More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0680 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  49.67 
 
 		 774 aa  739    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0729  homocysteine S-methyltransferase  46.57 
 
 		 781 aa  691    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  97.14 
 
 		 768 aa  1479    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  45.1 
 
 		 780 aa  640    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  100 
 
 		 768 aa  1541    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  41.38 
 
 		 807 aa  569  1e-161  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  39.65 
 
 		 804 aa  550  1e-155  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  40.31 
 
 		 793 aa  537  1e-151  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  38.05 
 
 		 804 aa  509  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  37.62 
 
 		 800 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  37.61 
 
 		 791 aa  497  1e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  36.57 
 
 		 801 aa  489  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  35.08 
 
 		 804 aa  486  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  36.39 
 
 		 801 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23490  methionine synthase (B12-dependent)  35.75 
 
 		 820 aa  477  1e-133  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.136684  hitchhiker  0.0000158862 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  36.18 
 
 		 804 aa  473  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  36.89 
 
 		 806 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  35.48 
 
 		 813 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  36.35 
 
 		 811 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  34.94 
 
 		 839 aa  460  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  35.5 
 
 		 819 aa  456  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  32.86 
 
 		 841 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  34.72 
 
 		 841 aa  429  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  35.76 
 
 		 818 aa  431  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  34.32 
 
 		 816 aa  427  1e-118  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  36.08 
 
 		 802 aa  425  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  34.99 
 
 		 803 aa  415  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  34.94 
 
 		 804 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  35.48 
 
 		 804 aa  395  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  31.09 
 
 		 1215 aa  373  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  31.66 
 
 		 1223 aa  368  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0087  methionine synthase  32.66 
 
 		 1149 aa  361  2e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.834345  normal  0.210518 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  32.43 
 
 		 1150 aa  360  4e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0102  methionine synthase  32.07 
 
 		 1150 aa  356  6.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0092  methionine synthase  32.07 
 
 		 1150 aa  356  1e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  30.37 
 
 		 1196 aa  348  2e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  30.3 
 
 		 1180 aa  348  3e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  28.08 
 
 		 1163 aa  337  5.999999999999999e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0923  putative methionine synthase  29.85 
 
 		 1188 aa  332  1e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  28.74 
 
 		 1168 aa  330  6e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10061  putative methionine synthase  29.95 
 
 		 1182 aa  330  6e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0164665 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09841  putative methionine synthase  29.78 
 
 		 1188 aa  330  8e-89  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0333  putative methionine synthase  29.65 
 
 		 1182 aa  327  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27020  methionine synthase (B12-dependent)  29.82 
 
 		 1184 aa  322  9.999999999999999e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12372  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1700  methionine synthase  30.84 
 
 		 1171 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  28.81 
 
 		 1158 aa  320  5e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  28.67 
 
 		 1158 aa  320  6e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  30.2 
 
 		 1191 aa  319  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  30.12 
 
 		 1191 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  29.43 
 
 		 1178 aa  317  4e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12156  5-methyltetrahydrofolate-homocystein methyltransferase metH  29.04 
 
 		 1192 aa  317  4e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.726643 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.38 
 
 		 1132 aa  317  7e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3230  methionine synthase  29.87 
 
 		 1183 aa  316  9e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2292  methionine synthase  27.98 
 
 		 1157 aa  316  9.999999999999999e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0622799  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  29.14 
 
 		 1191 aa  316  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  30.33 
 
 		 1189 aa  315  1.9999999999999998e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  30.07 
 
 		 1133 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  30.07 
 
 		 1132 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  30.07 
 
 		 1132 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  30.07 
 
 		 1132 aa  313  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1488  methionine synthase  28.28 
 
 		 1156 aa  313  1e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.128181  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.95 
 
 		 1132 aa  312  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09591  putative methionine synthase  28.16 
 
 		 1187 aa  313  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  30.07 
 
 		 1133 aa  311  2e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09821  putative methionine synthase  29.9 
 
 		 1188 aa  312  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1854  methionine synthase  28.57 
 
 		 1154 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516902 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  29.7 
 
 		 1176 aa  311  2.9999999999999997e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5917  methionine synthase  28.55 
 
 		 1154 aa  310  8e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0712476  normal  0.0446229 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  29.31 
 
 		 1132 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.71 
 
 		 1132 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  29.07 
 
 		 1132 aa  308  3e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0650  B12-dependent methionine synthase  28.95 
 
 		 1250 aa  307  5.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0606  B12-dependent methionine synthase  28.86 
 
 		 1232 aa  306  6e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  28.3 
 
 		 1132 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  28.91 
 
 		 1208 aa  306  1.0000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  29.46 
 
 		 1136 aa  305  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2093  B12-dependent methionine synthase  29.33 
 
 		 1227 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.883808 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1073  methionine synthase (B12-dependent)  30.47 
 
 		 1197 aa  305  3.0000000000000004e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2062  B12-dependent methionine synthase  29.38 
 
 		 1228 aa  304  4.0000000000000003e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.458303  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0595  B12-dependent methionine synthase  28.25 
 
 		 1272 aa  304  4.0000000000000003e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  29.6 
 
 		 1136 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  29.38 
 
 		 1236 aa  303  9e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0315  B12-dependent methionine synthase  29.4 
 
 		 1225 aa  302  1e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170465 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  28.62 
 
 		 1169 aa  302  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2154  B12-dependent methionine synthase  28.83 
 
 		 1228 aa  302  2e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4250  methionine synthase  28.11 
 
 		 1261 aa  302  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.49174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2325  methionine synthase  27.63 
 
 		 1171 aa  301  3e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0940297  hitchhiker  0.00240742 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1549  methionine synthase  28.92 
 
 		 1156 aa  301  3e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.217391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5363  methionine synthase  28.62 
 
 		 1169 aa  300  9e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.816675 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2651  B12-dependent methionine synthase  29 
 
 		 1257 aa  300  9e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  28.71 
 
 		 1208 aa  299  1e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  28.76 
 
 		 1178 aa  298  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14891  putative methionine synthase  28.52 
 
 		 1214 aa  298  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.123192 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0723  methionine synthase  31.01 
 
 		 1151 aa  299  2e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.830371  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1372  methionine synthase (B12-dependent)  28.92 
 
 		 1190 aa  298  3e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.477278 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0182  methionine synthase  27.49 
 
 		 1263 aa  298  3e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0403  B12-dependent methionine synthase  28.13 
 
 		 1271 aa  297  5e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0459446  hitchhiker  0.000026899 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2911  B12-dependent methionine synthase  28.98 
 
 		 1257 aa  297  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1336  B12-dependent methionine synthase  29 
 
 		 1226 aa  297  6e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.262937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1889  B12-dependent methionine synthase  27.73 
 
 		 1245 aa  296  1e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>