More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1413 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  67.32 
 
 
811 aa  1047    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  71.7 
 
 
804 aa  1137    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  46.04 
 
 
801 aa  699    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  46.9 
 
 
800 aa  711    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  65.34 
 
 
801 aa  1025    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  73.07 
 
 
804 aa  1142    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  66.42 
 
 
813 aa  1051    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  42.87 
 
 
819 aa  639    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  45.36 
 
 
839 aa  696    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  100 
 
 
806 aa  1624    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  41.42 
 
 
807 aa  652    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  72.53 
 
 
804 aa  1177    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  40.67 
 
 
804 aa  628  1e-178  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  40.6 
 
 
791 aa  593  1e-168  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23490  methionine synthase (B12-dependent)  43.54 
 
 
820 aa  593  1e-168  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.136684  hitchhiker  0.0000158862 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  44.5 
 
 
804 aa  591  1e-167  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  44.12 
 
 
804 aa  579  1e-164  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  42.67 
 
 
818 aa  571  1e-161  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  42.22 
 
 
841 aa  566  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  37.77 
 
 
841 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  42.57 
 
 
803 aa  556  1e-157  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  40.84 
 
 
802 aa  546  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  40.7 
 
 
816 aa  520  1e-146  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  37.14 
 
 
768 aa  483  1e-135  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  36.89 
 
 
768 aa  482  1e-134  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  34.16 
 
 
793 aa  456  1e-127  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0729  homocysteine S-methyltransferase  34.29 
 
 
781 aa  456  1e-127  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  35.33 
 
 
1180 aa  449  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  32.84 
 
 
774 aa  449  1.0000000000000001e-124  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  33.91 
 
 
780 aa  447  1.0000000000000001e-124  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  34.47 
 
 
1196 aa  427  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3878  methionine synthase  35.57 
 
 
1208 aa  419  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00387489  normal  0.106452 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1854  methionine synthase  34.15 
 
 
1154 aa  415  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.516902 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  33.68 
 
 
1189 aa  412  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  34.39 
 
 
1150 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  33.89 
 
 
1132 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  33.89 
 
 
1132 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  33.89 
 
 
1133 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0064  methionine synthase  33.56 
 
 
1254 aa  409  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.496444 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  33.89 
 
 
1132 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  33.85 
 
 
1132 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  33.89 
 
 
1132 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  33.73 
 
 
1132 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  33.77 
 
 
1133 aa  404  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  33.77 
 
 
1132 aa  406  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0102  methionine synthase  34.47 
 
 
1150 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  35.12 
 
 
1208 aa  403  1e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  33.73 
 
 
1132 aa  403  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0092  methionine synthase  34.35 
 
 
1150 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0087  methionine synthase  34.85 
 
 
1149 aa  402  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.834345  normal  0.210518 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.9 
 
 
1132 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5917  methionine synthase  33.81 
 
 
1154 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0712476  normal  0.0446229 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  34.53 
 
 
1168 aa  394  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  33.45 
 
 
1136 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  33.14 
 
 
1215 aa  390  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5363  methionine synthase  32.56 
 
 
1169 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.816675 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  33.9 
 
 
1208 aa  388  1e-106  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  33.45 
 
 
1178 aa  386  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2325  methionine synthase  32.51 
 
 
1171 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0940297  hitchhiker  0.00240742 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12156  5-methyltetrahydrofolate-homocystein methyltransferase metH  32.98 
 
 
1192 aa  380  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.726643 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16010  methionine synthase (B12-dependent)  34.18 
 
 
1176 aa  381  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471767  normal  0.0779461 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  32.91 
 
 
1223 aa  382  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2292  methionine synthase  32.74 
 
 
1157 aa  382  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0622799  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  32.33 
 
 
1169 aa  382  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2171  methionine synthase  32.24 
 
 
1167 aa  382  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.657352  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  33.02 
 
 
1158 aa  379  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1531  methionine synthase (B12-dependent)  35.4 
 
 
1182 aa  376  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1940  methionine synthase  32.64 
 
 
1193 aa  378  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.092673  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14891  putative methionine synthase  33.14 
 
 
1214 aa  378  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.123192 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  32.36 
 
 
1158 aa  377  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  32.16 
 
 
1136 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2445  methionine synthase  32.48 
 
 
1199 aa  371  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.795669  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  33.25 
 
 
1191 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  33.25 
 
 
1191 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.64 
 
 
1163 aa  371  1e-101  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  32.95 
 
 
1224 aa  369  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3230  methionine synthase  32.98 
 
 
1183 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1700  methionine synthase  34.78 
 
 
1171 aa  367  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27020  methionine synthase (B12-dependent)  31.46 
 
 
1184 aa  369  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12372  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1549  methionine synthase  31.99 
 
 
1156 aa  365  1e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.217391 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0333  putative methionine synthase  30.6 
 
 
1182 aa  363  5.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4499  methionine synthase  31.38 
 
 
1173 aa  362  2e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.629663  hitchhiker  0.00843884 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  32.83 
 
 
1176 aa  360  6e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1073  methionine synthase (B12-dependent)  32.44 
 
 
1197 aa  360  6e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3627  methionine synthase (B12-dependent)  32.77 
 
 
1216 aa  360  8e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3349  methionine synthase  32.88 
 
 
1214 aa  359  9.999999999999999e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  31.1 
 
 
1191 aa  359  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1418  methionine synthase  31.86 
 
 
1181 aa  358  1.9999999999999998e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.156555  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  33.84 
 
 
1236 aa  358  2.9999999999999997e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0606  B12-dependent methionine synthase  32.65 
 
 
1232 aa  357  6.999999999999999e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10061  putative methionine synthase  30.25 
 
 
1182 aa  356  7.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0164665 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1336  B12-dependent methionine synthase  33.75 
 
 
1226 aa  355  1e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.262937  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1372  methionine synthase (B12-dependent)  33.26 
 
 
1190 aa  354  4e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.477278 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  32.56 
 
 
1178 aa  352  1e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3690  B12-dependent methionine synthase  31.7 
 
 
1220 aa  350  7e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0046  B12-dependent methionine synthase  31.84 
 
 
1220 aa  349  1e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.61869 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4250  methionine synthase  33.1 
 
 
1261 aa  349  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.49174  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0182  methionine synthase  30.96 
 
 
1263 aa  348  2e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1123  B12-dependent methionine synthase  32.2 
 
 
1246 aa  348  3e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.833597 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2154  B12-dependent methionine synthase  32.35 
 
 
1228 aa  347  6e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>