More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1431 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1431  cobalamin B12-binding domain-containing protein  100 
 
 
222 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000156586  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1212  methionine synthase  39.86 
 
 
224 aa  100  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.807396  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2751  cobalamin B12-binding protein  36.19 
 
 
236 aa  97.8  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1468  methionine synthase  31.78 
 
 
218 aa  97.4  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543896  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2387  B12-binding domain-containing protein  35.07 
 
 
226 aa  96.3  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0729  Methionine synthase  29.11 
 
 
212 aa  95.1  8e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.342972  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2582  Methionine synthase  27.23 
 
 
213 aa  93.6  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.242133  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2104  cobalamin B12-binding domain protein  34.39 
 
 
228 aa  91.7  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0454156  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0956  cobalamin B12-binding protein  30.23 
 
 
214 aa  88.6  7e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2929  cobalamin B12-binding domain protein  28.64 
 
 
216 aa  88.2  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000012726  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1729  Methionine synthase  32.71 
 
 
210 aa  87.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  29.86 
 
 
800 aa  86.3  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  28.11 
 
 
607 aa  86.3  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1732  Methionine synthase  32.24 
 
 
210 aa  85.9  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1208  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  28.85 
 
 
210 aa  84.7  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116164  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3658  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.61 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435157  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3199  Methionine synthase B12-binding module cap domain protein  27.37 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0840  monomethylamine corrinoid protein  28.05 
 
 
217 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.960899  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4325  methyltransferase cognate corrinoid protein  25.93 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0847  monomethylamine corrinoid protein  28.05 
 
 
217 aa  79.7  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  26.87 
 
 
841 aa  78.6  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35010  predicted cobalamin binding protein  28.64 
 
 
363 aa  78.6  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.77206  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0387  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  28.29 
 
 
207 aa  77.8  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.682962  normal  0.201782 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1316  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  27.8 
 
 
207 aa  77  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.518339 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  30.48 
 
 
804 aa  77  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2641  cobalamin B12-binding domain protein  28.97 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2958  cobalamin B12-binding domain-containing protein  27.49 
 
 
216 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.885246  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1041  cobalamin B12-binding domain-containing protein  25.48 
 
 
211 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.388992 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0707  methionine synthase  30.58 
 
 
232 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.784551  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1110  cobalamin B12-binding domain-containing protein  34.03 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5697  methyltransferase MtaA/CmuA family  28.23 
 
 
617 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3604  dimethylamine corrinoid protein  29.76 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.220504 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15360  Methionine synthase  28.18 
 
 
210 aa  74.7  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1501  dimethylamine corrinoid protein  29.95 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000126339  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1503  dimethylamine corrinoid protein  29.8 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.153126  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0797  methionine synthase  28.64 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.310628  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2122  putative dimethylamine corrinoid protein  28.64 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.154357  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2116  corrinoid methyltransferase  25.47 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00601394  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4872  cobalamin B12-binding domain protein  36.36 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0597  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.94 
 
 
218 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2784  cobalamin B12-binding protein  27.54 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0108719  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1206  cobalamin B12-binding  25 
 
 
224 aa  71.6  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.136661  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1776  methionine synthase  29.27 
 
 
232 aa  71.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal  0.011957 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1827  cobalamin B12-binding domain protein  28.91 
 
 
213 aa  71.2  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0418  cobalamin-dependent methionine synthase, B12-binding  28.77 
 
 
220 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0539  cobalamin B12-binding domain protein  26.32 
 
 
218 aa  70.5  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  32.97 
 
 
768 aa  70.9  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1365  dimethylamine corrinoid protein  28 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000308359  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1073  methionine synthase  29.76 
 
 
259 aa  70.1  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.234469  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  41.67 
 
 
556 aa  70.1  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0024  methyltransferase cognate corrinoid protein  29.11 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  30.59 
 
 
816 aa  69.3  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2288  dimethylamine corrinoid protein  34.19 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.974802  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3886  cobalamin B12-binding domain protein  29.87 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000310147  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4641  cobalamin B12-binding domain protein  32.33 
 
 
213 aa  68.6  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0075  cobalamin B12-binding domain-containing protein  25.34 
 
 
219 aa  68.2  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.916725  normal  0.540278 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4321  cobalamin B12-binding domain protein  26.89 
 
 
214 aa  67.8  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1603  cobalamin B12-binding domain protein  31.79 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000910131  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1827  cobalamin B12-binding domain-containing protein  24.43 
 
 
219 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2567  cobalamin B12-binding domain protein  27.27 
 
 
206 aa  67.8  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000474708  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25850  predicted cobalamin binding protein  27.44 
 
 
217 aa  68.2  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  30.77 
 
 
768 aa  67  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19540  predicted cobalamin binding protein  30.56 
 
 
219 aa  66.2  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.109769  hitchhiker  0.00000629767 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0811  methanol corrinoid protein  27.55 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0840  cobalamin B12-binding domain-containing protein  23.53 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0845  monomethylamine corrinoid protein  28.42 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1311  cobalamin B12-binding  25.58 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.460326 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0061  cobalamin B12-binding domain-containing protein  37.12 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1107  cobalamin B12-binding domain protein  30.48 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1470  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  28.91 
 
 
232 aa  65.9  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  26.67 
 
 
839 aa  65.9  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  23.19 
 
 
807 aa  65.5  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0842  monomethylamine corrinoid protein  27.37 
 
 
217 aa  65.1  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  30.66 
 
 
818 aa  65.1  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2584  cobalamin B12-binding domain protein  27.31 
 
 
354 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0156694 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4611  cobalamin B12-binding domain protein  28.26 
 
 
210 aa  64.3  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.855843  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  28.57 
 
 
774 aa  64.7  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1304  cobalamin B12-binding domain protein  27.81 
 
 
216 aa  63.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533951  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0195  cobalamin B12-binding domain protein  34.33 
 
 
218 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543164  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0108  cobalamin B12-binding domain-containing protein  24.37 
 
 
356 aa  63.2  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3881  cobalamin B12-binding domain protein  26.37 
 
 
216 aa  62.8  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000148578  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  28.44 
 
 
804 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  29.65 
 
 
802 aa  62  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2571  cobalamin B12-binding domain protein  28.91 
 
 
218 aa  62  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.111371  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3634  monomethylamine corrinoid protein  27.37 
 
 
217 aa  61.6  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1605  cobalamin B12-binding domain protein  29.75 
 
 
212 aa  61.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000212682  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1030  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.83 
 
 
358 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0720  cobalamin B12-binding domain protein  27.7 
 
 
211 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  25.35 
 
 
819 aa  60.1  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  28.57 
 
 
804 aa  60.5  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2631  B12-dependent methionine synthase  29.48 
 
 
1244 aa  60.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0960245  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2550  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  26.61 
 
 
235 aa  60.1  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2310  trimethylamine corrinoid protein  30.51 
 
 
216 aa  60.1  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00299987  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0172  B12-dependent methionine synthase  28.1 
 
 
1239 aa  59.3  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.432955  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1529  cobalamin B12-binding domain protein  21.8 
 
 
372 aa  58.9  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3474  B12-dependent methionine synthase  28.42 
 
 
1251 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2964  cobalamin B12-binding domain-containing protein  31.45 
 
 
223 aa  58.9  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0486605  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1368  trimethylamine corrinoid protein  29.66 
 
 
216 aa  59.3  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000818926  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  27.92 
 
 
804 aa  59.3  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  28.06 
 
 
804 aa  58.9  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>