More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0645 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  40.97 
 
 
804 aa  644    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  44.82 
 
 
801 aa  696    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  44 
 
 
804 aa  639    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  45.4 
 
 
791 aa  662    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  100 
 
 
804 aa  1626    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  41.03 
 
 
801 aa  654    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  44.51 
 
 
818 aa  659    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  44.02 
 
 
841 aa  660    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  44.51 
 
 
807 aa  706    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  49.47 
 
 
841 aa  818    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  42.74 
 
 
839 aa  669    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  46.07 
 
 
800 aa  716    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  45.55 
 
 
804 aa  650    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  42.36 
 
 
804 aa  641    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  41.48 
 
 
804 aa  630  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  43.32 
 
 
802 aa  629  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  43.63 
 
 
803 aa  627  1e-178  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  40.67 
 
 
806 aa  610  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  40.96 
 
 
813 aa  610  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  41.03 
 
 
819 aa  608  9.999999999999999e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  41.11 
 
 
811 aa  599  1e-170  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23490  methionine synthase (B12-dependent)  39.32 
 
 
820 aa  579  1e-164  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.136684  hitchhiker  0.0000158862 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  39.65 
 
 
768 aa  550  1e-155  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  39.53 
 
 
768 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0729  homocysteine S-methyltransferase  37.31 
 
 
781 aa  509  1e-143  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  35.92 
 
 
816 aa  496  1e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  36.8 
 
 
774 aa  496  1e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  36.87 
 
 
780 aa  495  9.999999999999999e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  36.03 
 
 
793 aa  483  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  35.74 
 
 
1196 aa  463  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3878  methionine synthase  34.27 
 
 
1208 aa  442  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00387489  normal  0.106452 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0064  methionine synthase  34.06 
 
 
1254 aa  441  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.496444 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  34.8 
 
 
1189 aa  432  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  34.37 
 
 
1180 aa  427  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  34.43 
 
 
1150 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0087  methionine synthase  34.72 
 
 
1149 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.834345  normal  0.210518 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0092  methionine synthase  34.5 
 
 
1150 aa  412  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0102  methionine synthase  34.62 
 
 
1150 aa  412  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  33.22 
 
 
1169 aa  405  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  31.93 
 
 
1168 aa  404  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1700  methionine synthase  32.28 
 
 
1171 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  32.4 
 
 
1158 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.25 
 
 
1132 aa  397  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.37 
 
 
1132 aa  398  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0333  putative methionine synthase  31.05 
 
 
1182 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  32.34 
 
 
1132 aa  397  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10061  putative methionine synthase  31.17 
 
 
1182 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0164665 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1854  methionine synthase  30.16 
 
 
1154 aa  397  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.516902 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  30.61 
 
 
1178 aa  396  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  31.98 
 
 
1215 aa  397  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.25 
 
 
1132 aa  398  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.13 
 
 
1132 aa  396  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.13 
 
 
1133 aa  394  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.13 
 
 
1133 aa  396  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.13 
 
 
1132 aa  396  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.13 
 
 
1132 aa  396  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  31.71 
 
 
1223 aa  394  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27020  methionine synthase (B12-dependent)  30.4 
 
 
1184 aa  392  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12372  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  31.98 
 
 
1132 aa  391  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  30.53 
 
 
1158 aa  384  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  31.34 
 
 
1191 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  31.34 
 
 
1191 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  31.14 
 
 
1132 aa  383  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2965  B12-dependent methionine synthase  32.34 
 
 
1244 aa  380  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  30.54 
 
 
1208 aa  380  1e-104  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0923  putative methionine synthase  31.5 
 
 
1188 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  33.02 
 
 
1136 aa  382  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  30.11 
 
 
1191 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0723  methionine synthase  30.9 
 
 
1151 aa  382  1e-104  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.830371  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4499  methionine synthase  30.41 
 
 
1173 aa  379  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.629663  hitchhiker  0.00843884 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09841  putative methionine synthase  30.83 
 
 
1188 aa  376  1e-103  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0973  B12-dependent methionine synthase  32.11 
 
 
1244 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0838  B12-dependent methionine synthase  32.46 
 
 
1244 aa  378  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3184  B12-dependent methionine synthase  32.35 
 
 
1244 aa  378  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3282  B12-dependent methionine synthase  32.23 
 
 
1244 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0995  B12-dependent methionine synthase  32.11 
 
 
1244 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0391552  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1007  B12-dependent methionine synthase  32 
 
 
1244 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3368  B12-dependent methionine synthase  32.11 
 
 
1233 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3230  methionine synthase  31.46 
 
 
1183 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1488  methionine synthase  31.3 
 
 
1156 aa  374  1e-102  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.128181  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1030  B12-dependent methionine synthase  32.27 
 
 
1244 aa  375  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  30.61 
 
 
1176 aa  373  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.86 
 
 
1208 aa  373  1e-102  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09591  putative methionine synthase  31 
 
 
1187 aa  375  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1531  methionine synthase (B12-dependent)  32.71 
 
 
1182 aa  375  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2171  methionine synthase  29.33 
 
 
1167 aa  373  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.657352  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2154  B12-dependent methionine synthase  31.6 
 
 
1228 aa  373  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12156  5-methyltetrahydrofolate-homocystein methyltransferase metH  29.79 
 
 
1192 aa  374  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.726643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5917  methionine synthase  28.94 
 
 
1154 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0712476  normal  0.0446229 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2375  B12-dependent methionine synthase  31.9 
 
 
1235 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2325  methionine synthase  28.54 
 
 
1171 aa  370  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0940297  hitchhiker  0.00240742 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  30.99 
 
 
1163 aa  370  1e-101  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  31.9 
 
 
1136 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1073  methionine synthase (B12-dependent)  30.82 
 
 
1197 aa  372  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  30.23 
 
 
1224 aa  370  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3320  B12-dependent methionine synthase  31.9 
 
 
1235 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.487541 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2445  methionine synthase  30.24 
 
 
1199 aa  369  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.795669  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3384  B12-dependent methionine synthase  33.13 
 
 
1210 aa  367  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.73359  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  31.3 
 
 
1178 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1888  B12-dependent methionine synthase  31.09 
 
 
1235 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>