synthase  59.63 
 
 		 1244 aa  1519    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0960245  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0758  B12-dependent methionine synthase  66.45 
 
 		 1246 aa  1685    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.659122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3211  B12-dependent methionine synthase  60.59 
 
 		 1264 aa  1524    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.509178 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0113  B12-dependent methionine synthase  69.89 
 
 		 1227 aa  1782    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.352445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3474  B12-dependent methionine synthase  60.52 
 
 		 1251 aa  1538    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1526  B12-dependent methionine synthase  62.65 
 
 		 1232 aa  1590    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>