More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0379 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0379  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  371  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0316  XRE family transcriptional regulator  84.18 
 
 		 191 aa  246  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0025  transcriptional regulator, XRE family  80.19 
 
 		 183 aa  177  5.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6157  XRE family transcriptional regulator  63.21 
 
 		 277 aa  145  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.540338  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8227  transcriptional regulator, XRE family  52.67 
 
 		 165 aa  142  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0460  XRE family transcriptional regulator  58.77 
 
 		 325 aa  140  8e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0067  XRE family transcriptional regulator  60.71 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0663  transcriptional regulator, XRE family  60.91 
 
 		 145 aa  137  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6774  transcriptional regulator, XRE family  62.5 
 
 		 128 aa  133  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.314572  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02480  Helix-turn-helix protein  62.39 
 
 		 156 aa  132  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.251654  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0773  helix-turn-helix domain protein  59.05 
 
 		 141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  59.05 
 
 		 175 aa  127  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0807  XRE family transcriptional regulator  57.02 
 
 		 176 aa  124  9e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  58.56 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3659  transcriptional regulator, XRE family  58.25 
 
 		 128 aa  122  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0642  XRE family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 161 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112362  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0635  XRE family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 161 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0655  XRE family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 161 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10482  transcriptional regulator  55.77 
 
 		 140 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0101  XRE family transcriptional regulator  54.81 
 
 		 182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0310115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  52.78 
 
 		 128 aa  114  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  50.94 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0840  transcriptional regulator, XRE family  53.4 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4719  transcriptional regulator, XRE family  44.66 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1448  transcriptional regulator, XRE family  43.27 
 
 		 117 aa  77.4  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_217  hypothetical protein  38.54 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0214  XRE family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 131 aa  57  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4004  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 181 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4806  putative DNA-binding transcriptional regulator  49.12 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3771  transcriptional regulator, XRE family  49.12 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.471902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4848  transcriptional regulator, XRE family  49.12 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 105 aa  53.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3720  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.310668  normal  0.0265405 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5384  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  normal  0.424249 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2635  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 185 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.362634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4807  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 185 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3464  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 185 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4279  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 185 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4902  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 185 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.634753 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4921  XRE family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 260 aa  51.6  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320603  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  35.62 
 
 		 223 aa  51.6  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0696  XRE family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 228 aa  51.2  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0917  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0803  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215741  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0643  XRE family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605698  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1985  transcriptional regulator, XRE family  39.51 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127285  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02293  putative transcription regulator protein  49.09 
 
 		 182 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.40687 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1953  transcriptional regulator, XRE family  31.53 
 
 		 131 aa  49.7  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2037  transcriptional regulator, XRE family  44.23 
 
 		 154 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00457383  normal  0.0572202 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3325  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 132 aa  49.7  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2714  XRE family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 204 aa  49.3  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1555  putative transcriptional regulator  37.7 
 
 		 208 aa  49.3  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602269  normal  0.341998 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 211 aa  48.9  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 201 aa  48.9  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 211 aa  48.9  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2455  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 104 aa  48.9  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0282  Xre family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 169 aa  48.9  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00774991  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  44.64 
 
 		 204 aa  48.9  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4365  XRE family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000321232  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  45.45 
 
 		 107 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1197  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 107 aa  48.5  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0325651  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1035  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 179 aa  48.5  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000017846  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2180  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 101 aa  48.5  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165219  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2325  helix-turn-helix domain-containing protein  44.44 
 
 		 89 aa  48.5  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1371  transcriptional regulator SinR  45.45 
 
 		 107 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000100854 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  45.45 
 
 		 107 aa  48.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1174  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 107 aa  48.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1176  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 107 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000910939  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3551  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 196 aa  48.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5931  transcriptional regulator, XRE family  38.27 
 
 		 190 aa  48.5  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1292  transcriptional regulator SinR  45.45 
 
 		 107 aa  48.1  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00598951  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1435  transcriptional regulator SinR  45.45 
 
 		 107 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000395729  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0273  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 115 aa  48.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1393  transcriptional regulator SinR  45.45 
 
 		 107 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111718  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0921  transcriptional regulator, XRE family  43.94 
 
 		 260 aa  48.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 252 aa  48.1  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1459  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 119 aa  48.1  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000265254 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1034  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 181 aa  47.8  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000342515  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 171 aa  48.1  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1457  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 116 aa  47.8  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00956808  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  40 
 
 		 72 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2181  Cro/CI family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  46.3 
 
 		 256 aa  47.4  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3556  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.427188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3529  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.295271 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1788  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 184 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1998  hypothetical protein  41.18 
 
 		 119 aa  46.6  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.503515  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4036  transcriptional regulator, XRE family  44.64 
 
 		 84 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0872  transcriptional regulator  43.94 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.62802  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1487  helix-turn-helix domain protein  44.44 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.735589  normal  0.4627 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2305  XRE family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 130 aa  47  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0843666 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1064  transciptional regulator  38.98 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  44.83 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 83 aa  45.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>