48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1142 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1142  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 111 aa  229  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000709447  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1064  transcriptional regulator, XRE family  40.85 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0300833  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0364  phage repressor  34.23 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0807  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0214  XRE family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_217  hypothetical protein  32.14 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0101  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 		 182 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0310115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3659  transcriptional regulator, XRE family  46.38 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0773  helix-turn-helix domain protein  45.71 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0655  XRE family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 161 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0635  XRE family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 161 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0642  XRE family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 161 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112362  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0663  transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 		 223 aa  49.7  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0962  transcriptional regulator, XRE family  29.13 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0119843  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5593  XRE family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 118 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1953  transcriptional regulator, XRE family  26.13 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  34.74 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0840  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2395  XRE family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 239 aa  48.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0336  DNA-binding protein, putative  42.65 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00628261  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02480  Helix-turn-helix protein  43.48 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.251654  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_277  DNA-binding protein  42.65 
 
 		 133 aa  47.4  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000765574  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10482  transcriptional regulator  40 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0315  helix-turn-helix domain-containing protein  42.65 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138688  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  36.25 
 
 		 170 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6774  transcriptional regulator, XRE family  42.65 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.314572  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0148  transcriptional regulator, XRE family  29.03 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6157  XRE family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 277 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.540338  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0460  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 325 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  42.03 
 
 		 175 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2614  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.105443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2662  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2854  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770075  normal  0.3412 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1148  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.406355  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0300  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.223259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0316  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 191 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2894  XRE family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1545  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.24302  normal  0.741151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1853  hypothetical protein  36.9 
 
 		 248 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0194223 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0379  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 191 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4255  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 333 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000524025 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0555  immunity repressor protein  32.53 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000943913 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4216  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 333 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0025  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 183 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0067  XRE family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 233 aa  40  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4021  transcriptional regulator, XRE family  38.67 
 
 		 156 aa  40  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>