More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3637 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3637  methanol corrinoid protein  100 
 
 		 255 aa  511  1e-144  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1063  methanol corrinoid protein  79.46 
 
 		 258 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0740  methanol corrinoid protein  80.16 
 
 		 258 aa  410  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0813  methanol corrinoid protein  77.56 
 
 		 256 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0811  methanol corrinoid protein  62.75 
 
 		 254 aa  332  3e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3584  methylthiol:coenzyme M methyltransferase  38.59 
 
 		 275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.812541  normal  0.0358178 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  34.35 
 
 		 1223 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  35.42 
 
 		 804 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  40.94 
 
 		 768 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1208  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  37.5 
 
 		 210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  39.18 
 
 		 768 aa  124  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1729  Methionine synthase  35.96 
 
 		 210 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1365  dimethylamine corrinoid protein  38.24 
 
 		 251 aa  123  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000308359  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1732  Methionine synthase  35.96 
 
 		 210 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1503  dimethylamine corrinoid protein  34.93 
 
 		 217 aa  122  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.153126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  32.82 
 
 		 800 aa  122  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1368  trimethylamine corrinoid protein  34.3 
 
 		 216 aa  121  9e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000818926  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0729  Methionine synthase  36.27 
 
 		 212 aa  121  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.342972  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  34.02 
 
 		 804 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  36.27 
 
 		 811 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  35.75 
 
 		 813 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2958  cobalamin B12-binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.885246  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4325  methyltransferase cognate corrinoid protein  35.71 
 
 		 214 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0024  methyltransferase cognate corrinoid protein  33.66 
 
 		 220 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  33.33 
 
 		 804 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1073  methionine synthase  35.35 
 
 		 259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.234469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  33.84 
 
 		 807 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2310  trimethylamine corrinoid protein  38.37 
 
 		 216 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00299987  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  33.16 
 
 		 804 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  34.17 
 
 		 839 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2122  putative dimethylamine corrinoid protein  37.06 
 
 		 232 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.154357  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0797  methionine synthase  37.06 
 
 		 232 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.310628  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  32.32 
 
 		 802 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3604  dimethylamine corrinoid protein  35.15 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.220504 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  34.69 
 
 		 801 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2641  cobalamin B12-binding domain protein  33.68 
 
 		 210 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4872  cobalamin B12-binding domain protein  35.75 
 
 		 210 aa  113  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0707  methionine synthase  35.9 
 
 		 232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.784551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2582  Methionine synthase  35.44 
 
 		 213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.242133  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0729  homocysteine S-methyltransferase  33.5 
 
 		 781 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1776  methionine synthase  31.44 
 
 		 232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal  0.011957 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  31.98 
 
 		 774 aa  110  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  33.49 
 
 		 801 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  32.47 
 
 		 806 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2116  corrinoid methyltransferase  33.85 
 
 		 209 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00601394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1501  dimethylamine corrinoid protein  36.82 
 
 		 208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000126339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  30.81 
 
 		 818 aa  109  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  31.75 
 
 		 1136 aa  109  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0840  cobalamin B12-binding domain-containing protein  36.41 
 
 		 219 aa  108  6e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  32.99 
 
 		 804 aa  108  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2550  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  36.04 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1470  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  32.31 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1827  cobalamin B12-binding domain-containing protein  35.44 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1468  methionine synthase  32.02 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543896  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25850  predicted cobalamin binding protein  31.78 
 
 		 217 aa  106  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0075  cobalamin B12-binding domain-containing protein  34.95 
 
 		 219 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.916725  normal  0.540278 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1212  methionine synthase  35.6 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.807396  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2288  dimethylamine corrinoid protein  40.25 
 
 		 168 aa  106  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.974802  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29240  B12-dependent methionine synthase  33.7 
 
 		 1278 aa  105  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0606  B12-dependent methionine synthase  30.88 
 
 		 1232 aa  105  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  31.82 
 
 		 1215 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1110  cobalamin B12-binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1889  B12-dependent methionine synthase  30.93 
 
 		 1245 aa  104  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2159  B12-dependent methionine synthase  29.88 
 
 		 1236 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.088857 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2808  B12-dependent methionine synthase  33.33 
 
 		 1226 aa  104  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  30.34 
 
 		 793 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0840  monomethylamine corrinoid protein  34.22 
 
 		 217 aa  104  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.960899  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0847  monomethylamine corrinoid protein  34.22 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0418  cobalamin-dependent methionine synthase, B12-binding  33.17 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19540  predicted cobalamin binding protein  35.56 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.109769  hitchhiker  0.00000629767 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23490  methionine synthase (B12-dependent)  33.16 
 
 		 820 aa  103  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.136684  hitchhiker  0.0000158862 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4490  B12-dependent methionine synthase  30.1 
 
 		 1209 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.816383  normal  0.548116 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1888  B12-dependent methionine synthase  33.14 
 
 		 1235 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15360  Methionine synthase  32.09 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1982  B12-dependent methionine synthase  33.14 
 
 		 1235 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0368395  normal  0.238169 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3449  B12-dependent methionine synthase  31.96 
 
 		 1234 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.625644  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2784  cobalamin B12-binding protein  34.34 
 
 		 221 aa  102  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0108719  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0045  B12-dependent methionine synthase  32.34 
 
 		 1267 aa  102  7e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4435  B12-dependent methionine synthase  33.15 
 
 		 1227 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40670  B12-dependent methionine synthase  31.96 
 
 		 1234 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0754274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0113  B12-dependent methionine synthase  28.88 
 
 		 1227 aa  102  8e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.352445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0454  B12-dependent methionine synthase  33.16 
 
 		 1228 aa  101  9e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0341811  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5287  methionine synthase  31.3 
 
 		 1266 aa  101  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212227  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2467  methionine synthase  30.73 
 
 		 1261 aa  101  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3634  monomethylamine corrinoid protein  36.09 
 
 		 217 aa  101  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  33.33 
 
 		 803 aa  101  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  35.03 
 
 		 841 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3402  methionine synthase  31.91 
 
 		 889 aa  101  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.131568  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1526  B12-dependent methionine synthase  32.07 
 
 		 1232 aa  101  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4337  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30.05 
 
 		 326 aa  101  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.125438  normal  0.389787 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0222  B12-dependent methionine synthase  33.15 
 
 		 1227 aa  101  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  29.8 
 
 		 804 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4523  B12-dependent methionine synthase  33.15 
 
 		 1227 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.413038 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5489  B12-dependent methionine synthase  33.52 
 
 		 1227 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3923  B12-dependent methionine synthase  33.88 
 
 		 1230 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03851  hypothetical protein  33.52 
 
 		 1227 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0845  monomethylamine corrinoid protein  34.91 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4401  B12-dependent methionine synthase  33.15 
 
 		 1227 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.90979  normal  0.334358 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3320  B12-dependent methionine synthase  32.57 
 
 		 1235 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.487541 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0368  B12-dependent methionine synthase  33.88 
 
 		 1231 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.488667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>