180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3325 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3325  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 132 aa  266  8e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0316  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 191 aa  50.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0807  XRE family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  28.37 
 
 		 206 aa  49.7  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0379  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 191 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3659  transcriptional regulator, XRE family  35.44 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0596  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  37.23 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3538  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.902272  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0773  helix-turn-helix domain protein  34.18 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3505  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0025  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 183 aa  48.9  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0026  transcriptional regulator, XRE family  45.9 
 
 		 435 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0122456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2593  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1066  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 78 aa  48.1  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147385  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0898  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1419  XRE family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 178 aa  48.1  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1448  transcriptional regulator, XRE family  30.58 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  37.7 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0167  helix-turn-helix/TPR domain-containing protein  48.15 
 
 		 421 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1427  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2436  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109963  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1232  XRE family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 261 aa  46.2  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0101  XRE family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0310115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0295  helix-turn-helix/TPR domain protein  48.15 
 
 		 421 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6157  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 277 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.540338  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1522  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.379498  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1155  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8227  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1040  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119087 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1396  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0551  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 198 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0642  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112362  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0655  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 179 aa  45.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0635  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  38.89 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1158  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000119717  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1180  helix-turn-helix domain-containing protein  36.36 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1444  helix-turn-helix domain-containing protein  41.18 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3397  XRE family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 282 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  36.07 
 
 		 347 aa  45.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5723  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 90 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118479  normal  0.785242 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0460  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 325 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 175 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  30.88 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5917  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  36.92 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19317  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2572  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 76 aa  44.7  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3041  XRE family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 282 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.620788  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3656  putative transcriptional regulator/TPR domain protein  36.23 
 
 		 421 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5325  XRE family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 282 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0155  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 115 aa  44.3  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4811  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 201 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213383 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0887  XRE family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 218 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6774  transcriptional regulator, XRE family  32.58 
 
 		 128 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.314572  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2009  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 93 aa  44.3  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.634386 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1807  DNA-binding protein  40 
 
 		 403 aa  43.9  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10482  transcriptional regulator  36.07 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5211  XRE family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 282 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0654852 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2198  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 201 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4683  XRE family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 282 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0067  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 233 aa  43.9  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1861  DNA-binding protein  36.62 
 
 		 403 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0467  transcriptional regulator, XRE family  31.15 
 
 		 78 aa  43.9  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000821711  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2294  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  42.55 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00599682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1139  transcriptional regulator  35.38 
 
 		 232 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0958639 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1019  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2981  helix-turn-helix domain-containing protein  39.06 
 
 		 387 aa  43.9  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  27.83 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7274  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 79 aa  42.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21577  normal  0.150525 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0440  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000374773  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4037  DNA-binding protein  35.23 
 
 		 199 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2517  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 201 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0324  XRE family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 282 aa  42.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  32.76 
 
 		 256 aa  42.7  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 255 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5197  transcriptional regulator, XRE family  29.17 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2371  transcriptional regulator, XRE family  29.77 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1520  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0757766  normal  0.0239869 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0663  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2242  helix-turn-helix domain-containing protein  30.77 
 
 		 201 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.453871 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3421  transcriptional regulator, XRE family  34.72 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2628  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 364 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0359208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0267  XRE family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  41.38 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4943  XRE family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 282 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.319472  normal  0.149365 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0025  putative DNA-binding protein  36.36 
 
 		 81 aa  42  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0532078  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0889  XRE family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 210 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02480  Helix-turn-helix protein  36.07 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.251654  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3471  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1555  putative transcriptional regulator  40.74 
 
 		 208 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602269  normal  0.341998 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>