More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0262 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  68.63 
 
 		 804 aa  1072    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  100 
 
 		 813 aa  1626    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  61.6 
 
 		 801 aa  962    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  48.89 
 
 		 800 aa  735    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  67.32 
 
 		 804 aa  1036    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  72.04 
 
 		 804 aa  1156    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  96.18 
 
 		 811 aa  1504    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  43.88 
 
 		 839 aa  643    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  66.75 
 
 		 806 aa  1043    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  45.94 
 
 		 801 aa  700    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  41.77 
 
 		 807 aa  634  1e-180  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  41.08 
 
 		 804 aa  622  1e-176  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  40.85 
 
 		 819 aa  613  9.999999999999999e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  43.22 
 
 		 818 aa  581  1e-164  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  41.98 
 
 		 804 aa  570  1e-161  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23490  methionine synthase (B12-dependent)  43.07 
 
 		 820 aa  568  1e-161  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.136684  hitchhiker  0.0000158862 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  41.8 
 
 		 803 aa  565  1e-160  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  40.27 
 
 		 802 aa  557  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  38.92 
 
 		 791 aa  551  1e-155  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  38.41 
 
 		 841 aa  545  1e-154  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  40.48 
 
 		 841 aa  543  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  41.33 
 
 		 804 aa  544  1e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  39.41 
 
 		 816 aa  503  1e-141  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  35.9 
 
 		 768 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  36.02 
 
 		 768 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0729  homocysteine S-methyltransferase  32.35 
 
 		 781 aa  463  1e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  33.66 
 
 		 780 aa  455  1.0000000000000001e-126  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  33.5 
 
 		 793 aa  440  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  32.39 
 
 		 774 aa  429  1e-118  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  33.18 
 
 		 1163 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  33.76 
 
 		 1189 aa  403  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1854  methionine synthase  33.68 
 
 		 1154 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516902 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  32.95 
 
 		 1180 aa  401  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  33.14 
 
 		 1158 aa  393  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  33.68 
 
 		 1150 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  33.14 
 
 		 1196 aa  390  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2292  methionine synthase  33.29 
 
 		 1157 aa  390  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0622799  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3878  methionine synthase  33.18 
 
 		 1208 aa  386  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00387489  normal  0.106452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5363  methionine synthase  33.22 
 
 		 1169 aa  389  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.816675 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0092  methionine synthase  33.57 
 
 		 1150 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2325  methionine synthase  32.91 
 
 		 1171 aa  389  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0940297  hitchhiker  0.00240742 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0102  methionine synthase  33.68 
 
 		 1150 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.42 
 
 		 1132 aa  383  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  32.27 
 
 		 1223 aa  383  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.54 
 
 		 1133 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.43 
 
 		 1133 aa  384  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3349  methionine synthase  33.37 
 
 		 1214 aa  385  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  32.52 
 
 		 1178 aa  385  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.46 
 
 		 1132 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  33.33 
 
 		 1168 aa  384  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  32.42 
 
 		 1132 aa  384  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  33.18 
 
 		 1158 aa  384  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.74 
 
 		 1132 aa  385  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.42 
 
 		 1132 aa  382  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2171  methionine synthase  32.63 
 
 		 1167 aa  380  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.657352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3230  methionine synthase  33.26 
 
 		 1183 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.42 
 
 		 1132 aa  382  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  32.35 
 
 		 1132 aa  381  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.42 
 
 		 1132 aa  382  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1940  methionine synthase  33.45 
 
 		 1193 aa  381  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.092673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5917  methionine synthase  31.66 
 
 		 1154 aa  379  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0712476  normal  0.0446229 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  32.11 
 
 		 1136 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27020  methionine synthase (B12-dependent)  32.51 
 
 		 1184 aa  377  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12372  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0087  methionine synthase  33.1 
 
 		 1149 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.834345  normal  0.210518 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0064  methionine synthase  32.51 
 
 		 1254 aa  377  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496444 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  32.11 
 
 		 1132 aa  375  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  32.43 
 
 		 1169 aa  373  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3627  methionine synthase (B12-dependent)  33.22 
 
 		 1216 aa  373  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1488  methionine synthase  31.3 
 
 		 1156 aa  370  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.128181  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2445  methionine synthase  32.06 
 
 		 1199 aa  372  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.795669  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  32.02 
 
 		 1215 aa  372  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  31.92 
 
 		 1136 aa  369  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1073  methionine synthase (B12-dependent)  33.45 
 
 		 1197 aa  367  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1700  methionine synthase  33.1 
 
 		 1171 aa  368  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.46 
 
 		 1208 aa  365  2e-99  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  32.75 
 
 		 1191 aa  365  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  32.75 
 
 		 1191 aa  365  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12156  5-methyltetrahydrofolate-homocystein methyltransferase metH  32.71 
 
 		 1192 aa  363  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.726643 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  33.84 
 
 		 1178 aa  362  2e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  32.35 
 
 		 1208 aa  362  2e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2159  B12-dependent methionine synthase  32.28 
 
 		 1236 aa  360  4e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.088857 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  32.86 
 
 		 1176 aa  360  5e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1549  methionine synthase  30.93 
 
 		 1156 aa  359  9e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.217391 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1531  methionine synthase (B12-dependent)  33.93 
 
 		 1182 aa  359  9.999999999999999e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0333  putative methionine synthase  31.07 
 
 		 1182 aa  357  5e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4499  methionine synthase  31.32 
 
 		 1173 aa  357  5.999999999999999e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.629663  hitchhiker  0.00843884 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  31.69 
 
 		 1191 aa  357  6.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3320  B12-dependent methionine synthase  31.94 
 
 		 1235 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.487541 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1888  B12-dependent methionine synthase  32.06 
 
 		 1235 aa  356  1e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10061  putative methionine synthase  31.07 
 
 		 1182 aa  355  2e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0164665 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29240  B12-dependent methionine synthase  32.28 
 
 		 1278 aa  355  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14891  putative methionine synthase  32.62 
 
 		 1214 aa  354  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.123192 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1982  B12-dependent methionine synthase  31.83 
 
 		 1235 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0368395  normal  0.238169 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2375  B12-dependent methionine synthase  31.83 
 
 		 1235 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16010  methionine synthase (B12-dependent)  32.91 
 
 		 1176 aa  352  2e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471767  normal  0.0779461 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3107  B12-dependent methionine synthase  31.72 
 
 		 1236 aa  352  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  33.06 
 
 		 1236 aa  352  2e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1372  methionine synthase (B12-dependent)  32.41 
 
 		 1190 aa  352  2e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.477278 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2804  methionine synthase  33.14 
 
 		 1274 aa  351  3e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.294328 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3503  methionine synthase  32.14 
 
 		 1212 aa  348  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.929135  normal  0.479801 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>