96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0826 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0826  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 96 aa  198  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000131659  unclonable  0.000000470251 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1263  XRE family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.197496  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2854  XRE family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770075  normal  0.3412 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2662  XRE family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2614  XRE family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.105443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1292  transcriptional regulator SinR  30.77 
 
 		 107 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00598951  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  30.77 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1371  transcriptional regulator SinR  30.77 
 
 		 107 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000100854 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1745  XRE family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 126 aa  51.6  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000375519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1176  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 107 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000910939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1174  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 107 aa  51.6  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  30.77 
 
 		 107 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4011  transcriptional regulator SinR  30.77 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0025622  hitchhiker  0.000000000000530943 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1003  XRE family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 107 aa  50.4  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77905  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1393  transcriptional regulator SinR  36.07 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111718  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0407  transcriptional regulator  32.53 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1197  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0325651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1435  transcriptional regulator SinR  36.07 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000395729  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  42.86 
 
 		 488 aa  50.1  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 223 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0482  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0889934  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0012  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388282  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1318  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1064  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 206 aa  46.2  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0300833  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2824  XRE family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.829687  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1900  transcriptional regulator, XRE family  35.53 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.43236e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4271  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.313399 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 252 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1462  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3219  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3945  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0887  XRE family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 218 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1135  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  33.78 
 
 		 255 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8637  putative transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0650  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6541  XRE family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4592  helix-turn-helix domain protein  40.82 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4613  helix-turn-helix domain-containing protein  40.82 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0874  helix-turn-helix domain-containing protein  27.47 
 
 		 206 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000967944  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2180  transcriptional regulator, XRE family  36.71 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165219  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1557  Cro/CI family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 470 aa  43.9  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1613  Cro/CI family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 470 aa  43.9  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1413  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3929  hypothetical protein  35.94 
 
 		 483 aa  43.9  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2752  XRE family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.272342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7081  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 245 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.642165 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 218 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0889  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 210 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0038  XRE family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3867  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4004  transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0274  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.64998  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0267  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10482  transcriptional regulator  32.1 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0148  transcriptional regulator, XRE family  47.22 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0214  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2401  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 97 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000242769  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_277  DNA-binding protein  33.71 
 
 		 133 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000765574  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  36.99 
 
 		 188 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2295  transcriptional regulator  40.3 
 
 		 106 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.302272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0551  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 106 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4237  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 140 aa  41.6  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.55821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 300 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1879  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 182 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0336  DNA-binding protein, putative  34.29 
 
 		 133 aa  41.2  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00628261  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0315  helix-turn-helix domain-containing protein  34.29 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138688  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0074  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0070  transcriptional regulator  39.34 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0070  transcriptional regulator  39.34 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0310  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 474 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0083  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440854 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0086  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786766  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1148  XRE family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.406355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0074  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0070  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1454  XRE family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 189 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0073  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  35.48 
 
 		 186 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4719  transcriptional regulator, XRE family  29.21 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0642  XRE family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 161 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112362  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 197 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0655  XRE family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 161 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0635  XRE family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 161 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5234  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302998 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0101  XRE family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 182 aa  40.4  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0310115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3046  transcriptional regulator  35.38 
 
 		 201 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3463  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0807  XRE family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 176 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3536  helix-turn-helix domain protein  32.97 
 
 		 513 aa  40.4  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0818  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 469 aa  40.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 490 aa  40  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4589  helix-turn-helix domain protein  50 
 
 		 115 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 189 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4448  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 193 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0311191  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4609  transcriptional regulator  50 
 
 		 115 aa  40  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.273253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>