More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1211 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  43.43 
 
 
804 aa  673    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23490  methionine synthase (B12-dependent)  45.25 
 
 
820 aa  671    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.136684  hitchhiker  0.0000158862 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  45.24 
 
 
800 aa  691    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  42.89 
 
 
801 aa  664    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  43.16 
 
 
804 aa  646    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  47.94 
 
 
801 aa  767    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  44.51 
 
 
804 aa  706    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  42.86 
 
 
839 aa  697    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  50.31 
 
 
791 aa  775    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  44.14 
 
 
804 aa  673    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  41.42 
 
 
806 aa  639    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  100 
 
 
807 aa  1616    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  43.19 
 
 
819 aa  632  1e-179  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  41.89 
 
 
813 aa  625  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  41.94 
 
 
811 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  38.67 
 
 
841 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  40.93 
 
 
841 aa  592  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  41.38 
 
 
768 aa  569  1e-161  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  40 
 
 
804 aa  571  1e-161  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  41.79 
 
 
768 aa  568  1e-160  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  38.19 
 
 
818 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  39.95 
 
 
803 aa  553  1e-156  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  38.92 
 
 
802 aa  536  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  40.08 
 
 
804 aa  533  1e-150  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  36.26 
 
 
816 aa  510  1e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0729  homocysteine S-methyltransferase  38.5 
 
 
781 aa  498  1e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  37.07 
 
 
780 aa  480  1e-134  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  34.97 
 
 
774 aa  464  1e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  33.14 
 
 
1196 aa  443  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  34.24 
 
 
1150 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0102  methionine synthase  33.84 
 
 
1150 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0092  methionine synthase  33.96 
 
 
1150 aa  432  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0087  methionine synthase  34.04 
 
 
1149 aa  432  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.834345  normal  0.210518 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  33.53 
 
 
1180 aa  432  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0064  methionine synthase  32.98 
 
 
1254 aa  426  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.496444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3878  methionine synthase  33.1 
 
 
1208 aa  428  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00387489  normal  0.106452 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  35.56 
 
 
793 aa  427  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  32.67 
 
 
1158 aa  414  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  32.12 
 
 
1223 aa  406  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  31.52 
 
 
1189 aa  408  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  32.24 
 
 
1215 aa  406  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1854  methionine synthase  32.06 
 
 
1154 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.516902 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  31.47 
 
 
1178 aa  401  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  31.75 
 
 
1158 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  33.53 
 
 
1136 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0723  methionine synthase  33.65 
 
 
1151 aa  396  1e-109  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.830371  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.85 
 
 
1132 aa  397  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2171  methionine synthase  30.97 
 
 
1167 aa  395  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.657352  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27020  methionine synthase (B12-dependent)  31.87 
 
 
1184 aa  395  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12372  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.3 
 
 
1163 aa  393  1e-108  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1549  methionine synthase  31.8 
 
 
1156 aa  396  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.217391 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12156  5-methyltetrahydrofolate-homocystein methyltransferase metH  31.72 
 
 
1192 aa  394  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.726643 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2325  methionine synthase  30.15 
 
 
1171 aa  395  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0940297  hitchhiker  0.00240742 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  33.53 
 
 
1178 aa  391  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  33.09 
 
 
1132 aa  386  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.48 
 
 
1132 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  33.21 
 
 
1132 aa  384  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  31.99 
 
 
1136 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1940  methionine synthase  32.68 
 
 
1193 aa  384  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.092673  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.24 
 
 
1132 aa  382  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  31.65 
 
 
1208 aa  381  1e-104  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2292  methionine synthase  30.5 
 
 
1157 aa  380  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0622799  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  32.48 
 
 
1132 aa  382  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  31.75 
 
 
1169 aa  381  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3230  methionine synthase  33.06 
 
 
1183 aa  379  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.12 
 
 
1132 aa  378  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.6 
 
 
1133 aa  378  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5363  methionine synthase  30.89 
 
 
1169 aa  379  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.816675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  32 
 
 
1191 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.18 
 
 
1208 aa  377  1e-103  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.12 
 
 
1132 aa  378  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14891  putative methionine synthase  31.84 
 
 
1214 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.123192 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2445  methionine synthase  31.59 
 
 
1199 aa  376  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.795669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.24 
 
 
1132 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  32.12 
 
 
1133 aa  375  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  31.88 
 
 
1191 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1418  methionine synthase  31.65 
 
 
1181 aa  375  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.156555  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  31.71 
 
 
1176 aa  374  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5917  methionine synthase  30.79 
 
 
1154 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0712476  normal  0.0446229 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2786  methionine synthase  31.95 
 
 
1195 aa  370  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000283973  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1073  methionine synthase (B12-dependent)  32.66 
 
 
1197 aa  371  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  30.72 
 
 
1224 aa  371  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1488  methionine synthase  31.9 
 
 
1156 aa  369  1e-100  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.128181  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  30.54 
 
 
1236 aa  367  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1372  methionine synthase (B12-dependent)  30.95 
 
 
1190 aa  368  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.477278 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4499  methionine synthase  29.85 
 
 
1173 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.629663  hitchhiker  0.00843884 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  32.78 
 
 
1191 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0923  putative methionine synthase  31.25 
 
 
1188 aa  365  1e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09841  putative methionine synthase  31.68 
 
 
1188 aa  365  2e-99  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3503  methionine synthase  29.95 
 
 
1212 aa  363  6e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.929135  normal  0.479801 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1700  methionine synthase  30.12 
 
 
1171 aa  362  2e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09821  putative methionine synthase  31.02 
 
 
1188 aa  360  4e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4526  B12-dependent methionine synthase  31.37 
 
 
1227 aa  360  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.267598  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0333  putative methionine synthase  31.23 
 
 
1182 aa  359  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16010  methionine synthase (B12-dependent)  31.91 
 
 
1176 aa  359  9.999999999999999e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471767  normal  0.0779461 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10061  putative methionine synthase  31.04 
 
 
1182 aa  358  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0164665 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4435  B12-dependent methionine synthase  31.13 
 
 
1227 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4599  B12-dependent methionine synthase  31.13 
 
 
1227 aa  358  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.972582  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3349  methionine synthase  31.23 
 
 
1214 aa  358  2.9999999999999997e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4401  B12-dependent methionine synthase  31.25 
 
 
1227 aa  357  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.90979  normal  0.334358 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>