More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0859 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  43.88 
 
 		 804 aa  673    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  59.39 
 
 		 818 aa  907    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  59.78 
 
 		 841 aa  893    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  59.2 
 
 		 803 aa  902    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  100 
 
 		 804 aa  1613    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  54.37 
 
 		 802 aa  800    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  57.82 
 
 		 804 aa  856    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  44.24 
 
 		 801 aa  630  1e-179  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  44.39 
 
 		 800 aa  627  1e-178  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  43.12 
 
 		 804 aa  622  1e-177  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  44.25 
 
 		 804 aa  617  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  44.65 
 
 		 806 aa  614  9.999999999999999e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  44.55 
 
 		 804 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  40.64 
 
 		 839 aa  589  1e-167  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  41.98 
 
 		 813 aa  588  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  41.18 
 
 		 801 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  40.08 
 
 		 807 aa  570  1e-161  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  41.79 
 
 		 811 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  37.75 
 
 		 841 aa  561  1e-158  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23490  methionine synthase (B12-dependent)  40.05 
 
 		 820 aa  555  1e-156  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.136684  hitchhiker  0.0000158862 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  37.75 
 
 		 819 aa  545  1e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  38.14 
 
 		 791 aa  538  1e-151  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  39.18 
 
 		 816 aa  475  1e-132  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  35.72 
 
 		 768 aa  436  1e-121  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  33.46 
 
 		 780 aa  434  1e-120  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  35.48 
 
 		 768 aa  434  1e-120  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0729  homocysteine S-methyltransferase  33.21 
 
 		 781 aa  429  1e-119  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  32.79 
 
 		 774 aa  419  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  32.47 
 
 		 793 aa  393  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  33.13 
 
 		 1191 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  34.01 
 
 		 1189 aa  386  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  33.02 
 
 		 1215 aa  389  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  34.45 
 
 		 1180 aa  388  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3230  methionine synthase  33.02 
 
 		 1183 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  33.13 
 
 		 1191 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  32.56 
 
 		 1223 aa  379  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  30.97 
 
 		 1132 aa  374  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  32.82 
 
 		 1178 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  33.61 
 
 		 1224 aa  375  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  33.89 
 
 		 1168 aa  374  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  31.88 
 
 		 1132 aa  375  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  30.97 
 
 		 1132 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.21 
 
 		 1132 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  34.08 
 
 		 1136 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.21 
 
 		 1132 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.21 
 
 		 1133 aa  371  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  33.21 
 
 		 1208 aa  370  1e-101  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.21 
 
 		 1132 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0923  putative methionine synthase  30.1 
 
 		 1188 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1372  methionine synthase (B12-dependent)  32.85 
 
 		 1190 aa  370  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.477278 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1336  B12-dependent methionine synthase  34.7 
 
 		 1226 aa  372  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.262937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  31.79 
 
 		 1132 aa  372  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1700  methionine synthase  34.52 
 
 		 1171 aa  369  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.13 
 
 		 1132 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0092  methionine synthase  34.39 
 
 		 1150 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  31.02 
 
 		 1132 aa  366  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.22 
 
 		 1133 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  32.75 
 
 		 1158 aa  369  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  34.63 
 
 		 1150 aa  369  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0064  methionine synthase  33.22 
 
 		 1254 aa  369  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496444 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1073  methionine synthase (B12-dependent)  32.37 
 
 		 1197 aa  367  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09841  putative methionine synthase  30.09 
 
 		 1188 aa  369  1e-100  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0102  methionine synthase  34.39 
 
 		 1150 aa  366  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0087  methionine synthase  34.31 
 
 		 1149 aa  366  1e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.834345  normal  0.210518 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  32.28 
 
 		 1196 aa  365  2e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3878  methionine synthase  33.37 
 
 		 1208 aa  364  4e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00387489  normal  0.106452 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  33.17 
 
 		 1178 aa  363  9e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  33.22 
 
 		 1136 aa  363  9e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  32.79 
 
 		 1158 aa  363  9e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09821  putative methionine synthase  29.75 
 
 		 1188 aa  360  4e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4401  B12-dependent methionine synthase  31.01 
 
 		 1227 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.90979  normal  0.334358 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  30.79 
 
 		 1191 aa  358  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27020  methionine synthase (B12-dependent)  31.72 
 
 		 1184 aa  358  2.9999999999999997e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12372  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4526  B12-dependent methionine synthase  30.89 
 
 		 1227 aa  357  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.267598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3690  B12-dependent methionine synthase  32.4 
 
 		 1220 aa  356  8.999999999999999e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.66 
 
 		 1208 aa  356  1e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4523  B12-dependent methionine synthase  30.66 
 
 		 1227 aa  355  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.413038 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29240  B12-dependent methionine synthase  32.03 
 
 		 1278 aa  355  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4599  B12-dependent methionine synthase  30.66 
 
 		 1227 aa  355  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.972582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3503  methionine synthase  31.9 
 
 		 1212 aa  354  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.929135  normal  0.479801 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2154  B12-dependent methionine synthase  32.6 
 
 		 1228 aa  353  5e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5917  methionine synthase  32.08 
 
 		 1154 aa  353  7e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0712476  normal  0.0446229 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4435  B12-dependent methionine synthase  30.4 
 
 		 1227 aa  353  8e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14891  putative methionine synthase  31.71 
 
 		 1214 aa  353  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.123192 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1854  methionine synthase  32.36 
 
 		 1154 aa  352  2e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516902 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  32.31 
 
 		 1169 aa  352  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3320  B12-dependent methionine synthase  31.56 
 
 		 1235 aa  352  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.487541 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4472  B12-dependent methionine synthase  30.72 
 
 		 1227 aa  351  2e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.346478 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4255  B12-dependent methionine synthase  30.72 
 
 		 1227 aa  352  2e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0705471  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03891  B12-dependent methionine synthase  30.72 
 
 		 1227 aa  351  3e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03851  hypothetical protein  30.72 
 
 		 1227 aa  351  3e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4011  B12-dependent methionine synthase  30.72 
 
 		 1227 aa  351  3e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.960796  normal  0.0169283 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4563  B12-dependent methionine synthase  30.72 
 
 		 1227 aa  351  3e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3978  methionine synthase  30.72 
 
 		 1227 aa  350  4e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2375  B12-dependent methionine synthase  31.33 
 
 		 1235 aa  350  7e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5489  B12-dependent methionine synthase  30.61 
 
 		 1227 aa  350  7e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0222  B12-dependent methionine synthase  30.55 
 
 		 1227 aa  350  8e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12156  5-methyltetrahydrofolate-homocystein methyltransferase metH  31.44 
 
 		 1192 aa  348  2e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.726643 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4499  methionine synthase  32.62 
 
 		 1173 aa  348  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.629663  hitchhiker  0.00843884 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1982  B12-dependent methionine synthase  30.7 
 
 		 1235 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0368395  normal  0.238169 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>