More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2217 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_2217  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 276 aa  561  1.0000000000000001e-159  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00294817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2795  two component transcriptional regulator  60.58 
 
 		 266 aa  339  2e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1088  two component transcriptional regulator  59.12 
 
 		 264 aa  333  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237646 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0818  two component transcriptional regulator  52.01 
 
 		 267 aa  258  7e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000529672  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0593  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 267 aa  149  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.501754 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4161  two component transcriptional regulator  37.55 
 
 		 271 aa  145  9e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2305  two component transcriptional regulator  33.58 
 
 		 263 aa  142  8e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3160  two component transcriptional regulator  32.72 
 
 		 295 aa  137  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.272458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  32.09 
 
 		 226 aa  136  4e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  33.58 
 
 		 229 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4049  two component transcriptional regulator  35.58 
 
 		 229 aa  131  9e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.64 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  32.36 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  31.65 
 
 		 240 aa  126  3e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.09 
 
 		 226 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.08 
 
 		 230 aa  125  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000177207  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.77 
 
 		 237 aa  125  8.000000000000001e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0042  response regulator  32.2 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.382747  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1714  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.72 
 
 		 234 aa  124  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4483  two component transcriptional regulator  33.7 
 
 		 226 aa  123  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.759432  decreased coverage  0.000734691 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05730  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  31.73 
 
 		 242 aa  122  4e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.587783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2121  osmolarity response regulator  32.58 
 
 		 248 aa  123  4e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.201602  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.51 
 
 		 243 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.2 
 
 		 233 aa  122  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2582  osmolarity response regulator  31.52 
 
 		 243 aa  122  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4619  two component transcriptional regulator  29.96 
 
 		 245 aa  122  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  33.09 
 
 		 231 aa  122  8e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0126  osmolarity response regulator  31.9 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0135  osmolarity response regulator  31.9 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0191  two component transcriptional regulator  32.09 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1847  two component transcriptional regulator  29.59 
 
 		 234 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000121968  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.84 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0260801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.25 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.11 
 
 		 235 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0461  two component transcriptional regulator  31.72 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.735267  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2500  osmolarity response regulator  31.87 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.6 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3153  osmolarity response regulator  31.87 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0834  two component transcriptional regulator  32.71 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.6033  unclonable  0.00000000040546 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0421  two component transcriptional regulator  29.96 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0518956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  29.41 
 
 		 242 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3104  two component transcriptional regulator  31.23 
 
 		 233 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.317177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.97 
 
 		 226 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0155  two component transcriptional regulator  30.97 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0636837 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  30.18 
 
 		 239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0165  two component transcriptional regulator  30.97 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  30.18 
 
 		 239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  30.6 
 
 		 229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  32.46 
 
 		 235 aa  119  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2193  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.72 
 
 		 237 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0620475  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0174  two component transcriptional regulator  30.97 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  31.39 
 
 		 243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03947  osmolarity response regulator  31.46 
 
 		 240 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  29.41 
 
 		 242 aa  119  4.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  29.74 
 
 		 225 aa  119  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  30.57 
 
 		 238 aa  119  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0404  two component transcriptional regulator  31.72 
 
 		 227 aa  119  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316128 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1777  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.58 
 
 		 226 aa  119  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0722021  normal  0.591414 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.35 
 
 		 234 aa  119  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  32.59 
 
 		 235 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  30.6 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  30.19 
 
 		 229 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  30.69 
 
 		 244 aa  117  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  31.72 
 
 		 228 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  31.37 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2168  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.99 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  29.37 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1584  osmolarity response regulator  30.77 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.131787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46550  response regulator  32.34 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0203573  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1601  DNA-binding response regulator ResD  30.58 
 
 		 250 aa  116  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953648  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1637  DNA-binding response regulator ResD  30.58 
 
 		 250 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0246031  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1386  DNA-binding response regulator ResD  30.58 
 
 		 238 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1359  response regulator  30.58 
 
 		 238 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0319788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1358  response regulator  30.58 
 
 		 238 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2121  two component transcriptional regulator  29.96 
 
 		 231 aa  116  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3661  two component transcriptional regulator  32.96 
 
 		 226 aa  116  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.394742  normal  0.594777 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.78 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.78 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1497  DNA-binding response regulator ResD  30.58 
 
 		 238 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.862661  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1569  DNA-binding response regulator ResD  30.58 
 
 		 250 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45334e-32 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0895  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.15 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.22 
 
 		 226 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  29.89 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  30.22 
 
 		 232 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  29.1 
 
 		 226 aa  116  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1531  DNA-binding response regulator ResD  30.32 
 
 		 238 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18111  two-component response regulator  30.88 
 
 		 248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05120  osmolarity response regulator  31.84 
 
 		 246 aa  116  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3814  DNA-binding response regulator ResD  30.32 
 
 		 238 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.95849e-16 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4363  osmolarity response regulator  31.39 
 
 		 243 aa  116  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2286  osmolarity response regulator  31.62 
 
 		 240 aa  115  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1712  two component transcriptional regulator  30.88 
 
 		 248 aa  116  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.48 
 
 		 226 aa  115  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18291  two-component response regulator  31.25 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.276613  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1399  two component transcriptional regulator  29.6 
 
 		 238 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129694  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3787  transposase  31.46 
 
 		 229 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.19 
 
 		 237 aa  115  7.999999999999999e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1200  two component transcriptional regulator  30.32 
 
 		 238 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3811  osmolarity response regulator  30.71 
 
 		 241 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0373241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3902  osmolarity response regulator  30.71 
 
 		 241 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.140952 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>