144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1030 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1030  cobalamin B12-binding domain-containing protein  100 
 
 		 358 aa  716    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3324  cobalamin B12-binding protein  74.05 
 
 		 360 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3386  cobalamin B12-binding domain-containing protein  74.05 
 
 		 360 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0329482 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5806  cobalamin B12-binding domain-containing protein  76.68 
 
 		 354 aa  480  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3335  cobalamin B12-binding domain-containing protein  74.05 
 
 		 360 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4920  cobalamin B12-binding domain protein  64.43 
 
 		 366 aa  411  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230842  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4482  cobalamin binding protein-like protein  53.49 
 
 		 351 aa  300  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000437324  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2584  cobalamin B12-binding domain protein  45.73 
 
 		 354 aa  243  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0156694 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0967  cobalamin B12-binding domain protein  43.48 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502888  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35010  predicted cobalamin binding protein  34.67 
 
 		 363 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.77206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5159  twin-arginine translocation pathway signal  34.03 
 
 		 336 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5248  cobalamin B12-binding domain-containing protein  34.03 
 
 		 336 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5540  cobalamin B12-binding domain-containing protein  34.03 
 
 		 336 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.83435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2639  cobalamin B12-binding  31.03 
 
 		 222 aa  107  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1467  cobalamin B12-binding  38.1 
 
 		 364 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.225745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1529  cobalamin B12-binding domain protein  26.83 
 
 		 372 aa  97.8  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0673  cobalamin B12-binding domain protein  32.99 
 
 		 349 aa  94.7  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.846284 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0291  cobalamin B12-binding domain protein  33.52 
 
 		 356 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1691  cobalamin B12-binding domain protein  31.82 
 
 		 339 aa  83.2  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2473  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30.46 
 
 		 398 aa  80.9  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169304 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1208  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  29.27 
 
 		 210 aa  78.2  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2702  cobalamin B12-binding domain-containing protein  37.39 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3258  cobalamin B12-binding domain-containing protein  31.61 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0729  Methionine synthase  25.48 
 
 		 212 aa  72  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.342972  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0108  cobalamin B12-binding domain-containing protein  27.1 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0938  regulatory protein MerR  34.93 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  27.64 
 
 		 804 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  29.11 
 
 		 607 aa  67.8  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2582  Methionine synthase  28.57 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.242133  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1212  methionine synthase  28.37 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.807396  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  25.24 
 
 		 780 aa  67.8  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  19.42 
 
 		 301 aa  67  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  25.89 
 
 		 801 aa  63.9  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2116  corrinoid methyltransferase  23.47 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00601394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  28.02 
 
 		 804 aa  63.5  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1753  regulatory protein MerR  36.52 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  23.38 
 
 		 774 aa  62.8  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  22.71 
 
 		 768 aa  62.8  0.000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3086  hypothetical protein  27.47 
 
 		 201 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0376  MerR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 293 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1468  methionine synthase  26.54 
 
 		 218 aa  62.4  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543896  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  29.57 
 
 		 768 aa  62  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1484  transcriptional regulator, MerR family  29.41 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0787562  hitchhiker  0.0000374152 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2116  regulatory protein, MerR  34.01 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0675  cobalamin B12-binding domain protein  26.86 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000394435  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  24.88 
 
 		 811 aa  59.7  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  25.51 
 
 		 813 aa  59.3  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  26.13 
 
 		 804 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0978  response regulator receiver protein  21.21 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144383 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1732  Methionine synthase  25 
 
 		 210 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1729  Methionine synthase  25 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2387  B12-binding domain-containing protein  27.59 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2567  cobalamin B12-binding domain protein  24.83 
 
 		 206 aa  57  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000474708  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0061  cobalamin B12-binding domain-containing protein  31.25 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2104  cobalamin B12-binding domain protein  28.05 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0454156  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2641  cobalamin B12-binding domain protein  25.12 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  25.13 
 
 		 806 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  25.25 
 
 		 800 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2213  transcriptional regulator, MerR family  31.36 
 
 		 322 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  24.3 
 
 		 1132 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3658  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.96 
 
 		 210 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  24.11 
 
 		 793 aa  55.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  24.77 
 
 		 1132 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2122  putative dimethylamine corrinoid protein  27.5 
 
 		 232 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.154357  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0797  methionine synthase  27.5 
 
 		 232 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.310628  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  24.17 
 
 		 1132 aa  53.9  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0655  cobalamin B12-binding domain protein  23.44 
 
 		 384 aa  53.5  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2776  transcriptional regulator  27.33 
 
 		 290 aa  53.1  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.379235  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  24.3 
 
 		 1132 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  24.3 
 
 		 1132 aa  52.8  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  24.3 
 
 		 1133 aa  52.8  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  24.3 
 
 		 1132 aa  52.8  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5285  cobalamin B12-binding  30.05 
 
 		 295 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.109441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  24.3 
 
 		 1132 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  24.3 
 
 		 1132 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  24.3 
 
 		 1133 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  25.98 
 
 		 1168 aa  52.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  24.3 
 
 		 1132 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1304  cobalamin B12-binding domain protein  24.71 
 
 		 216 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1206  cobalamin B12-binding  30.08 
 
 		 224 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.136661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1827  cobalamin B12-binding domain protein  25.73 
 
 		 213 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  28.46 
 
 		 839 aa  51.2  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0729  homocysteine S-methyltransferase  22.62 
 
 		 781 aa  51.2  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1776  methionine synthase  25.2 
 
 		 232 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal  0.011957 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4818  cobalamin B12-binding  30.6 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0282742 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0606  B12-dependent methionine synthase  28.8 
 
 		 1232 aa  51.6  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1503  dimethylamine corrinoid protein  25.94 
 
 		 217 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.153126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1431  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.06 
 
 		 222 aa  51.2  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000156586  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2171  methionine synthase  23.76 
 
 		 1167 aa  51.2  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.657352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  31.97 
 
 		 816 aa  51.2  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1110  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.23 
 
 		 208 aa  51.2  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  20.3 
 
 		 807 aa  51.2  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5621  transcriptional regulator, MerR family  29.13 
 
 		 294 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.695249 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1470  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  25 
 
 		 232 aa  50.8  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  25.27 
 
 		 1136 aa  50.1  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0811  methanol corrinoid protein  23.47 
 
 		 254 aa  50.1  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  26.71 
 
 		 1180 aa  50.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  21.29 
 
 		 841 aa  50.1  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2028  transcriptional regulator, MerR family  30.65 
 
 		 318 aa  50.1  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332734  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15360  Methionine synthase  26.18 
 
 		 210 aa  49.7  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>