More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1548 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  66.25 
 
 		 802 aa  1012    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  68.66 
 
 		 841 aa  1060    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  45.8 
 
 		 804 aa  675    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  57.94 
 
 		 804 aa  853    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  57.99 
 
 		 803 aa  882    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  75.21 
 
 		 818 aa  1180    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  100 
 
 		 804 aa  1598    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  45.39 
 
 		 801 aa  609  1e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  43.8 
 
 		 800 aa  610  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  44.36 
 
 		 806 aa  598  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  40.15 
 
 		 807 aa  592  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  42.89 
 
 		 804 aa  592  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  39.76 
 
 		 841 aa  586  1e-166  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  44.95 
 
 		 804 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  44.57 
 
 		 804 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  41.05 
 
 		 801 aa  566  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  41.21 
 
 		 813 aa  551  1e-155  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  39.69 
 
 		 839 aa  545  1e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  41.67 
 
 		 811 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  37.56 
 
 		 791 aa  524  1e-147  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23490  methionine synthase (B12-dependent)  40.35 
 
 		 820 aa  525  1e-147  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.136684  hitchhiker  0.0000158862 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  37.68 
 
 		 819 aa  520  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  39.6 
 
 		 816 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  32.96 
 
 		 774 aa  434  1e-120  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  35.27 
 
 		 768 aa  431  1e-119  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  35.73 
 
 		 768 aa  429  1e-119  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  33.5 
 
 		 780 aa  424  1e-117  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  35.11 
 
 		 1189 aa  399  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  32.56 
 
 		 793 aa  386  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0729  homocysteine S-methyltransferase  32.17 
 
 		 781 aa  386  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0102  methionine synthase  34.08 
 
 		 1150 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  34.59 
 
 		 1150 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0092  methionine synthase  34.08 
 
 		 1150 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0087  methionine synthase  34.12 
 
 		 1149 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.834345  normal  0.210518 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  32.56 
 
 		 1180 aa  372  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  34.07 
 
 		 1196 aa  368  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.55 
 
 		 1132 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  32.67 
 
 		 1132 aa  369  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  32.39 
 
 		 1132 aa  365  1e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  32.24 
 
 		 1224 aa  366  1e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.3 
 
 		 1132 aa  365  2e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.42 
 
 		 1133 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.42 
 
 		 1132 aa  363  6e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.42 
 
 		 1132 aa  363  8e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.42 
 
 		 1132 aa  363  8e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.42 
 
 		 1133 aa  362  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.93 
 
 		 1208 aa  362  2e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  32.84 
 
 		 1132 aa  361  2e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.62 
 
 		 1132 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3690  B12-dependent methionine synthase  33.22 
 
 		 1220 aa  358  2.9999999999999997e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0064  methionine synthase  32.61 
 
 		 1254 aa  357  5e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496444 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  31.57 
 
 		 1223 aa  356  1e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3878  methionine synthase  32.41 
 
 		 1208 aa  354  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00387489  normal  0.106452 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  33.49 
 
 		 1169 aa  353  7e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12156  5-methyltetrahydrofolate-homocystein methyltransferase metH  32.43 
 
 		 1192 aa  353  8e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.726643 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  33.02 
 
 		 1178 aa  353  8.999999999999999e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  32.98 
 
 		 1136 aa  352  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  31.54 
 
 		 1208 aa  351  3e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  33.14 
 
 		 1158 aa  351  4e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4499  methionine synthase  32.98 
 
 		 1173 aa  350  8e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.629663  hitchhiker  0.00843884 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  32.62 
 
 		 1136 aa  347  7e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1336  B12-dependent methionine synthase  33.89 
 
 		 1226 aa  347  7e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.262937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  31.81 
 
 		 1158 aa  345  2e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  33.33 
 
 		 1168 aa  344  5e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14891  putative methionine synthase  30.39 
 
 		 1214 aa  343  5e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.123192 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0923  putative methionine synthase  29.57 
 
 		 1188 aa  342  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1940  methionine synthase  33.45 
 
 		 1193 aa  341  4e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.092673  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2445  methionine synthase  33.77 
 
 		 1199 aa  340  5e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.795669  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2132  B12-dependent methionine synthase  33.07 
 
 		 1245 aa  340  5.9999999999999996e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638146 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  30.88 
 
 		 1215 aa  340  9e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09591  putative methionine synthase  29.26 
 
 		 1187 aa  339  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  31.19 
 
 		 1191 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1854  methionine synthase  31.89 
 
 		 1154 aa  337  5e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516902 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  31.19 
 
 		 1191 aa  336  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3230  methionine synthase  30.2 
 
 		 1183 aa  335  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2093  B12-dependent methionine synthase  31.14 
 
 		 1227 aa  333  5e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.883808 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2325  methionine synthase  32.78 
 
 		 1171 aa  333  7.000000000000001e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0940297  hitchhiker  0.00240742 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09841  putative methionine synthase  29.29 
 
 		 1188 aa  332  1e-89  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0315  B12-dependent methionine synthase  30.97 
 
 		 1225 aa  332  2e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170465 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1418  methionine synthase  33.1 
 
 		 1181 aa  330  4e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.156555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3503  methionine synthase  31.1 
 
 		 1212 aa  330  6e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.929135  normal  0.479801 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27020  methionine synthase (B12-dependent)  31.13 
 
 		 1184 aa  329  1.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12372  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16010  methionine synthase (B12-dependent)  33.65 
 
 		 1176 aa  329  1.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471767  normal  0.0779461 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09821  putative methionine synthase  29.43 
 
 		 1188 aa  328  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2171  methionine synthase  32.31 
 
 		 1167 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.657352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2804  methionine synthase  31.24 
 
 		 1274 aa  328  3e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.294328 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4366  B12-dependent methionine synthase  31.26 
 
 		 1247 aa  328  3e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.778137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5363  methionine synthase  32.13 
 
 		 1169 aa  328  3e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.816675 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  29.3 
 
 		 1191 aa  328  3e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1073  methionine synthase (B12-dependent)  30.32 
 
 		 1197 aa  327  4.0000000000000003e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0657  methionine synthase  31.8 
 
 		 1238 aa  327  5e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2102  B12-dependent methionine synthase  30.88 
 
 		 1249 aa  327  7e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.876734  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2010  B12-dependent methionine synthase  31.99 
 
 		 1233 aa  326  8.000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1889  B12-dependent methionine synthase  31.28 
 
 		 1245 aa  325  1e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1935  B12-dependent methionine synthase  31.38 
 
 		 1250 aa  326  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.688432  normal  0.0193285 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2965  B12-dependent methionine synthase  31.29 
 
 		 1244 aa  325  2e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29240  B12-dependent methionine synthase  32.16 
 
 		 1278 aa  325  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5917  methionine synthase  30.93 
 
 		 1154 aa  325  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0712476  normal  0.0446229 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1700  methionine synthase  32.27 
 
 		 1171 aa  324  3e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1206  B12-dependent methionine synthase  31.88 
 
 		 1232 aa  324  4e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>