More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_07480 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 301 aa  612  9.999999999999999e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2473  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.61 
 
 		 398 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169304 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0673  cobalamin B12-binding domain protein  31.71 
 
 		 349 aa  122  6e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.846284 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1691  cobalamin B12-binding domain protein  28.14 
 
 		 339 aa  103  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0291  cobalamin B12-binding domain protein  31.18 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3258  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30.33 
 
 		 370 aa  97.1  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1467  cobalamin B12-binding  23.37 
 
 		 364 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.225745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3086  hypothetical protein  29.35 
 
 		 201 aa  94  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1529  cobalamin B12-binding domain protein  27.86 
 
 		 372 aa  92.4  9e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0108  cobalamin B12-binding domain-containing protein  23.59 
 
 		 356 aa  91.3  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2639  cobalamin B12-binding  28.42 
 
 		 222 aa  90.1  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0978  response regulator receiver protein  30 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144383 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  50 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0655  cobalamin B12-binding domain protein  26.07 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 152 aa  74.7  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  24.88 
 
 		 607 aa  73.6  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  46.58 
 
 		 321 aa  72.4  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0729  Methionine synthase  25 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.342972  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  47.76 
 
 		 114 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0675  cobalamin B12-binding domain protein  27.53 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000394435  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4818  cobalamin B12-binding  25.52 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0282742 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5285  cobalamin B12-binding  25.52 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.109441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  28.29 
 
 		 768 aa  70.1  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  48.53 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 139 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 142 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 115 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1030  cobalamin B12-binding domain-containing protein  19.42 
 
 		 358 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0938  regulatory protein MerR  22.61 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  27.8 
 
 		 768 aa  65.5  0.0000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 123 aa  65.1  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  44.44 
 
 		 123 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1041  cobalamin B12-binding domain-containing protein  24.04 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.388992 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  39.76 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5363  cobalamin B12-binding domain protein  24.08 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.222451 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1753  regulatory protein MerR  20.09 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  27.59 
 
 		 780 aa  62.8  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4920  cobalamin B12-binding domain protein  18.52 
 
 		 366 aa  62.4  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230842  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  48.48 
 
 		 125 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3604  dimethylamine corrinoid protein  26.67 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.220504 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  25 
 
 		 774 aa  61.6  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  50.79 
 
 		 163 aa  61.6  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0956  cobalamin B12-binding protein  25.59 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3738  cobalamin B12-binding  23.33 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0514741  hitchhiker  0.000397426 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3658  cobalamin B12-binding domain-containing protein  23.81 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3324  cobalamin B12-binding protein  17.77 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3386  cobalamin B12-binding domain-containing protein  17.77 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0329482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3335  cobalamin B12-binding domain-containing protein  17.77 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2751  cobalamin B12-binding protein  21.8 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 143 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2044  cobalamin B12-binding domain protein  24.54 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.10014 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  45.59 
 
 		 200 aa  58.9  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2917  transcriptional regulator AnsR  34.45 
 
 		 125 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41229  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2885  ans operon repressor protein  34.45 
 
 		 125 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0484001  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3137  transcriptional regulator AnsR  34.45 
 
 		 125 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0061  cobalamin B12-binding domain-containing protein  31.37 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3138  transcriptional regulator AnsR  34.45 
 
 		 125 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  39.71 
 
 		 104 aa  57.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3160  transcriptional regulator AnsR  34.45 
 
 		 125 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.980504  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 110 aa  58.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2847  ans operon repressor protein  34.45 
 
 		 125 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0729  homocysteine S-methyltransferase  24.72 
 
 		 781 aa  57.8  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 115 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3117  transcriptional regulator AnsR  34.45 
 
 		 125 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2120  transcriptional regulator AnsR  34.45 
 
 		 125 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1212  methionine synthase  18.78 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.807396  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5806  cobalamin B12-binding domain-containing protein  21.74 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2702  cobalamin B12-binding domain-containing protein  27.56 
 
 		 305 aa  57  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1365  dimethylamine corrinoid protein  30.7 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000308359  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  46.77 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0958  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 133 aa  57.4  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0840  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.19 
 
 		 219 aa  57  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 115 aa  57  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 115 aa  57  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0024  methyltransferase cognate corrinoid protein  24.57 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2288  dimethylamine corrinoid protein  31.58 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.974802  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1827  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.19 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2584  cobalamin B12-binding domain protein  17.73 
 
 		 354 aa  55.8  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0156694 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1501  dimethylamine corrinoid protein  26.82 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000126339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1468  methionine synthase  18.06 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543896  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0847  monomethylamine corrinoid protein  24.54 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0075  cobalamin B12-binding domain-containing protein  25.4 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.916725  normal  0.540278 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2792  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 124 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0376  MerR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 293 aa  55.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3983  cobalamin B12-binding  21.43 
 
 		 297 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.110014 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0840  monomethylamine corrinoid protein  24.54 
 
 		 217 aa  55.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.960899  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  22.58 
 
 		 800 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  23.64 
 
 		 804 aa  55.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25850  predicted cobalamin binding protein  26.09 
 
 		 217 aa  55.5  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0281  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 78 aa  54.3  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0335018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2116  regulatory protein, MerR  19.29 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  22.71 
 
 		 793 aa  54.3  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0207  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 106 aa  54.3  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000425004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>