More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2146 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 206 aa  419  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0725  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.52 
 
 		 498 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.84 
 
 		 506 aa  107  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000458361  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5158  transcriptional regulator, XRE family  27.04 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.690311 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3446  response regulator receiver  33.33 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.664648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 115 aa  62  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 		 789 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.6 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.53 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  29.2 
 
 		 1265 aa  59.3  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 		 737 aa  59.7  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2967  putative PAS/PAC sensor protein  28.57 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0994  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.05 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.337893  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4159  two component transcriptional regulator  30.7 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.667277  normal  0.0359145 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37500  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  30.77 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0213695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0507  two component transcriptional regulator  29.17 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  38.36 
 
 		 321 aa  58.2  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0916  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.79 
 
 		 234 aa  58.2  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0276045  hitchhiker  9.727110000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0990  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.17 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000957791  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 		 163 aa  57.8  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  26.9 
 
 		 878 aa  57.8  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  38.67 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  38.67 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 115 aa  57.8  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 115 aa  57.8  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.91 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.36 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0004  two component transcriptional regulator  32.74 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000117037  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  43.33 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  31.3 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  22.07 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  31.3 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  43.33 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0710  DNA-binding response regulator  33.73 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00420398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1205  two component transcriptional regulator  31.36 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1858  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.74 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0268  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.77 
 
 		 456 aa  55.8  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540037 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  44.26 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  37.33 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1934  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 476 aa  55.8  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808753  normal  0.132653 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  31.3 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1662  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 		 396 aa  55.5  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2217  two component transcriptional regulator, winged helix family  20.81 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00294817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0766  two component transcriptional regulator  28.46 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0291358  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1179  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 457 aa  55.5  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.655382  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1342  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.56 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0144629  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  41.67 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0411  two component transcriptional regulator  27.56 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2334  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 1121 aa  55.5  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0283  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.77 
 
 		 456 aa  55.5  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0673  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.17 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.996485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0440  two component transcriptional regulator  32.31 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.747409  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2986  putative PAS/PAC sensor protein  26.67 
 
 		 474 aa  55.1  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  44.26 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2942  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.78 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2551  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 		 396 aa  55.1  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14529e-19 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.98 
 
 		 228 aa  54.7  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0047  DNA-binding heavy metal response regulator, putative  27.64 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.116112  hitchhiker  0.00000494979 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  29.77 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 142 aa  53.9  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  42.62 
 
 		 146 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0450  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 		 268 aa  53.9  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  40.98 
 
 		 145 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  27.64 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.382659  hitchhiker  0.0034413 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  27.64 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  29.77 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4665  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.21 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  0.209776 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 137 aa  54.3  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 1039 aa  54.7  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  29.77 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  27.19 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0064  two component heavy metal response transcriptional regulator  27.64 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118539 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1607  response regulator receiver domain-containing protein  28.48 
 
 		 186 aa  54.7  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2245  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.84 
 
 		 460 aa  54.3  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0622  putative PAS/PAC sensor protein  27.73 
 
 		 440 aa  54.3  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1488  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 464 aa  53.9  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.781886  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0963  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  25.6 
 
 		 467 aa  53.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2915  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  25.4 
 
 		 457 aa  53.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  28.07 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 137 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0966  type II secretion system protein E  31.33 
 
 		 746 aa  53.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.783688 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0511  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  27.16 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 152 aa  53.9  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 		 896 aa  53.9  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  27.19 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 118 aa  53.9  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  26.4 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  26.4 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  28.07 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  28.07 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  31.76 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3569  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.5 
 
 		 235 aa  53.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>