197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6157 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6157  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 277 aa  530  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.540338  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0460  XRE family transcriptional regulator  56.36 
 
 		 325 aa  205  6e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0663  transcriptional regulator, XRE family  70.54 
 
 		 145 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  50.28 
 
 		 175 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0067  XRE family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 233 aa  159  6e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6774  transcriptional regulator, XRE family  71.03 
 
 		 128 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.314572  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02480  Helix-turn-helix protein  69.81 
 
 		 156 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.251654  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0642  XRE family transcriptional regulator  64.55 
 
 		 161 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112362  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0655  XRE family transcriptional regulator  64.55 
 
 		 161 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0635  XRE family transcriptional regulator  64.55 
 
 		 161 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0773  helix-turn-helix domain protein  65.14 
 
 		 141 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0807  XRE family transcriptional regulator  56.2 
 
 		 176 aa  145  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  62.16 
 
 		 170 aa  145  8.000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  60.5 
 
 		 145 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0025  transcriptional regulator, XRE family  50.61 
 
 		 183 aa  145  9e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0101  XRE family transcriptional regulator  63.21 
 
 		 182 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0310115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0379  XRE family transcriptional regulator  62.86 
 
 		 191 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3659  transcriptional regulator, XRE family  68.27 
 
 		 128 aa  139  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0316  XRE family transcriptional regulator  62.86 
 
 		 191 aa  139  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10482  transcriptional regulator  60.95 
 
 		 140 aa  138  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0840  transcriptional regulator, XRE family  66.98 
 
 		 162 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8227  transcriptional regulator, XRE family  57.26 
 
 		 165 aa  132  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  60.19 
 
 		 128 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4719  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1448  transcriptional regulator, XRE family  43.27 
 
 		 117 aa  78.2  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_217  hypothetical protein  38.57 
 
 		 132 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4921  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320603  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_277  DNA-binding protein  38.89 
 
 		 133 aa  53.5  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000765574  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0336  DNA-binding protein, putative  43.28 
 
 		 133 aa  52.8  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00628261  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4004  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 181 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1487  helix-turn-helix domain protein  44.64 
 
 		 179 aa  51.6  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.735589  normal  0.4627 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 223 aa  51.6  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4806  putative DNA-binding transcriptional regulator  45.45 
 
 		 203 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0315  helix-turn-helix domain-containing protein  43.28 
 
 		 133 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138688  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 252 aa  50.4  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17970  Helix-turn-helix protein  46.43 
 
 		 108 aa  50.4  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.162477  normal  0.719261 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12758  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 112 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000234539  normal  0.119719 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 83 aa  50.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2772  XRE family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 250 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2180  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 		 101 aa  50.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165219  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 105 aa  49.7  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 197 aa  49.3  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0828  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 282 aa  49.3  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7081  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 245 aa  49.3  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.642165 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1357  XRE family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 150 aa  48.9  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2037  transcriptional regulator, XRE family  48.08 
 
 		 154 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00457383  normal  0.0572202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  46.3 
 
 		 150 aa  48.9  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.277192 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1034  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 181 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000342515  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  36.76 
 
 		 186 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 186 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  36.76 
 
 		 186 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 181 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  36.76 
 
 		 186 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25140  Helix-turn-helix protein  34.34 
 
 		 158 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  31.25 
 
 		 181 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2559  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 71 aa  48.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  36.76 
 
 		 186 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0214  XRE family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 131 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2513  DNA-binding protein  36.76 
 
 		 152 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00277307  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4838  transcriptional regulator, XRE family  27.5 
 
 		 193 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0168811  hitchhiker  0.0000750229 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1655  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 		 194 aa  47  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000652652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4848  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 198 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  36.76 
 
 		 186 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  31.25 
 
 		 181 aa  47  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  46.3 
 
 		 256 aa  47.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3771  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 198 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.471902  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 181 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0172  transcriptional regulator  44.29 
 
 		 428 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 205 aa  47  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1745  XRE family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 126 aa  47  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000375519  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0696  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 228 aa  46.6  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1405  transcriptional regulator  41.38 
 
 		 431 aa  46.6  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157932  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  31.25 
 
 		 181 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  31.25 
 
 		 181 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  31.25 
 
 		 181 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  31.25 
 
 		 181 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0643  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 191 aa  46.2  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605698  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4898  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 127 aa  46.2  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.680756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  31.25 
 
 		 181 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1471  helix-turn-helix domain-containing protein  45.71 
 
 		 428 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.772154 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 181 aa  46.2  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  40 
 
 		 197 aa  46.2  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1064  transciptional regulator  38.89 
 
 		 195 aa  46.2  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1750  XRE family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 129 aa  46.2  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00805015  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2735  helix-turn-helix domain-containing protein  50 
 
 		 104 aa  46.2  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1806  helix-turn-helix domain-containing protein  44.29 
 
 		 428 aa  45.8  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.496023 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3325  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 132 aa  45.8  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2455  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 104 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02293  putative transcription regulator protein  45.1 
 
 		 182 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.40687 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3551  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 196 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4365  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 197 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000321232  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2769  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1480  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 116 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  41.67 
 
 		 107 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0772  putative transcriptional regulator, XRE family  39.22 
 
 		 199 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 71 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 71 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  41.67 
 
 		 107 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1176  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 107 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000910939  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 191 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>