More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1041 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1041  cobalamin B12-binding domain-containing protein  100 
 
 		 211 aa  421  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.388992 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0539  cobalamin B12-binding domain protein  46 
 
 		 218 aa  179  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3886  cobalamin B12-binding domain protein  44.28 
 
 		 215 aa  169  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000310147  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0387  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  41.75 
 
 		 207 aa  168  6e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.682962  normal  0.201782 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1316  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  41.75 
 
 		 207 aa  168  6e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.518339 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2929  cobalamin B12-binding domain protein  39.06 
 
 		 216 aa  167  8e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000012726  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1603  cobalamin B12-binding domain protein  43 
 
 		 211 aa  164  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000910131  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2368  cobalamin B12-binding domain protein  43.15 
 
 		 213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0720  cobalamin B12-binding domain protein  38.65 
 
 		 211 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1835  cobalamin B12-binding domain protein  46.5 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1212  methionine synthase  40.7 
 
 		 224 aa  152  5e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.807396  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0729  Methionine synthase  41.46 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.342972  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1311  cobalamin B12-binding  38.07 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.460326 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3881  cobalamin B12-binding domain protein  38.61 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000148578  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1729  Methionine synthase  41.57 
 
 		 210 aa  147  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  36.71 
 
 		 607 aa  147  8e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1732  Methionine synthase  41.24 
 
 		 210 aa  145  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1605  cobalamin B12-binding domain protein  36.1 
 
 		 212 aa  146  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000212682  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1110  cobalamin B12-binding domain-containing protein  41.21 
 
 		 208 aa  142  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4872  cobalamin B12-binding domain protein  42.94 
 
 		 210 aa  142  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2582  Methionine synthase  39.63 
 
 		 213 aa  141  7e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.242133  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1208  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  35.92 
 
 		 210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1827  cobalamin B12-binding domain protein  40.96 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2958  cobalamin B12-binding domain-containing protein  34.54 
 
 		 216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.885246  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1468  methionine synthase  33.02 
 
 		 218 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543896  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2567  cobalamin B12-binding domain protein  40.38 
 
 		 206 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000474708  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1470  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  37.85 
 
 		 232 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2641  cobalamin B12-binding domain protein  37.99 
 
 		 210 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2571  cobalamin B12-binding domain protein  34.6 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.111371  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1895  cobalamin B12-binding domain protein  36.36 
 
 		 209 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4641  cobalamin B12-binding domain protein  38.37 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2116  corrinoid methyltransferase  35.8 
 
 		 209 aa  129  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00601394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2122  putative dimethylamine corrinoid protein  37.5 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.154357  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0797  methionine synthase  37.5 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.310628  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2550  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  35.14 
 
 		 235 aa  128  6e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1073  methionine synthase  36.7 
 
 		 259 aa  127  8.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.234469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0707  methionine synthase  37.5 
 
 		 232 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.784551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3658  cobalamin B12-binding domain-containing protein  36.9 
 
 		 210 aa  125  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4611  cobalamin B12-binding domain protein  35.24 
 
 		 210 aa  125  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.855843  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1776  methionine synthase  36.26 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal  0.011957 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2784  cobalamin B12-binding protein  32.02 
 
 		 221 aa  124  7e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0108719  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1827  cobalamin B12-binding domain-containing protein  34 
 
 		 219 aa  122  3e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  33.01 
 
 		 801 aa  122  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0840  cobalamin B12-binding domain-containing protein  34 
 
 		 219 aa  121  8e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2288  dimethylamine corrinoid protein  41.72 
 
 		 168 aa  121  8e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.974802  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1501  dimethylamine corrinoid protein  34.65 
 
 		 208 aa  121  9e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000126339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0075  cobalamin B12-binding domain-containing protein  35.47 
 
 		 219 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.916725  normal  0.540278 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1107  cobalamin B12-binding domain protein  34.95 
 
 		 210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1365  dimethylamine corrinoid protein  40.49 
 
 		 251 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000308359  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  34.93 
 
 		 804 aa  118  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15360  Methionine synthase  38.89 
 
 		 210 aa  118  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4325  methyltransferase cognate corrinoid protein  33.84 
 
 		 214 aa  117  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1206  cobalamin B12-binding  35.14 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.136661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  31.22 
 
 		 800 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1503  dimethylamine corrinoid protein  31.16 
 
 		 217 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.153126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  34.15 
 
 		 811 aa  115  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  34.43 
 
 		 804 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  35.1 
 
 		 801 aa  114  7.999999999999999e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3604  dimethylamine corrinoid protein  37.8 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.220504 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  35.21 
 
 		 556 aa  113  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  35.8 
 
 		 804 aa  113  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  33.33 
 
 		 804 aa  112  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  33.82 
 
 		 806 aa  112  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  32.68 
 
 		 813 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0418  cobalamin-dependent methionine synthase, B12-binding  34.38 
 
 		 220 aa  112  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4337  cobalamin B12-binding domain-containing protein  38.18 
 
 		 326 aa  112  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.125438  normal  0.389787 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  34 
 
 		 802 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0024  methyltransferase cognate corrinoid protein  35.59 
 
 		 220 aa  111  9e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  35.19 
 
 		 839 aa  110  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2310  trimethylamine corrinoid protein  33.33 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00299987  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25850  predicted cobalamin binding protein  31.43 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0061  cobalamin B12-binding domain-containing protein  33.54 
 
 		 217 aa  109  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23490  methionine synthase (B12-dependent)  34.09 
 
 		 820 aa  109  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.136684  hitchhiker  0.0000158862 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3199  Methionine synthase B12-binding module cap domain protein  32.03 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1368  trimethylamine corrinoid protein  30.2 
 
 		 216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000818926  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  33.16 
 
 		 803 aa  108  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  33.73 
 
 		 793 aa  108  8.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  33 
 
 		 804 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  31.07 
 
 		 774 aa  106  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1940  methionine synthase  35.47 
 
 		 1193 aa  106  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.092673  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  33.17 
 
 		 807 aa  106  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  33.53 
 
 		 791 aa  106  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  31.77 
 
 		 1136 aa  105  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  32.63 
 
 		 841 aa  105  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2964  cobalamin B12-binding domain-containing protein  34.55 
 
 		 223 aa  105  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0486605  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  31.32 
 
 		 1136 aa  105  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  33.33 
 
 		 818 aa  105  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  36.53 
 
 		 819 aa  103  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19540  predicted cobalamin binding protein  30.29 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.109769  hitchhiker  0.00000629767 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16010  methionine synthase (B12-dependent)  33.33 
 
 		 1176 aa  102  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471767  normal  0.0779461 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  30.77 
 
 		 1223 aa  101  8e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3627  methionine synthase (B12-dependent)  32.42 
 
 		 1216 aa  101  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0606  B12-dependent methionine synthase  35.54 
 
 		 1232 aa  101  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  31.69 
 
 		 816 aa  100  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0597  cobalamin B12-binding domain-containing protein  31.46 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  30.85 
 
 		 1215 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  30.37 
 
 		 1158 aa  99.8  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2292  methionine synthase  35.88 
 
 		 1157 aa  99.4  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0622799  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  30.72 
 
 		 804 aa  99  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1854  methionine synthase  33.5 
 
 		 1154 aa  98.6  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>