More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0277 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  69.01 
 
 		 804 aa  1077    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  61.93 
 
 		 801 aa  966    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  67.86 
 
 		 804 aa  1045    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  96.18 
 
 		 813 aa  1527    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  46.13 
 
 		 801 aa  699    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  73.28 
 
 		 804 aa  1169    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  49.26 
 
 		 800 aa  742    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  100 
 
 		 811 aa  1622    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  44.31 
 
 		 839 aa  644    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  67.32 
 
 		 806 aa  1060    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  42.14 
 
 		 807 aa  637    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  41.08 
 
 		 804 aa  620  1e-176  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  41.51 
 
 		 819 aa  621  1e-176  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  44.01 
 
 		 818 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23490  methionine synthase (B12-dependent)  43.96 
 
 		 820 aa  581  1e-164  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.136684  hitchhiker  0.0000158862 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  42.05 
 
 		 803 aa  570  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  41.79 
 
 		 804 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  40.39 
 
 		 802 aa  556  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  39.58 
 
 		 791 aa  556  1e-157  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  40.99 
 
 		 841 aa  551  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  41.88 
 
 		 804 aa  550  1e-155  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  37.99 
 
 		 841 aa  546  1e-154  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  39.51 
 
 		 816 aa  512  1e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  36.34 
 
 		 768 aa  474  1e-132  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  36.48 
 
 		 768 aa  475  1e-132  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0729  homocysteine S-methyltransferase  33.05 
 
 		 781 aa  463  1e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  34.03 
 
 		 780 aa  453  1.0000000000000001e-126  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  32.71 
 
 		 774 aa  438  1e-121  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  33.95 
 
 		 793 aa  437  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  33.48 
 
 		 1180 aa  412  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  33.92 
 
 		 1189 aa  408  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  33.64 
 
 		 1163 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  34.13 
 
 		 1196 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1854  methionine synthase  34.16 
 
 		 1154 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516902 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  33.8 
 
 		 1150 aa  399  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  33.45 
 
 		 1132 aa  396  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1940  methionine synthase  34.18 
 
 		 1193 aa  394  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.092673  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  33.76 
 
 		 1158 aa  394  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3878  methionine synthase  33.41 
 
 		 1208 aa  395  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00387489  normal  0.106452 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0092  methionine synthase  33.57 
 
 		 1150 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0102  methionine synthase  33.68 
 
 		 1150 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  33.25 
 
 		 1132 aa  394  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  33.17 
 
 		 1132 aa  389  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  33.13 
 
 		 1132 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  33.25 
 
 		 1133 aa  390  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  33.13 
 
 		 1133 aa  391  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  33.13 
 
 		 1132 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2325  methionine synthase  32.98 
 
 		 1171 aa  391  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0940297  hitchhiker  0.00240742 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  33.13 
 
 		 1132 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  33.18 
 
 		 1132 aa  389  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2171  methionine synthase  32.95 
 
 		 1167 aa  389  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.657352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2292  methionine synthase  33.18 
 
 		 1157 aa  388  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0622799  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  33.73 
 
 		 1168 aa  389  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  32.59 
 
 		 1178 aa  388  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  33.17 
 
 		 1132 aa  389  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5363  methionine synthase  33.69 
 
 		 1169 aa  388  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.816675 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  33.02 
 
 		 1136 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  32.86 
 
 		 1132 aa  385  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0087  methionine synthase  33.22 
 
 		 1149 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.834345  normal  0.210518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5917  methionine synthase  32.24 
 
 		 1154 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0712476  normal  0.0446229 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  32.94 
 
 		 1158 aa  383  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0064  methionine synthase  32.14 
 
 		 1254 aa  385  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496444 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  32.15 
 
 		 1223 aa  380  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3349  methionine synthase  33.26 
 
 		 1214 aa  381  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  33.21 
 
 		 1169 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3230  methionine synthase  33.83 
 
 		 1183 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  31.76 
 
 		 1215 aa  377  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27020  methionine synthase (B12-dependent)  32.31 
 
 		 1184 aa  379  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12372  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12156  5-methyltetrahydrofolate-homocystein methyltransferase metH  33.02 
 
 		 1192 aa  375  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.726643 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  32.7 
 
 		 1136 aa  376  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1700  methionine synthase  33.18 
 
 		 1171 aa  372  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1488  methionine synthase  31.7 
 
 		 1156 aa  370  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.128181  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1073  methionine synthase (B12-dependent)  33.92 
 
 		 1197 aa  370  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2445  methionine synthase  32.2 
 
 		 1199 aa  370  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.795669  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  33.14 
 
 		 1176 aa  367  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  33.1 
 
 		 1191 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  33.87 
 
 		 1178 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  33.1 
 
 		 1191 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4499  methionine synthase  31.29 
 
 		 1173 aa  366  1e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.629663  hitchhiker  0.00843884 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3627  methionine synthase (B12-dependent)  32.3 
 
 		 1216 aa  366  1e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.43 
 
 		 1208 aa  365  3e-99  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1549  methionine synthase  31.36 
 
 		 1156 aa  364  4e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.217391 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  33.18 
 
 		 1208 aa  363  7.0000000000000005e-99  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0333  putative methionine synthase  31.4 
 
 		 1182 aa  360  8e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1531  methionine synthase (B12-dependent)  34.2 
 
 		 1182 aa  359  9.999999999999999e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10061  putative methionine synthase  31.55 
 
 		 1182 aa  359  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0164665 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16010  methionine synthase (B12-dependent)  33.1 
 
 		 1176 aa  357  3.9999999999999996e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471767  normal  0.0779461 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14891  putative methionine synthase  32.78 
 
 		 1214 aa  356  1e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.123192 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  32.98 
 
 		 1236 aa  355  1e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3320  B12-dependent methionine synthase  32.5 
 
 		 1235 aa  355  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.487541 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3107  B12-dependent methionine synthase  32.58 
 
 		 1236 aa  355  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1982  B12-dependent methionine synthase  32.35 
 
 		 1235 aa  355  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0368395  normal  0.238169 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2159  B12-dependent methionine synthase  32.32 
 
 		 1236 aa  355  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.088857 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1888  B12-dependent methionine synthase  32.17 
 
 		 1235 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1418  methionine synthase  31.91 
 
 		 1181 aa  353  5.9999999999999994e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.156555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29240  B12-dependent methionine synthase  32.32 
 
 		 1278 aa  353  8e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0723  methionine synthase  33.06 
 
 		 1151 aa  353  8e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.830371  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2375  B12-dependent methionine synthase  32.39 
 
 		 1235 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1123  B12-dependent methionine synthase  32.81 
 
 		 1246 aa  352  1e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.833597 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  31.35 
 
 		 1191 aa  352  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>