More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0575 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
115 aa  234  2e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
115 aa  234  2e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  40.95 
 
 
111 aa  81.6  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  40 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  43.75 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  49.28 
 
 
107 aa  64.7  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  35.96 
 
 
152 aa  63.5  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  48.48 
 
 
293 aa  62.4  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  44.16 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  39.71 
 
 
104 aa  62.4  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 
135 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 
115 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 
139 aa  60.1  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  29.47 
 
 
118 aa  60.1  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  39.68 
 
 
205 aa  58.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  38.27 
 
 
208 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  32.63 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 
206 aa  57.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  44.44 
 
 
194 aa  57.4  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1099  XRE family transcriptional regulator  38.53 
 
 
115 aa  57.8  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 
231 aa  57.4  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 
143 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  41.18 
 
 
301 aa  57  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0656  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 
71 aa  57  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1982  Cro/CI family transcriptional regulator  43.94 
 
 
359 aa  56.2  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  46.38 
 
 
268 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2593  transcriptional regulator  34.92 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2015  Cro/CI family transcriptional regulator  51.06 
 
 
99 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00850971  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2037  Cro/CI family transcriptional regulator  36.11 
 
 
358 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.64032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  35.62 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  27.87 
 
 
144 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  41.03 
 
 
281 aa  55.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  32.93 
 
 
114 aa  55.5  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  42.62 
 
 
369 aa  55.1  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0958  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 
133 aa  55.1  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  33 
 
 
137 aa  55.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1882  prophage LambdaSa2, repressor protein, putative  35.34 
 
 
120 aa  54.7  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.124676  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1626  helix-turn-helix domain protein  32.41 
 
 
121 aa  54.7  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.365666 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 
321 aa  54.7  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1696  transcriptional regulator, XRE family  41.43 
 
 
371 aa  54.7  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324356  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 
134 aa  54.3  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2054  hypothetical protein  32.89 
 
 
255 aa  54.3  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000229491  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1576  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 
75 aa  54.3  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1587  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 
75 aa  54.3  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1565  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 
75 aa  54.3  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  33.85 
 
 
200 aa  54.3  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  29.91 
 
 
143 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  32 
 
 
149 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  45.16 
 
 
117 aa  53.9  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 
205 aa  53.9  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3466  transcriptional regulator, XRE family  34.88 
 
 
121 aa  53.9  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0308  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 
144 aa  53.5  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  34.25 
 
 
92 aa  53.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  34.25 
 
 
149 aa  53.5  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1998  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 
131 aa  53.5  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  36.14 
 
 
118 aa  53.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  34.72 
 
 
262 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  34.25 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0150  transcriptional regulator, XRE family  37.65 
 
 
197 aa  53.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172339  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  36.62 
 
 
296 aa  53.5  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2969  helix-turn-helix domain-containing protein  31.3 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000418472  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  34.25 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  38.33 
 
 
262 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 
262 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  34.88 
 
 
322 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 
229 aa  52.8  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  34.25 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0218  Cro/CI family transcriptional regulator  37.5 
 
 
158 aa  52  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.631577  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  32.5 
 
 
210 aa  52  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4546  transcriptional regulator, XRE family  30.95 
 
 
140 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000650042  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  43.33 
 
 
436 aa  52  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  37.5 
 
 
196 aa  52  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  38.89 
 
 
233 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  38.33 
 
 
262 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  33.8 
 
 
364 aa  51.6  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2073  transcriptional regulator, XRE family  31.07 
 
 
135 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0932046  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  37.84 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0869  helix-turn-helix domain-containing protein  33.65 
 
 
110 aa  51.2  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  34.92 
 
 
338 aa  51.2  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  30.12 
 
 
115 aa  51.6  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 
128 aa  51.6  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0853  XRE family transcriptional regulator  33.65 
 
 
110 aa  51.2  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2058  transcriptional repressor DicA  31.07 
 
 
135 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.211333  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 
273 aa  51.2  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  32.58 
 
 
123 aa  51.2  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5367  transcriptional regulator, XRE family  48.89 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.216549 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1991  Cro/CI family transcriptional regulator  36.84 
 
 
204 aa  50.8  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0450  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 
268 aa  50.8  0.000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1102  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 
261 aa  50.8  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000209596  hitchhiker  0.000000000000029 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A15  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 
204 aa  50.8  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.659709  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3137  transcriptional regulator AnsR  32.04 
 
 
125 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2885  ans operon repressor protein  32.04 
 
 
125 aa  50.4  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0484001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3138  transcriptional regulator AnsR  32.04 
 
 
125 aa  50.4  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2985  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 
183 aa  50.4  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2790  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 
133 aa  50.4  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000203467  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  38.03 
 
 
342 aa  50.4  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>