More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4622 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 170 aa  340  7e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6157  XRE family transcriptional regulator  62.16 
 
 		 277 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.540338  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02480  Helix-turn-helix protein  55.64 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.251654  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0663  transcriptional regulator, XRE family  62.73 
 
 		 145 aa  141  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0460  XRE family transcriptional regulator  62.04 
 
 		 325 aa  140  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  57.41 
 
 		 175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0067  XRE family transcriptional regulator  59.65 
 
 		 233 aa  131  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6774  transcriptional regulator, XRE family  56.52 
 
 		 128 aa  130  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.314572  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  52.99 
 
 		 145 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0773  helix-turn-helix domain protein  57.89 
 
 		 141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0840  transcriptional regulator, XRE family  63.11 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10482  transcriptional regulator  49.64 
 
 		 140 aa  125  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3659  transcriptional regulator, XRE family  57.14 
 
 		 128 aa  124  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0101  XRE family transcriptional regulator  54.95 
 
 		 182 aa  123  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0310115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  53.72 
 
 		 128 aa  121  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0807  XRE family transcriptional regulator  52.25 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0655  XRE family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 161 aa  117  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0635  XRE family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 161 aa  117  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0642  XRE family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 161 aa  117  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112362  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0025  transcriptional regulator, XRE family  52.21 
 
 		 183 aa  111  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8227  transcriptional regulator, XRE family  49.63 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0316  XRE family transcriptional regulator  50.96 
 
 		 191 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0379  XRE family transcriptional regulator  50.96 
 
 		 191 aa  107  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4719  transcriptional regulator, XRE family  46 
 
 		 156 aa  90.9  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1448  transcriptional regulator, XRE family  44.12 
 
 		 117 aa  83.6  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2772  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_217  hypothetical protein  38.57 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25140  Helix-turn-helix protein  38.64 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0696  XRE family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 228 aa  53.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  39.19 
 
 		 236 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0643  XRE family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 191 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605698  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_277  DNA-binding protein  37.08 
 
 		 133 aa  52.4  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000765574  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2180  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 101 aa  52.4  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165219  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0336  DNA-binding protein, putative  43.94 
 
 		 133 aa  52  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00628261  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  39.19 
 
 		 236 aa  51.6  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5797  helix-turn-helix domain protein  48.15 
 
 		 138 aa  51.2  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2037  transcriptional regulator, XRE family  47.54 
 
 		 154 aa  51.2  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00457383  normal  0.0572202 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2247  transcriptional regulator, XRE family  43.94 
 
 		 190 aa  51.2  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0214  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 131 aa  50.8  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 252 aa  51.2  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1027  XRE family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 223 aa  50.8  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0315  helix-turn-helix domain-containing protein  43.94 
 
 		 133 aa  50.8  0.000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138688  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3456  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1985  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 190 aa  50.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127285  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3393  transcriptional regulator, XRE family  37.33 
 
 		 199 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000124891  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4921  XRE family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 260 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320603  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0485  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 197 aa  50.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000244144  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  40.98 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4440  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 77 aa  50.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7081  transcriptional regulator, XRE family  48.15 
 
 		 245 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.642165 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  44.26 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4361  transcriptional regulator, XRE family  36.59 
 
 		 265 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  44.26 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0878  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206175  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0188  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 229 aa  50.1  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.054457 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  44.26 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4898  transcriptional regulator, XRE family  43.64 
 
 		 127 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.680756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  44.26 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3551  transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 		 196 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  44.26 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  44.26 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4631  DNA-binding protein  41.82 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4613  DNA-binding protein  41.82 
 
 		 190 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4400  DNA-binding protein  41.82 
 
 		 190 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4240  DNA-binding protein  41.82 
 
 		 190 aa  48.9  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4252  DNA-binding protein  41.82 
 
 		 190 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3438  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 198 aa  49.3  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4740  DNA-binding protein  41.82 
 
 		 190 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4333  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  45.16 
 
 		 72 aa  48.9  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 190 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4633  DNA-binding protein  41.82 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  35.42 
 
 		 255 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4617  DNA-binding protein  41.82 
 
 		 190 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 197 aa  48.9  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 192 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 192 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  43.55 
 
 		 72 aa  48.9  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0336  XRE family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 140 aa  48.5  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000000838003  normal  0.0169736 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0622  DNA-binding protein  41.82 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.475485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  29.9 
 
 		 105 aa  48.9  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2735  helix-turn-helix domain-containing protein  48.15 
 
 		 104 aa  48.9  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5931  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 190 aa  48.5  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 205 aa  48.1  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  31.2 
 
 		 150 aa  48.1  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.277192 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 223 aa  48.1  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  36.07 
 
 		 186 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 186 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2946  transcriptional regulator  36.62 
 
 		 197 aa  48.1  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  36.07 
 
 		 186 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  36.07 
 
 		 186 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1441  XRE family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 227 aa  48.1  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0636175 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07210  Helix-turn-helix protein  35.11 
 
 		 101 aa  48.1  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.217016  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1044  XRE family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 212 aa  48.1  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0507985  normal  0.081223 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 189 aa  47.8  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1357  XRE family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 150 aa  47.8  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8637  putative transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 118 aa  47.8  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 192 aa  47.8  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>