More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0682 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  45.88 
 
 		 774 aa  668    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  44.81 
 
 		 780 aa  655    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0729  homocysteine S-methyltransferase  44.33 
 
 		 781 aa  660    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  100 
 
 		 793 aa  1599    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  39.69 
 
 		 768 aa  549  1e-155  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  40.31 
 
 		 768 aa  548  1e-154  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  36.03 
 
 		 804 aa  484  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  33.99 
 
 		 804 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  35.56 
 
 		 801 aa  468  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  35.02 
 
 		 804 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  33.5 
 
 		 804 aa  466  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  34.29 
 
 		 806 aa  460  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  34.36 
 
 		 801 aa  449  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  33.13 
 
 		 813 aa  437  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  33.37 
 
 		 800 aa  438  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  32.38 
 
 		 839 aa  432  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  35.31 
 
 		 807 aa  430  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  34.15 
 
 		 819 aa  432  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  33.7 
 
 		 811 aa  427  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  33.29 
 
 		 791 aa  417  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23490  methionine synthase (B12-dependent)  33.05 
 
 		 820 aa  406  1.0000000000000001e-112  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.136684  hitchhiker  0.0000158862 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  30.76 
 
 		 841 aa  392  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  32.79 
 
 		 841 aa  389  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  30.94 
 
 		 816 aa  380  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  32.8 
 
 		 804 aa  364  4e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  31.85 
 
 		 804 aa  361  3e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  31.29 
 
 		 803 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  30.75 
 
 		 818 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  31.15 
 
 		 802 aa  346  1e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  30.43 
 
 		 1132 aa  342  1e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  30.31 
 
 		 1132 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  29.88 
 
 		 1132 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  30.43 
 
 		 1132 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  29.22 
 
 		 1169 aa  335  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  29.49 
 
 		 1132 aa  335  1e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  30.04 
 
 		 1132 aa  334  4e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.33 
 
 		 1132 aa  333  6e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.33 
 
 		 1132 aa  333  6e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.33 
 
 		 1133 aa  333  7.000000000000001e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.33 
 
 		 1133 aa  333  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.33 
 
 		 1132 aa  333  9e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  29.58 
 
 		 1196 aa  329  9e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  28.57 
 
 		 1136 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0333  putative methionine synthase  29.83 
 
 		 1182 aa  322  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0064  methionine synthase  28.31 
 
 		 1254 aa  321  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496444 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10061  putative methionine synthase  29.6 
 
 		 1182 aa  320  5e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0164665 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  28.15 
 
 		 1136 aa  319  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2292  methionine synthase  27.89 
 
 		 1157 aa  316  8e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0622799  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  28.54 
 
 		 1168 aa  316  8e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  29.67 
 
 		 1178 aa  316  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3878  methionine synthase  28.25 
 
 		 1208 aa  315  9.999999999999999e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00387489  normal  0.106452 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  29.24 
 
 		 1150 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1854  methionine synthase  28.59 
 
 		 1154 aa  315  2.9999999999999996e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516902 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  29 
 
 		 1176 aa  314  3.9999999999999997e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0087  methionine synthase  29.01 
 
 		 1149 aa  311  4e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.834345  normal  0.210518 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  28 
 
 		 1158 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1549  methionine synthase  28.52 
 
 		 1156 aa  307  6e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.217391 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0092  methionine synthase  28.81 
 
 		 1150 aa  306  8.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4499  methionine synthase  27.82 
 
 		 1173 aa  306  9.000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.629663  hitchhiker  0.00843884 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  27.76 
 
 		 1215 aa  306  9.000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0102  methionine synthase  28.69 
 
 		 1150 aa  306  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  28.13 
 
 		 1224 aa  305  2.0000000000000002e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  27.94 
 
 		 1180 aa  303  7.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  29.74 
 
 		 1208 aa  303  9e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1372  methionine synthase (B12-dependent)  29.88 
 
 		 1190 aa  303  1e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.477278 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  28.27 
 
 		 1191 aa  302  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14891  putative methionine synthase  30.2 
 
 		 1214 aa  301  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.123192 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3230  methionine synthase  28.93 
 
 		 1183 aa  301  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0923  putative methionine synthase  29.18 
 
 		 1188 aa  300  8e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  28.27 
 
 		 1191 aa  299  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  26.71 
 
 		 1178 aa  298  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  28.75 
 
 		 1208 aa  297  4e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  29.23 
 
 		 1189 aa  297  6e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12156  5-methyltetrahydrofolate-homocystein methyltransferase metH  27.12 
 
 		 1192 aa  297  6e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.726643 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1700  methionine synthase  28.55 
 
 		 1171 aa  297  6e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5287  methionine synthase  27.09 
 
 		 1266 aa  297  6e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1488  methionine synthase  28.06 
 
 		 1156 aa  296  7e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.128181  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3503  methionine synthase  28.21 
 
 		 1212 aa  296  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.929135  normal  0.479801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5363  methionine synthase  27.96 
 
 		 1169 aa  296  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.816675 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  26.91 
 
 		 1158 aa  295  2e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  27.54 
 
 		 1163 aa  295  3e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5917  methionine synthase  27.11 
 
 		 1154 aa  295  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0712476  normal  0.0446229 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0328  B12-dependent methionine synthase  27.82 
 
 		 1264 aa  294  4e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  27.69 
 
 		 1223 aa  294  4e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27020  methionine synthase (B12-dependent)  27.01 
 
 		 1184 aa  293  6e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12372  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4366  B12-dependent methionine synthase  26.83 
 
 		 1247 aa  292  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.778137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1073  methionine synthase (B12-dependent)  28.79 
 
 		 1197 aa  292  2e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2804  methionine synthase  28.57 
 
 		 1274 aa  291  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.294328 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09841  putative methionine synthase  28.37 
 
 		 1188 aa  291  3e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2911  B12-dependent methionine synthase  26.86 
 
 		 1257 aa  291  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2123  B12-dependent methionine synthase  27.44 
 
 		 1250 aa  291  4e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.607854 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3690  B12-dependent methionine synthase  26.3 
 
 		 1220 aa  290  5.0000000000000004e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  28.42 
 
 		 1191 aa  290  6e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2651  B12-dependent methionine synthase  26.98 
 
 		 1257 aa  289  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1982  B12-dependent methionine synthase  26.95 
 
 		 1235 aa  286  8e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0368395  normal  0.238169 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3799  methionine synthase  28.27 
 
 		 1219 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  27.25 
 
 		 1236 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2375  B12-dependent methionine synthase  26.54 
 
 		 1235 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1888  B12-dependent methionine synthase  26.58 
 
 		 1235 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2325  methionine synthase  26.92 
 
 		 1171 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0940297  hitchhiker  0.00240742 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>