37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0962 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_0962  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 109 aa  221  2e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0119843  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1953  transcriptional regulator, XRE family  33.98 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0214  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0372  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00901848  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1318  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  39.73 
 
 		 223 aa  53.5  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_217  hypothetical protein  32.43 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5593  XRE family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1142  transcriptional regulator, XRE family  29.13 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000709447  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1064  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 206 aa  47.8  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0300833  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0300  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.223259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0663  transcriptional regulator, XRE family  32.43 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0148  transcriptional regulator, XRE family  35.14 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6157  XRE family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 277 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.540338  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2147  peptidase S24 and S26 domain protein  31.58 
 
 		 227 aa  44.3  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  29.73 
 
 		 175 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 199 aa  43.5  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 		 197 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0316  XRE family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 191 aa  41.6  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 201 aa  41.6  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2854  XRE family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 128 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770075  normal  0.3412 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2662  XRE family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 128 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2614  XRE family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 127 aa  41.6  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.105443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 292 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 192 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2984  helix-turn-helix domain protein  30 
 
 		 348 aa  41.2  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0858456  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 200 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 180 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1354  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 190 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0758784  decreased coverage  0.00460659 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 195 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0635  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 198 aa  40.8  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0379  XRE family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 191 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 219 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  26.03 
 
 		 170 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2180  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165219  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 145 aa  40  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>