247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2791 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 139 aa  284  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 115 aa  129  9e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2792  XRE family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  48.57 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 137 aa  72  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  41.38 
 
 		 301 aa  68.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1067  transcriptional regulator, XRE family  36.59 
 
 		 82 aa  67.8  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0145003  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 152 aa  67  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  36.47 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2429  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159098 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0471  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.43 
 
 		 72 aa  61.6  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 115 aa  60.1  0.000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 115 aa  60.1  0.000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 111 aa  60.1  0.000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0281  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 78 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0335018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  35.11 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  36.46 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1576  transcriptional regulator, XRE family  45.16 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1565  transcriptional regulator, XRE family  45.16 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1587  transcriptional regulator, XRE family  45.16 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 163 aa  57  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  39.39 
 
 		 200 aa  57  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  34.57 
 
 		 206 aa  57  0.00000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0468  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000157698  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0450  transcriptional regulator, XRE family  36.99 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7699  putative transcriptional regulator  32.73 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.829097  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0656  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 71 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4028  prophage LambdaBa02, repressor protein  29.75 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210086  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3466  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0958  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  36.99 
 
 		 321 aa  54.7  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1010  XRE family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 370 aa  54.3  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2790  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000203467  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  38.57 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  38.36 
 
 		 197 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3831  prophage LambdaBa02, repressor protein  28.93 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0071415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4126  prophage LambdaBa02, repressor protein  28.93 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158818  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 268 aa  52  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  35.71 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  37.14 
 
 		 262 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 117 aa  51.6  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  35.62 
 
 		 201 aa  51.2  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  38.98 
 
 		 262 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  38.98 
 
 		 262 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1998  transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 281 aa  50.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0308  transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 262 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  29 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3019  transcriptional regulator, XRE family  32.93 
 
 		 198 aa  50.4  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 		 194 aa  50.1  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3945  transcriptional regulator, XRE family  27.73 
 
 		 125 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  37.29 
 
 		 459 aa  50.4  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2433  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 132 aa  50.1  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000213647 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1407  transcriptional regulator, XRE family  25.89 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000410599  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2730  putative DNA-binding protein  39.06 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000010572  hitchhiker  0.0000267972 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 176 aa  48.9  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 219 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  35.82 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 194 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  28.74 
 
 		 205 aa  49.3  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1882  prophage LambdaSa2, repressor protein, putative  28.7 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.124676  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4271  transcriptional regulator, XRE family  27.83 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.313399 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1249  Cro/CI family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 74 aa  47.8  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0551  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 		 210 aa  48.1  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.401249  hitchhiker  0.0000933135 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 374 aa  48.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5287  XRE family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.511676  normal  0.279945 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  38.71 
 
 		 369 aa  48.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19180  predicted transcriptional regulator  38.98 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.433834  normal  0.0717748 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 296 aa  47.8  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2999  transcriptional regulator, XRE family  34.25 
 
 		 200 aa  47.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290253  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0513  transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.041665  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  40 
 
 		 374 aa  47  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0218  Cro/CI family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  47  0.00009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.631577  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 327 aa  47  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1039  XRE family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 264 aa  47  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000101655  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  38.33 
 
 		 374 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0418  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  38.24 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00527482  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2467  transcriptional regulator, XRE family  31.73 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000461389  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 380 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2710  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00207223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 359 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1530  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4067  helix-turn-helix domain-containing protein  31.68 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.563451 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  28.57 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000978101  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 192 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 200 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>