More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0773 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0773  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 141 aa  273  5e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3659  transcriptional regulator, XRE family  77.48 
 
 		 128 aa  177  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0635  XRE family transcriptional regulator  76.11 
 
 		 161 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0642  XRE family transcriptional regulator  76.11 
 
 		 161 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112362  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0655  XRE family transcriptional regulator  76.11 
 
 		 161 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0101  XRE family transcriptional regulator  69.84 
 
 		 182 aa  169  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0310115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0807  XRE family transcriptional regulator  74.11 
 
 		 176 aa  168  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10482  transcriptional regulator  71.93 
 
 		 140 aa  167  6e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02480  Helix-turn-helix protein  64.1 
 
 		 156 aa  153  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.251654  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6157  XRE family transcriptional regulator  65.14 
 
 		 277 aa  146  8e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.540338  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6774  transcriptional regulator, XRE family  61.74 
 
 		 128 aa  146  8e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.314572  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0460  XRE family transcriptional regulator  60.77 
 
 		 325 aa  146  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0067  XRE family transcriptional regulator  69.81 
 
 		 233 aa  145  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0663  transcriptional regulator, XRE family  67.31 
 
 		 145 aa  142  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  65.42 
 
 		 175 aa  140  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  56.78 
 
 		 128 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  57.89 
 
 		 170 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0025  transcriptional regulator, XRE family  58.33 
 
 		 183 aa  127  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0316  XRE family transcriptional regulator  58.65 
 
 		 191 aa  126  8.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0379  XRE family transcriptional regulator  58.65 
 
 		 191 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0840  transcriptional regulator, XRE family  55.96 
 
 		 162 aa  123  8.000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  58.88 
 
 		 145 aa  121  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8227  transcriptional regulator, XRE family  56.64 
 
 		 165 aa  120  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1448  transcriptional regulator, XRE family  42.2 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4719  transcriptional regulator, XRE family  46.6 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0336  DNA-binding protein, putative  38.55 
 
 		 133 aa  57  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00628261  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_277  DNA-binding protein  38.1 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000765574  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0315  helix-turn-helix domain-containing protein  38.1 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138688  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3551  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_217  hypothetical protein  41.43 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1148  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.406355  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1985  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 190 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127285  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1064  transciptional regulator  47.37 
 
 		 195 aa  52.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  36.29 
 
 		 349 aa  52  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1987  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 187 aa  51.2  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5931  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 190 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  42.42 
 
 		 236 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1142  transcriptional regulator, XRE family  45.71 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000709447  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4440  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 77 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  43.08 
 
 		 236 aa  50.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1064  transcriptional regulator, XRE family  39.44 
 
 		 206 aa  50.4  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0300833  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 		 190 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 197 aa  50.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0214  XRE family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 131 aa  50.4  0.000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 190 aa  50.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 193 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2247  transcriptional regulator, XRE family  45.31 
 
 		 190 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  28.3 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  36.26 
 
 		 223 aa  49.7  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 191 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3325  XRE family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 193 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  38.57 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 186 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1879  transcriptional regulator, XRE family  48.15 
 
 		 182 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 186 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  37.65 
 
 		 204 aa  48.5  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 186 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 186 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 186 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2772  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 250 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 186 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0696  XRE family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 228 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 218 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0643  XRE family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 191 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605698  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0887  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 218 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1393  transcriptional regulator SinR  37.35 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111718  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2513  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00277307  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1197  XRE family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0325651  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5954  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 187 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0277  XRE family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 204 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.128046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4841  cupin 2 domain-containing protein  35.65 
 
 		 202 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 199 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  30.11 
 
 		 201 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 71 aa  47.8  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1263  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 117 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.197496  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 71 aa  47.8  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4631  DNA-binding protein  39.29 
 
 		 190 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  31.48 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4633  DNA-binding protein  39.29 
 
 		 190 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4400  DNA-binding protein  39.29 
 
 		 190 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4240  DNA-binding protein  39.29 
 
 		 190 aa  47.4  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4252  DNA-binding protein  39.29 
 
 		 190 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4617  DNA-binding protein  39.29 
 
 		 190 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  45.16 
 
 		 72 aa  47  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4740  DNA-binding protein  39.29 
 
 		 190 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  36.99 
 
 		 255 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4333  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 190 aa  47.4  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4613  DNA-binding protein  39.29 
 
 		 190 aa  47  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1435  transcriptional regulator SinR  36.14 
 
 		 107 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000395729  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0622  DNA-binding protein  39.29 
 
 		 190 aa  47  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.475485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0985  DNA binding protein  43.33 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000123712  unclonable  0.0000012964 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3886  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 210 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  36.14 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  42.37 
 
 		 179 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1371  transcriptional regulator SinR  36.14 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000100854 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  42.37 
 
 		 179 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>