More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_15360 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_15360  Methionine synthase  100 
 
 
210 aa  414  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2582  Methionine synthase  64.59 
 
 
213 aa  275  4e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.242133  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0729  Methionine synthase  60.19 
 
 
212 aa  249  2e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.342972  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2116  corrinoid methyltransferase  59.52 
 
 
209 aa  245  4e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00601394  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3199  Methionine synthase B12-binding module cap domain protein  55.56 
 
 
212 aa  234  8e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2641  cobalamin B12-binding domain protein  56.46 
 
 
210 aa  224  6e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2550  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  52.07 
 
 
235 aa  219  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0707  methionine synthase  53.23 
 
 
232 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.784551  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1208  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  53.11 
 
 
210 aa  216  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116164  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1470  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  50.96 
 
 
232 aa  214  8e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0797  methionine synthase  52.24 
 
 
232 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.310628  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2122  putative dimethylamine corrinoid protein  52.24 
 
 
232 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.154357  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1110  cobalamin B12-binding domain-containing protein  52.43 
 
 
208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1732  Methionine synthase  50 
 
 
210 aa  208  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1073  methionine synthase  50.49 
 
 
259 aa  208  6e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.234469  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1729  Methionine synthase  49.52 
 
 
210 aa  207  8e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1776  methionine synthase  48.56 
 
 
232 aa  206  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal  0.011957 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3658  cobalamin B12-binding domain-containing protein  44.98 
 
 
210 aa  203  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435157  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  45.41 
 
 
607 aa  196  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4337  cobalamin B12-binding domain-containing protein  53 
 
 
326 aa  196  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.125438  normal  0.389787 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4641  cobalamin B12-binding domain protein  52.08 
 
 
213 aa  191  7e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1212  methionine synthase  48.33 
 
 
224 aa  186  2e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.807396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4872  cobalamin B12-binding domain protein  50.24 
 
 
210 aa  186  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4611  cobalamin B12-binding domain protein  48.8 
 
 
210 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.855843  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1827  cobalamin B12-binding domain protein  45.45 
 
 
213 aa  179  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1107  cobalamin B12-binding domain protein  45.02 
 
 
210 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  50.28 
 
 
556 aa  178  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1895  cobalamin B12-binding domain protein  43.13 
 
 
209 aa  177  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0418  cobalamin-dependent methionine synthase, B12-binding  44.71 
 
 
220 aa  177  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4321  cobalamin B12-binding domain protein  46.43 
 
 
214 aa  175  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1468  methionine synthase  41.4 
 
 
218 aa  174  9e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543896  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0840  cobalamin B12-binding domain-containing protein  43.27 
 
 
219 aa  171  9e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1827  cobalamin B12-binding domain-containing protein  42.79 
 
 
219 aa  171  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1206  cobalamin B12-binding  43.48 
 
 
224 aa  170  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.136661  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4325  methyltransferase cognate corrinoid protein  41.51 
 
 
214 aa  169  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0075  cobalamin B12-binding domain-containing protein  43.27 
 
 
219 aa  170  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.916725  normal  0.540278 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  41.15 
 
 
813 aa  167  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  41.55 
 
 
800 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  40.67 
 
 
811 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  42.86 
 
 
804 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0024  methyltransferase cognate corrinoid protein  47.75 
 
 
220 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  42.71 
 
 
804 aa  161  6e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0597  cobalamin B12-binding domain-containing protein  44.66 
 
 
218 aa  160  2e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2784  cobalamin B12-binding protein  43.55 
 
 
221 aa  159  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0108719  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19540  predicted cobalamin binding protein  47.95 
 
 
219 aa  159  3e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.109769  hitchhiker  0.00000629767 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  41.15 
 
 
801 aa  159  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3604  dimethylamine corrinoid protein  42.58 
 
 
214 aa  158  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.220504 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  40.87 
 
 
804 aa  157  9e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  41.43 
 
 
806 aa  157  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25850  predicted cobalamin binding protein  43.75 
 
 
217 aa  156  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1501  dimethylamine corrinoid protein  46.37 
 
 
208 aa  157  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000126339  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  41.83 
 
 
804 aa  156  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  38.1 
 
 
839 aa  156  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1365  dimethylamine corrinoid protein  45.2 
 
 
251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000308359  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1368  trimethylamine corrinoid protein  46.41 
 
 
216 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000818926  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1503  dimethylamine corrinoid protein  44.15 
 
 
217 aa  154  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.153126  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2288  dimethylamine corrinoid protein  46.71 
 
 
168 aa  154  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.974802  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1603  cobalamin B12-binding domain protein  42.57 
 
 
211 aa  153  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000910131  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0840  monomethylamine corrinoid protein  40.85 
 
 
217 aa  153  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.960899  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2310  trimethylamine corrinoid protein  48.81 
 
 
216 aa  153  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00299987  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  41.46 
 
 
804 aa  153  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0847  monomethylamine corrinoid protein  40.38 
 
 
217 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2958  cobalamin B12-binding domain-containing protein  38.95 
 
 
216 aa  150  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.885246  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23490  methionine synthase (B12-dependent)  44 
 
 
820 aa  148  4e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.136684  hitchhiker  0.0000158862 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  41.92 
 
 
804 aa  148  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  40.19 
 
 
802 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  37.62 
 
 
819 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0720  cobalamin B12-binding domain protein  39.7 
 
 
211 aa  145  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1835  cobalamin B12-binding domain protein  43.45 
 
 
212 aa  145  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  37.38 
 
 
841 aa  144  7.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  38.03 
 
 
1136 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0387  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  43.17 
 
 
207 aa  142  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.682962  normal  0.201782 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  37.56 
 
 
818 aa  143  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2567  cobalamin B12-binding domain protein  36.95 
 
 
206 aa  142  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000474708  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1316  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  43.17 
 
 
207 aa  142  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.518339 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0539  cobalamin B12-binding domain protein  44.24 
 
 
218 aa  142  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2368  cobalamin B12-binding domain protein  40.61 
 
 
213 aa  142  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  40.56 
 
 
791 aa  138  4.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  40.31 
 
 
807 aa  138  4.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  37.81 
 
 
841 aa  138  7e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  39.6 
 
 
1169 aa  137  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39 
 
 
1132 aa  136  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  37.5 
 
 
1132 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  38.07 
 
 
803 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  37.74 
 
 
1132 aa  135  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  38.38 
 
 
801 aa  135  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0842  monomethylamine corrinoid protein  38.54 
 
 
217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0845  monomethylamine corrinoid protein  39.06 
 
 
217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.02 
 
 
1132 aa  134  8e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.02 
 
 
1132 aa  134  8e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.02 
 
 
1132 aa  134  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.02 
 
 
1132 aa  134  8e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.02 
 
 
1132 aa  134  8e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.02 
 
 
1133 aa  134  9e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  37.02 
 
 
1133 aa  134  9e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  36.54 
 
 
1132 aa  132  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3886  cobalamin B12-binding domain protein  40.96 
 
 
215 aa  132  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000310147  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1041  cobalamin B12-binding domain-containing protein  38.89 
 
 
211 aa  131  9e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.388992 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  38.31 
 
 
1136 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3634  monomethylamine corrinoid protein  37.5 
 
 
217 aa  129  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>