More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0840 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0840  monomethylamine corrinoid protein  100 
 
 		 217 aa  433  1e-121  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.960899  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0847  monomethylamine corrinoid protein  98.62 
 
 		 217 aa  428  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0845  monomethylamine corrinoid protein  69.54 
 
 		 217 aa  276  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0842  monomethylamine corrinoid protein  70.05 
 
 		 217 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3634  monomethylamine corrinoid protein  68.53 
 
 		 217 aa  269  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0024  methyltransferase cognate corrinoid protein  41.47 
 
 		 220 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1365  dimethylamine corrinoid protein  42.99 
 
 		 251 aa  166  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000308359  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2582  Methionine synthase  40.57 
 
 		 213 aa  155  6e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.242133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4325  methyltransferase cognate corrinoid protein  40.09 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2288  dimethylamine corrinoid protein  46.15 
 
 		 168 aa  150  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.974802  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1468  methionine synthase  36.62 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543896  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3604  dimethylamine corrinoid protein  45.81 
 
 		 214 aa  148  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.220504 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  40.1 
 
 		 818 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1501  dimethylamine corrinoid protein  46.11 
 
 		 208 aa  145  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000126339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  38.76 
 
 		 800 aa  143  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0729  Methionine synthase  37.44 
 
 		 212 aa  142  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.342972  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2116  corrinoid methyltransferase  38.97 
 
 		 209 aa  141  9e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00601394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1368  trimethylamine corrinoid protein  41.18 
 
 		 216 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000818926  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15360  Methionine synthase  40.41 
 
 		 210 aa  138  7e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1729  Methionine synthase  37.2 
 
 		 210 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  38.25 
 
 		 804 aa  135  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1732  Methionine synthase  36.71 
 
 		 210 aa  134  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1503  dimethylamine corrinoid protein  35.98 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.153126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1212  methionine synthase  37.61 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.807396  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2310  trimethylamine corrinoid protein  41.86 
 
 		 216 aa  132  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00299987  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1895  cobalamin B12-binding domain protein  40 
 
 		 209 aa  132  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1107  cobalamin B12-binding domain protein  41.24 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1827  cobalamin B12-binding domain protein  38.61 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2784  cobalamin B12-binding protein  37.07 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0108719  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3658  cobalamin B12-binding domain-containing protein  37.62 
 
 		 210 aa  129  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3199  Methionine synthase B12-binding module cap domain protein  38.22 
 
 		 212 aa  128  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1110  cobalamin B12-binding domain-containing protein  38.39 
 
 		 208 aa  128  6e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4641  cobalamin B12-binding domain protein  40.23 
 
 		 213 aa  128  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2641  cobalamin B12-binding domain protein  36.27 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4872  cobalamin B12-binding domain protein  40.34 
 
 		 210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  35.48 
 
 		 804 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  40.21 
 
 		 841 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  39.05 
 
 		 804 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0597  cobalamin B12-binding domain-containing protein  39.15 
 
 		 218 aa  126  3e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0418  cobalamin-dependent methionine synthase, B12-binding  36.24 
 
 		 220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  39.68 
 
 		 841 aa  125  7e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1827  cobalamin B12-binding domain-containing protein  34.72 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0075  cobalamin B12-binding domain-containing protein  34.26 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.916725  normal  0.540278 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1776  methionine synthase  35.98 
 
 		 232 aa  123  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal  0.011957 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19540  predicted cobalamin binding protein  35.02 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.109769  hitchhiker  0.00000629767 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4611  cobalamin B12-binding domain protein  39.9 
 
 		 210 aa  122  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.855843  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0840  cobalamin B12-binding domain-containing protein  34.26 
 
 		 219 aa  122  5e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  37.98 
 
 		 804 aa  121  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  38.86 
 
 		 804 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  38.28 
 
 		 804 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1208  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  35.55 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0811  methanol corrinoid protein  37.97 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1470  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  35.05 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  35.1 
 
 		 802 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  36.26 
 
 		 607 aa  119  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2122  putative dimethylamine corrinoid protein  37.7 
 
 		 232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.154357  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0797  methionine synthase  37.7 
 
 		 232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.310628  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1206  cobalamin B12-binding  32.56 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.136661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  37.14 
 
 		 813 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25850  predicted cobalamin binding protein  35.29 
 
 		 217 aa  118  6e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  37.14 
 
 		 811 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1063  methanol corrinoid protein  37.17 
 
 		 258 aa  115  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1073  methionine synthase  34.6 
 
 		 259 aa  115  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.234469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2550  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  34.27 
 
 		 235 aa  114  8.999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0707  methionine synthase  37.7 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.784551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0740  methanol corrinoid protein  37.31 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0813  methanol corrinoid protein  37.17 
 
 		 256 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4337  cobalamin B12-binding domain-containing protein  35.42 
 
 		 326 aa  112  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.125438  normal  0.389787 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  37.67 
 
 		 806 aa  111  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4321  cobalamin B12-binding domain protein  33.17 
 
 		 214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23490  methionine synthase (B12-dependent)  40.32 
 
 		 820 aa  110  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.136684  hitchhiker  0.0000158862 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2567  cobalamin B12-binding domain protein  36.17 
 
 		 206 aa  108  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000474708  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  36.62 
 
 		 801 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  36.87 
 
 		 791 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  34.55 
 
 		 839 aa  105  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  33.14 
 
 		 768 aa  105  5e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  34.54 
 
 		 801 aa  104  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3637  methanol corrinoid protein  34.22 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2292  methionine synthase  35.6 
 
 		 1157 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0622799  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  32.32 
 
 		 807 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2929  cobalamin B12-binding domain protein  32.04 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000012726  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  33.14 
 
 		 768 aa  102  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  35.23 
 
 		 803 aa  102  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  31.67 
 
 		 556 aa  101  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2325  methionine synthase  33.51 
 
 		 1171 aa  100  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0940297  hitchhiker  0.00240742 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  34.72 
 
 		 1158 aa  101  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5697  methyltransferase MtaA/CmuA family  35.87 
 
 		 617 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2171  methionine synthase  32.8 
 
 		 1167 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.657352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  31.72 
 
 		 1223 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  34.2 
 
 		 1158 aa  99.8  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2093  B12-dependent methionine synthase  32.63 
 
 		 1227 aa  99  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.883808 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  33 
 
 		 793 aa  98.6  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1549  methionine synthase  30.28 
 
 		 1156 aa  98.2  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.217391 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  31.61 
 
 		 1191 aa  98.2  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  31.61 
 
 		 1191 aa  98.2  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2445  methionine synthase  34.42 
 
 		 1199 aa  97.8  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.795669  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2958  cobalamin B12-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 216 aa  97.8  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.885246  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0387  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  33.69 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.682962  normal  0.201782 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1316  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  33.69 
 
 		 207 aa  97.8  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.518339 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  32.13 
 
 		 1178 aa  96.7  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>