183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3945 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3945  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 125 aa  251  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4271  transcriptional regulator, XRE family  96.8 
 
 		 125 aa  245  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.313399 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3219  XRE family transcriptional regulator  67.77 
 
 		 125 aa  172  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0012  transcriptional regulator  68.42 
 
 		 131 aa  161  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388282  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3114  XRE family transcriptional regulator  67.54 
 
 		 120 aa  153  7e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2077  hypothetical protein  67.57 
 
 		 126 aa  153  7e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1998  hypothetical protein  67.57 
 
 		 142 aa  153  9e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.846621  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0843  XRE family transcriptional regulator  66.39 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1245  XRE family transcriptional regulator  65.22 
 
 		 127 aa  140  7e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.664422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1891  XRE family transcriptional regulator  55.37 
 
 		 121 aa  126  9.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3488  XRE family transcriptional regulator  56.03 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2894  XRE family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3601  XRE family transcriptional regulator  50.47 
 
 		 124 aa  91.3  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000201761  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4677  transcriptional regulator, XRE family  37.61 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4662  hypothetical protein  34.65 
 
 		 119 aa  57  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.700483  normal  0.0309667 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0148  transcriptional regulator, XRE family  36.45 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0985  DNA binding protein  38.38 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000123712  unclonable  0.0000012964 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0482  XRE family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0889934  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4613  helix-turn-helix domain-containing protein  42.37 
 
 		 113 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1318  transcriptional regulator, XRE family  47.27 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4592  helix-turn-helix domain protein  42.37 
 
 		 113 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1745  XRE family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000375519  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 78 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1221  transcriptional regulator  30.53 
 
 		 468 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  0.453619 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4003  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0418  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  36.36 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00527482  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0432  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  36.36 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000371645  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7274  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 79 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21577  normal  0.150525 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2601  putative transcriptional regulator  40.74 
 
 		 127 aa  47  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0680466  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  39.34 
 
 		 200 aa  47  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  38.98 
 
 		 200 aa  47  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5052  XRE family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.514325  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1613  Cro/CI family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 470 aa  46.2  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1413  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0826  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000131659  unclonable  0.000000470251 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6148  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 284 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.171229 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3148  XRE family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1557  Cro/CI family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 470 aa  46.2  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3929  hypothetical protein  40.35 
 
 		 483 aa  46.2  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  31.91 
 
 		 301 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1248  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.25 
 
 		 267 aa  45.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6541  XRE family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0214  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 281 aa  45.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1396  transcriptional regulator, XRE family  44 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1912  helix-turn-helix domain protein  33.87 
 
 		 258 aa  45.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.978099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1288  XRE family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 295 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.2669 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1371  transcriptional regulator SinR  36.36 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000100854 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1393  transcriptional regulator SinR  36.36 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111718  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  36.36 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1174  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1176  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000910939  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0630  helix-turn-helix domain protein  33.01 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1292  transcriptional regulator SinR  36.36 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00598951  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2759  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 278 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468237  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1750  XRE family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 129 aa  45.1  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00805015  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0799  hypothetical protein  42.11 
 
 		 475 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1435  transcriptional regulator SinR  36.36 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000395729  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  36.36 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1197  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0325651  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2430  transcriptional regulator, XRE family  33.7 
 
 		 276 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  32.29 
 
 		 117 aa  44.3  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0109  hypothetical protein  40.35 
 
 		 482 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.07895 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 176 aa  44.3  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3669  transcriptional regulator, XRE family  32.32 
 
 		 466 aa  44.3  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3195  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0958967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1744  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 235 aa  44.3  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.571892  normal  0.738269 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  44.9 
 
 		 188 aa  44.3  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 223 aa  43.9  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10472  transcriptional regulator  35.06 
 
 		 474 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0407  transcriptional regulator  36.92 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0761  hypothetical protein  34.72 
 
 		 475 aa  43.9  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 321 aa  43.9  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0634  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 475 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0647  hypothetical protein  40.35 
 
 		 475 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385996 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0995  transcriptional regulator, XRE family  47.17 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.651052 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3833  prophage LambdaBa02, repressor protein  36.07 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7277  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 		 189 aa  42.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4130  prophage lambdaba02, repressor protein  36.07 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.05101  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6434  helix-turn-helix domain protein  31.03 
 
 		 279 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147514  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 279 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2210  putative DNA-binding protein  33.33 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0310  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 474 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  37.7 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1926  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0818  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 469 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0627  hypothetical protein  40.35 
 
 		 475 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.995567  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2266  helix-turn-helix domain protein  35.71 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0639842 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0851  transcriptional regulator  35.79 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.36492e-16 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  36.84 
 
 		 206 aa  43.5  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1003  XRE family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77905  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  34.48 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 191 aa  42.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0703  XRE family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000971993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>