More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1792 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  49.22 
 
 		 768 aa  731    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  49.67 
 
 		 768 aa  739    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  100 
 
 		 774 aa  1551    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0729  homocysteine S-methyltransferase  51.75 
 
 		 781 aa  777    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  45.88 
 
 		 793 aa  662    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  51.79 
 
 		 780 aa  770    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  36.8 
 
 		 804 aa  496  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  35.08 
 
 		 804 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  35.63 
 
 		 800 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  34.97 
 
 		 807 aa  464  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  33.96 
 
 		 804 aa  456  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  35.65 
 
 		 819 aa  451  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  33.33 
 
 		 801 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  32.46 
 
 		 839 aa  446  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  33.25 
 
 		 841 aa  443  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  32.51 
 
 		 804 aa  446  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  32.84 
 
 		 806 aa  444  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  33.71 
 
 		 801 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  35.05 
 
 		 791 aa  435  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  32.39 
 
 		 813 aa  427  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23490  methionine synthase (B12-dependent)  33.25 
 
 		 820 aa  420  1e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.136684  hitchhiker  0.0000158862 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  32.71 
 
 		 811 aa  421  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  32.08 
 
 		 816 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  32.91 
 
 		 804 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  31.37 
 
 		 841 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  32.84 
 
 		 802 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  31.03 
 
 		 818 aa  399  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  32.79 
 
 		 804 aa  382  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  31.45 
 
 		 803 aa  375  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0087  methionine synthase  28.99 
 
 		 1149 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.834345  normal  0.210518 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  28.87 
 
 		 1150 aa  337  5e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0102  methionine synthase  29.42 
 
 		 1150 aa  336  9e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0092  methionine synthase  29.42 
 
 		 1150 aa  336  1e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  28.22 
 
 		 1189 aa  335  2e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.79 
 
 		 1132 aa  330  8e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  29.22 
 
 		 1196 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  27.91 
 
 		 1215 aa  328  3e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  30.04 
 
 		 1132 aa  327  6e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  28.67 
 
 		 1180 aa  324  5e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.82 
 
 		 1132 aa  321  3e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  30.18 
 
 		 1132 aa  321  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.82 
 
 		 1132 aa  320  5e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  30.06 
 
 		 1132 aa  320  7e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.94 
 
 		 1132 aa  318  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.94 
 
 		 1133 aa  318  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5917  methionine synthase  27.29 
 
 		 1154 aa  318  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0712476  normal  0.0446229 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.94 
 
 		 1132 aa  318  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  26.38 
 
 		 1168 aa  318  2e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.94 
 
 		 1133 aa  318  3e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.94 
 
 		 1132 aa  318  3e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1700  methionine synthase  27.71 
 
 		 1171 aa  318  3e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  29.26 
 
 		 1136 aa  318  3e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1894  B12-dependent methionine synthase  30.86 
 
 		 1229 aa  317  4e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  27.63 
 
 		 1223 aa  315  9.999999999999999e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  27.54 
 
 		 1163 aa  312  1e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3690  B12-dependent methionine synthase  28.23 
 
 		 1220 aa  312  1e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1854  methionine synthase  26.48 
 
 		 1154 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516902 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2062  B12-dependent methionine synthase  28.9 
 
 		 1228 aa  305  3.0000000000000004e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.458303  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2292  methionine synthase  26.1 
 
 		 1157 aa  305  3.0000000000000004e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0622799  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12156  5-methyltetrahydrofolate-homocystein methyltransferase metH  26.75 
 
 		 1192 aa  304  5.000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.726643 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3474  B12-dependent methionine synthase  28.47 
 
 		 1251 aa  302  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29240  B12-dependent methionine synthase  28.46 
 
 		 1278 aa  302  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2093  B12-dependent methionine synthase  28.77 
 
 		 1227 aa  301  3e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.883808 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  27.82 
 
 		 1191 aa  301  4e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0333  putative methionine synthase  26.32 
 
 		 1182 aa  300  6e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  27.78 
 
 		 1136 aa  300  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4250  methionine synthase  28.17 
 
 		 1261 aa  298  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.49174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  27.58 
 
 		 1191 aa  298  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1372  methionine synthase (B12-dependent)  27.28 
 
 		 1190 aa  297  4e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.477278 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0315  B12-dependent methionine synthase  28.38 
 
 		 1225 aa  297  5e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170465 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1888  B12-dependent methionine synthase  29.21 
 
 		 1235 aa  297  5e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3211  B12-dependent methionine synthase  27.97 
 
 		 1264 aa  296  7e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.509178 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0595  B12-dependent methionine synthase  27.65 
 
 		 1272 aa  296  1e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3161  B12-dependent methionine synthase  28.12 
 
 		 1264 aa  295  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.95608 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4499  methionine synthase  25.7 
 
 		 1173 aa  295  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.629663  hitchhiker  0.00843884 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2159  B12-dependent methionine synthase  28.08 
 
 		 1236 aa  295  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.088857 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1692  B12-dependent methionine synthase  29.16 
 
 		 1224 aa  295  3e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10061  putative methionine synthase  26.28 
 
 		 1182 aa  295  3e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0164665 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0403  B12-dependent methionine synthase  27.69 
 
 		 1271 aa  294  5e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0459446  hitchhiker  0.000026899 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  26.45 
 
 		 1158 aa  294  5e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3320  B12-dependent methionine synthase  29.21 
 
 		 1235 aa  293  7e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.487541 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5287  methionine synthase  27.53 
 
 		 1266 aa  293  9e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212227  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2375  B12-dependent methionine synthase  29.21 
 
 		 1235 aa  293  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2804  methionine synthase  28.57 
 
 		 1274 aa  293  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.294328 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1488  methionine synthase  27.49 
 
 		 1156 aa  293  1e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.128181  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0723  methionine synthase  29.03 
 
 		 1151 aa  292  1e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.830371  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1982  B12-dependent methionine synthase  29.26 
 
 		 1235 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0368395  normal  0.238169 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1889  B12-dependent methionine synthase  27.07 
 
 		 1245 aa  292  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1549  methionine synthase  26.84 
 
 		 1156 aa  292  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.217391 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2463  B12-dependent methionine synthase  29 
 
 		 1240 aa  292  2e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2102  B12-dependent methionine synthase  28.42 
 
 		 1249 aa  292  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.876734  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0973  B12-dependent methionine synthase  27.33 
 
 		 1244 aa  290  6e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1007  B12-dependent methionine synthase  27.22 
 
 		 1244 aa  290  7e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0182  methionine synthase  26.45 
 
 		 1263 aa  290  8e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27020  methionine synthase (B12-dependent)  26.61 
 
 		 1184 aa  290  9e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12372  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3053  B12-dependent methionine synthase  26.92 
 
 		 1251 aa  289  1e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.453999 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  26.01 
 
 		 1208 aa  289  1e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1531  methionine synthase (B12-dependent)  27.27 
 
 		 1182 aa  290  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  27.97 
 
 		 1169 aa  290  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3149  B12-dependent methionine synthase  27.98 
 
 		 1220 aa  289  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>