More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0655 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_0635  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 161 aa  326  8e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0642  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 161 aa  326  8e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112362  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0655  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 161 aa  326  8e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0807  XRE family transcriptional regulator  80.27 
 
 		 176 aa  229  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0101  XRE family transcriptional regulator  68.54 
 
 		 182 aa  220  6e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0310115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10482  transcriptional regulator  74.26 
 
 		 140 aa  201  5e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0773  helix-turn-helix domain protein  76.11 
 
 		 141 aa  171  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3659  transcriptional regulator, XRE family  69.83 
 
 		 128 aa  163  8e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0460  XRE family transcriptional regulator  65.14 
 
 		 325 aa  150  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6157  XRE family transcriptional regulator  64.55 
 
 		 277 aa  148  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.540338  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02480  Helix-turn-helix protein  56.8 
 
 		 156 aa  148  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.251654  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6774  transcriptional regulator, XRE family  58.12 
 
 		 128 aa  143  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.314572  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0663  transcriptional regulator, XRE family  66.67 
 
 		 145 aa  140  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  60 
 
 		 128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0067  XRE family transcriptional regulator  63.81 
 
 		 233 aa  135  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  58.04 
 
 		 175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0025  transcriptional regulator, XRE family  48.94 
 
 		 183 aa  127  8.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0840  transcriptional regulator, XRE family  54.7 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8227  transcriptional regulator, XRE family  46.05 
 
 		 165 aa  124  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0316  XRE family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 191 aa  121  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0379  XRE family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 191 aa  120  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  47.3 
 
 		 170 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4719  transcriptional regulator, XRE family  49.04 
 
 		 156 aa  87.4  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1448  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 117 aa  82.4  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_217  hypothetical protein  40.28 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0336  DNA-binding protein, putative  40.26 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00628261  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_277  DNA-binding protein  40.26 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000765574  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0315  helix-turn-helix domain-containing protein  40.26 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138688  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3551  transcriptional regulator, XRE family  46.03 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2662  XRE family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2614  XRE family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.105443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2854  XRE family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 128 aa  53.9  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770075  normal  0.3412 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 		 190 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  40.98 
 
 		 186 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0893  XRE family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00171565  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  40.98 
 
 		 186 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 186 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  35.16 
 
 		 223 aa  52  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  40.98 
 
 		 186 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  40.98 
 
 		 186 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1263  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.197496  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  40.91 
 
 		 236 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2513  DNA-binding protein  40.98 
 
 		 152 aa  52  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00277307  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3931  transcriptional regulator, XRE family  40.26 
 
 		 253 aa  52  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  40.98 
 
 		 186 aa  52  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  42.19 
 
 		 236 aa  51.6  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1064  transciptional regulator  40 
 
 		 195 aa  51.6  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 83 aa  51.2  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 252 aa  51.2  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 193 aa  50.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6405  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 189 aa  50.8  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146143  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 193 aa  50.8  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1142  transcriptional regulator, XRE family  45.07 
 
 		 111 aa  50.8  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000709447  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5931  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1034  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000342515  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2247  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 190 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5702  transcriptional regulator, XRE family  45.1 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  45.16 
 
 		 72 aa  49.7  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0273  transcriptional regulator, XRE family  48 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1985  transcriptional regulator, XRE family  44.83 
 
 		 190 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127285  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0214  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  40.62 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  39.73 
 
 		 204 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1987  transcriptional regulator, XRE family  44.83 
 
 		 187 aa  48.9  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  36.99 
 
 		 255 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  32.11 
 
 		 107 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  42.37 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  42.37 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 189 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  42.37 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  42.37 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 191 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  42.37 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 205 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0986  transcriptional regulator, XRE family  39.73 
 
 		 130 aa  48.9  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4806  putative DNA-binding transcriptional regulator  45.45 
 
 		 203 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1655  helix-turn-helix domain protein  34.43 
 
 		 194 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000652652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 192 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 192 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  42.37 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  43.55 
 
 		 72 aa  48.5  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1064  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 206 aa  48.5  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0300833  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4004  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 181 aa  48.5  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1879  transcriptional regulator, XRE family  48 
 
 		 182 aa  48.1  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 256 aa  48.1  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1148  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 99 aa  48.1  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.406355  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  36.43 
 
 		 349 aa  47.8  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 192 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  35.14 
 
 		 197 aa  47.8  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 192 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 145 aa  47.8  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 192 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5130  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  38.1 
 
 		 188 aa  47.8  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.87177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>