95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1626 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1626  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 121 aa  248  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.365666 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  39.66 
 
 		 200 aa  52.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0418  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  32.32 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00527482  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0432  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  32.32 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000371645  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7699  putative transcriptional regulator  31.87 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.829097  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 111 aa  48.9  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  40.32 
 
 		 205 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 321 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4546  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000650042  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4032  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 187 aa  47.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.45676  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 152 aa  47.8  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  37.14 
 
 		 206 aa  47.4  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1565  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 75 aa  47  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1587  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 75 aa  47  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1576  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 75 aa  47  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0281  XRE family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0335018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 201 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08540  predicted transcriptional regulator  34.29 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102347 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0798  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 73 aa  46.2  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0286273  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0505  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  28 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.451167  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0163  transcriptional regulator, XRE family  34.72 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  39.62 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1070  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  28 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1067  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  28 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.745753  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1714  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000253714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  38.1 
 
 		 459 aa  45.4  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 205 aa  44.7  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1921  transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 		 78 aa  44.3  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.339052  normal  0.010603 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0169  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0513  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.041665  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0889  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 210 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00940  transcriptional regulator  38.71 
 
 		 240 aa  43.9  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.255625  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 359 aa  43.9  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2793  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000236555  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1907  XRE family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 107 aa  42.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  30.36 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 101 aa  42.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2567  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.59456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0958  helix-turn-helix domain-containing protein  35.48 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2814  transcriptional regulator, XRE family  31.94 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  29.73 
 
 		 194 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  30.3 
 
 		 199 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2209  putative DNA-binding protein  30.7 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1737  helix-turn-helix domain-containing protein  35.59 
 
 		 493 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.754923  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0791  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 528 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  36.51 
 
 		 194 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0656  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3942  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 197 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2559  transcriptional regulator, XRE family  30.65 
 
 		 71 aa  41.6  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4237  transcriptional regulator, XRE family  31.11 
 
 		 140 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.55821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  35.94 
 
 		 196 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 		 192 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0599  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 		 73 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  31.82 
 
 		 197 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1249  Cro/CI family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1242  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 432 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0223131 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2073  transcriptional regulator, XRE family  27.03 
 
 		 135 aa  41.2  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0932046  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0529  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 205 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000109326  normal  0.171352 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 281 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0437  transcriptional regulator  39.06 
 
 		 212 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0038  Helix-turn-helix domain protein  33.9 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000109438  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2058  transcriptional repressor DicA  27.03 
 
 		 135 aa  41.2  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.211333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0632  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2614  transcriptional regulator  40 
 
 		 248 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0917  transcriptional regulator, XRE family  31.34 
 
 		 192 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1102  transcriptional regulator, XRE family  29.73 
 
 		 261 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000209596  hitchhiker  0.000000000000029 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0921  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 260 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4320  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 181 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.810122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3505  transcriptional regulator, XRE family  32.2 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10830  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.213201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 256 aa  40.8  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  34.33 
 
 		 181 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0831  XRE family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 183 aa  40.8  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000078794  normal  0.173113 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  28.81 
 
 		 197 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 208 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 115 aa  40.4  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  31.94 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1115  helix-turn-helix domain protein  34.38 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000265311 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2873  hypothetical protein  26.03 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.305653  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3945  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 125 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  26.67 
 
 		 171 aa  40  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>