More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4321 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4321  cobalamin B12-binding domain protein  100 
 
 
214 aa  433  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2582  Methionine synthase  44.88 
 
 
213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.242133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2641  cobalamin B12-binding domain protein  41.87 
 
 
210 aa  169  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2116  corrinoid methyltransferase  44.72 
 
 
209 aa  168  5e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00601394  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0729  Methionine synthase  42.65 
 
 
212 aa  167  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.342972  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15360  Methionine synthase  46.28 
 
 
210 aa  166  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3658  cobalamin B12-binding domain-containing protein  39.18 
 
 
210 aa  161  7e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435157  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1729  Methionine synthase  39.71 
 
 
210 aa  156  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3199  Methionine synthase B12-binding module cap domain protein  41.03 
 
 
212 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1732  Methionine synthase  39.22 
 
 
210 aa  155  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  43.26 
 
 
556 aa  153  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1206  cobalamin B12-binding  41.92 
 
 
224 aa  148  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.136661  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1208  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  40.1 
 
 
210 aa  148  6e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116164  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4337  cobalamin B12-binding domain-containing protein  41.33 
 
 
326 aa  148  8e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.125438  normal  0.389787 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4611  cobalamin B12-binding domain protein  41.54 
 
 
210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.855843  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1776  methionine synthase  35.51 
 
 
232 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal  0.011957 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2122  putative dimethylamine corrinoid protein  37.31 
 
 
232 aa  142  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.154357  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0797  methionine synthase  37.31 
 
 
232 aa  142  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.310628  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4641  cobalamin B12-binding domain protein  42.25 
 
 
213 aa  142  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4872  cobalamin B12-binding domain protein  39.15 
 
 
210 aa  142  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1110  cobalamin B12-binding domain-containing protein  37.82 
 
 
208 aa  141  7e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0707  methionine synthase  36.79 
 
 
232 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.784551  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0418  cobalamin-dependent methionine synthase, B12-binding  34.85 
 
 
220 aa  137  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25850  predicted cobalamin binding protein  35.18 
 
 
217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2784  cobalamin B12-binding protein  38.02 
 
 
221 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0108719  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1107  cobalamin B12-binding domain protein  37.95 
 
 
210 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2550  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  35.71 
 
 
235 aa  135  5e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1368  trimethylamine corrinoid protein  37.31 
 
 
216 aa  135  5e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000818926  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3604  dimethylamine corrinoid protein  38.35 
 
 
214 aa  134  8e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.220504 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0597  cobalamin B12-binding domain-containing protein  37.32 
 
 
218 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1470  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  35.71 
 
 
232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1073  methionine synthase  35.23 
 
 
259 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.234469  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  34.87 
 
 
607 aa  133  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2310  trimethylamine corrinoid protein  40.72 
 
 
216 aa  132  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00299987  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1827  cobalamin B12-binding domain protein  37.2 
 
 
213 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1501  dimethylamine corrinoid protein  36.89 
 
 
208 aa  131  6.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000126339  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1895  cobalamin B12-binding domain protein  40.11 
 
 
209 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1827  cobalamin B12-binding domain-containing protein  36.98 
 
 
219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0840  cobalamin B12-binding domain-containing protein  36.46 
 
 
219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19540  predicted cobalamin binding protein  37.63 
 
 
219 aa  129  3e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.109769  hitchhiker  0.00000629767 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1212  methionine synthase  41.53 
 
 
224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.807396  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0075  cobalamin B12-binding domain-containing protein  35.94 
 
 
219 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.916725  normal  0.540278 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4325  methyltransferase cognate corrinoid protein  33.67 
 
 
214 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1503  dimethylamine corrinoid protein  35.86 
 
 
217 aa  127  9.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.153126  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  35.64 
 
 
800 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1365  dimethylamine corrinoid protein  38.2 
 
 
251 aa  126  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000308359  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1468  methionine synthase  33.84 
 
 
218 aa  122  4e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543896  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  32.65 
 
 
801 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  34.03 
 
 
804 aa  119  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  34.54 
 
 
774 aa  119  4.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  32.49 
 
 
804 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  32.37 
 
 
804 aa  116  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2288  dimethylamine corrinoid protein  38.18 
 
 
168 aa  115  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.974802  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  31.12 
 
 
804 aa  115  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  35.29 
 
 
1136 aa  115  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  32.5 
 
 
818 aa  115  6e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  32.98 
 
 
839 aa  114  7.999999999999999e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  32.18 
 
 
841 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  35.29 
 
 
1136 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0024  methyltransferase cognate corrinoid protein  35.35 
 
 
220 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  30.61 
 
 
804 aa  112  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  34.83 
 
 
1132 aa  112  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  33.16 
 
 
841 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1316  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  32.14 
 
 
207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.518339 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  31.63 
 
 
813 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  34.83 
 
 
1132 aa  112  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  32.99 
 
 
804 aa  112  5e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  34.27 
 
 
1132 aa  112  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  34.27 
 
 
1133 aa  112  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0845  monomethylamine corrinoid protein  34.38 
 
 
217 aa  112  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  31.91 
 
 
801 aa  111  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  34.27 
 
 
1132 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  34.27 
 
 
1132 aa  111  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  34.27 
 
 
1132 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  34.27 
 
 
1133 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  34.27 
 
 
1132 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0387  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  31.63 
 
 
207 aa  111  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.682962  normal  0.201782 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  29.59 
 
 
806 aa  111  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  31.12 
 
 
811 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0840  monomethylamine corrinoid protein  33.17 
 
 
217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.960899  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0847  monomethylamine corrinoid protein  33.17 
 
 
217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  34.27 
 
 
1132 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  33.73 
 
 
768 aa  108  5e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  33.88 
 
 
1132 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1603  cobalamin B12-binding domain protein  35.67 
 
 
211 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000910131  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  34.31 
 
 
807 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  32.16 
 
 
768 aa  106  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  32.29 
 
 
802 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0842  monomethylamine corrinoid protein  32.81 
 
 
217 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3634  monomethylamine corrinoid protein  32.81 
 
 
217 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23490  methionine synthase (B12-dependent)  31.61 
 
 
820 aa  106  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.136684  hitchhiker  0.0000158862 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0061  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.8 
 
 
217 aa  105  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  32.94 
 
 
791 aa  103  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  31.75 
 
 
816 aa  103  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1267  methionine synthase  30.91 
 
 
832 aa  102  4e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09821  putative methionine synthase  32.62 
 
 
1188 aa  101  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  34.43 
 
 
1169 aa  101  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3886  cobalamin B12-binding domain protein  35.03 
 
 
215 aa  101  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000310147  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  29.05 
 
 
819 aa  101  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1835  cobalamin B12-binding domain protein  35.44 
 
 
212 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>