61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0148 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_0148  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 134 aa  262  1e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1318  transcriptional regulator, XRE family  62.12 
 
 		 135 aa  166  9e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0482  XRE family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0889934  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3945  transcriptional regulator, XRE family  36.45 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4271  transcriptional regulator, XRE family  35.51 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.313399 
 
 
-
 
NC_002936  DET0336  DNA-binding protein, putative  30.43 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00628261  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2601  putative transcriptional regulator  49.15 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0680466  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0315  helix-turn-helix domain-containing protein  32.2 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138688  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1745  XRE family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000375519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4592  helix-turn-helix domain protein  47.27 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4613  helix-turn-helix domain-containing protein  47.27 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_277  DNA-binding protein  30.51 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000765574  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0214  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_217  hypothetical protein  29.29 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1142  transcriptional regulator, XRE family  29.03 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000709447  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3929  hypothetical protein  37.76 
 
 		 483 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0962  transcriptional regulator, XRE family  35.14 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0119843  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4609  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.273253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4589  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1557  Cro/CI family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 470 aa  46.2  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1613  Cro/CI family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 470 aa  46.2  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1413  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3219  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4255  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 333 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000524025 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4216  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 333 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2077  hypothetical protein  41.82 
 
 		 126 aa  44.7  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0761  hypothetical protein  32.97 
 
 		 475 aa  44.7  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1064  transcriptional regulator, XRE family  29.27 
 
 		 206 aa  44.7  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0300833  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1998  hypothetical protein  41.82 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.846621  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3114  XRE family transcriptional regulator  54.05 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1263  XRE family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 117 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.197496  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2894  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0773  helix-turn-helix domain protein  31.76 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0826  XRE family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000131659  unclonable  0.000000470251 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28370  predicted transcriptional regulator  30.53 
 
 		 475 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2728  DNA-binding protein  27.97 
 
 		 282 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.925835  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0012  transcriptional regulator  27.93 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388282  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0799  hypothetical protein  24.79 
 
 		 475 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0818  transcriptional regulator  42.11 
 
 		 469 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5573  hypothetical protein  35.94 
 
 		 497 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.677106 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1326  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  38.18 
 
 		 309 aa  41.2  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783299  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3669  transcriptional regulator, XRE family  40.43 
 
 		 466 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  32.99 
 
 		 255 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  31.31 
 
 		 256 aa  41.6  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  26.32 
 
 		 474 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0372  transcriptional regulator, XRE family  31.43 
 
 		 209 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00901848  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3659  transcriptional regulator, XRE family  31.82 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0101  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 182 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0310115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4724  hypothetical protein  32.76 
 
 		 474 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0109  hypothetical protein  23.93 
 
 		 482 aa  40.8  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.07895 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1028  XRE family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 464 aa  40.8  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0310  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 474 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  31.88 
 
 		 128 aa  40.4  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4792  XRE family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 490 aa  40.4  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118224  normal  0.264382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 175 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5864  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 470 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0843  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0663  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 145 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  32.86 
 
 		 170 aa  40.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1953  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 131 aa  40.4  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2662  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 128 aa  40  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>