167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0505 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0505  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  100 
 
 		 111 aa  221  3e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.451167  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1067  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  100 
 
 		 111 aa  221  3e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.745753  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1070  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  100 
 
 		 111 aa  221  3e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1390  transcriptional regulator  30.39 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.163834  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  39.34 
 
 		 68 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  32.05 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1409  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.503834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1714  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 67 aa  50.1  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000253714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3195  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0958967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1819  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344657  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2292  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.625502 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2296  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.488898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2300  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2304  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1338  DNA-binding protein  38.98 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  31.71 
 
 		 321 aa  48.9  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  39.68 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  39.68 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  39.68 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  39.68 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  39.68 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  39.68 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  36.99 
 
 		 191 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  38.98 
 
 		 206 aa  49.3  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1677  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 72 aa  48.9  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1907  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512195  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0073  helix-turn-helix domain-containing protein  42.19 
 
 		 210 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5460  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 79 aa  47.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0289484  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0169  XRE family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 141 aa  47.8  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 83 aa  47  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4788  transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 		 114 aa  47  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200631  normal  0.763075 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  34.92 
 
 		 301 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0513  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.041665  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4781  transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 		 113 aa  47  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00061071  normal  0.699893 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 194 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2052  XRE family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.14736  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0410  putative transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 152 aa  45.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2733  helix-turn-helix domain-containing protein  27.47 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000416248  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1472  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000374742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0472  transcriptional regulator, XRE family  31.34 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000091739  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 195 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11150  putative transcriptional regulator  34.85 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00242881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1649  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287153  hitchhiker  0.00253502 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0703  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000971993  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4519  DNA-binding protein  28.79 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4366  transcriptional regulator  28.79 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0270567  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4036  transcriptional regulator, XRE family  43.64 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4871  DNA-binding protein  28.79 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0656  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 71 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1931  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  32.84 
 
 		 352 aa  45.4  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.584244  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1626  helix-turn-helix domain protein  28 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.365666 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 69 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  34.38 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  29.23 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0023  transcriptional regulator  27.45 
 
 		 108 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.181624 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 176 aa  44.7  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4745  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 77 aa  45.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2593  transcriptional regulator  31.67 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03313  transcriptional regulator, Cro/CI family protein  28.75 
 
 		 175 aa  44.3  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0626  transcriptional regulator, putative  27.55 
 
 		 303 aa  44.3  0.0006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0882771  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1666  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5594  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5414  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2004  hypothetical protein  30.77 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1630  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 63 aa  43.5  0.0009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 72 aa  43.5  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 195 aa  43.5  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0548  DNA-binding protein  39.22 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  30.77 
 
 		 200 aa  43.5  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2847  ans operon repressor protein  27.96 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2247  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 190 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0685  transcriptional regulator, XRE family  30.67 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1373  XRE family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 175 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.226433 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 		 205 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5920  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 72 aa  42.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5278  DNA-binding protein  33.9 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5023  DNA-binding protein  33.9 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4853  DNA-binding protein; transcriptional regulator  33.9 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5404  DNA-binding protein  33.9 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2085  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 207 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5336  DNA-binding protein  33.9 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5261  DNA-binding protein  33.9 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5291  DNA-binding protein  33.9 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  29.73 
 
 		 199 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_489  DNA-binding protein  39.22 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.140066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>