215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0282 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0282  Xre family transcriptional regulator  100 
 
 		 169 aa  336  8e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00774991  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3303  transcriptional regulator, XRE family  71.83 
 
 		 127 aa  90.9  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158159  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0798  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  70.42 
 
 		 119 aa  89.4  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.529915  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1459  transcriptional regulator, XRE family  68.42 
 
 		 119 aa  89.4  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000265254 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1457  XRE family transcriptional regulator  68.42 
 
 		 116 aa  89.7  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00956808  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2176  putative transcriptional regulator, XRE family  71.01 
 
 		 119 aa  88.6  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1098  XRE family transcriptional regulator  69.57 
 
 		 122 aa  88.2  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380138  normal  0.0621931 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1539  transcriptional regulator, XRE family  68.42 
 
 		 120 aa  87  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.12851  normal  0.11889 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1037  transcriptional regulator, XRE family  65.79 
 
 		 99 aa  84  9e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1208  XRE family transcriptional regulator  65.33 
 
 		 106 aa  84  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00990984  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2810  transcriptional regulator, XRE family  62.16 
 
 		 135 aa  83.6  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143995  hitchhiker  0.0000258946 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07210  Helix-turn-helix protein  64.47 
 
 		 101 aa  83.6  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.217016  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1238  transcriptional regulator, XRE family  64.47 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2455  transcriptional regulator, XRE family  63.16 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5797  helix-turn-helix domain protein  62.67 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23240  Helix-turn-helix protein  63.16 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0729263  normal  0.0373097 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  61.97 
 
 		 150 aa  80.5  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.277192 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3537  XRE family transcriptional regulator  61.33 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1357  XRE family transcriptional regulator  60.56 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3937  helix-turn-helix domain protein  60.53 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25140  Helix-turn-helix protein  64.71 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10510  Helix-turn-helix protein  62.32 
 
 		 101 aa  78.2  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2198  helix-turn-helix domain protein  67.19 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2397  XRE family transcriptional regulator  65.22 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00284023 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0211  transcriptional regulator, XRE family  62.5 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2125  XRE family transcriptional regulator  68.75 
 
 		 104 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2171  XRE family transcriptional regulator  68.75 
 
 		 104 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.864046  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2112  XRE family transcriptional regulator  68.75 
 
 		 104 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0654  transcriptional regulator, XRE family  71.83 
 
 		 118 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213362  normal  0.631068 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1777  helix-turn-helix domain protein  64.06 
 
 		 91 aa  76.3  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3988  XRE family transcriptional regulator  67.19 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475712  normal  0.319411 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0696  XRE family transcriptional regulator  58.67 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1487  helix-turn-helix domain protein  68.75 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.735589  normal  0.4627 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2325  helix-turn-helix domain-containing protein  60.87 
 
 		 89 aa  74.3  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665096  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0643  XRE family transcriptional regulator  58.67 
 
 		 191 aa  74.3  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605698  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17970  Helix-turn-helix protein  60.29 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.162477  normal  0.719261 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4921  XRE family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 260 aa  71.6  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320603  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4898  transcriptional regulator, XRE family  56.34 
 
 		 127 aa  70.5  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.680756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7081  transcriptional regulator, XRE family  61.67 
 
 		 245 aa  67  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.642165 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12758  transcriptional regulator  59.38 
 
 		 112 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000234539  normal  0.119719 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5209  transcriptional regulator, XRE family  49.41 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2735  helix-turn-helix domain-containing protein  44.68 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0221  transcriptional regulator, XRE family  49.3 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2037  transcriptional regulator, XRE family  38.78 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00457383  normal  0.0572202 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4259  helix-turn-helix domain-containing protein  74.42 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0867385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0379  XRE family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2180  transcriptional regulator, XRE family  53.97 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165219  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4260  transcriptional regulator, XRE family  45.95 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34478  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0316  XRE family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25230  Helix-turn-helix protein  45.12 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0025  transcriptional regulator, XRE family  47.46 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2772  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1148  XRE family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.406355  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  44.83 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2038  transcriptional regulator  45.9 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.547476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8637  putative transcriptional regulator, XRE family  44.3 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0336  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 140 aa  53.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000000838003  normal  0.0169736 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  40.66 
 
 		 170 aa  52  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0840  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 162 aa  51.2  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  51.79 
 
 		 191 aa  50.8  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3035  XRE family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 208 aa  50.8  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0663  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 145 aa  50.8  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5637  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 227 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.76756  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 145 aa  50.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6574  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 227 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0448941 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0165  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 200 aa  50.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  48.21 
 
 		 236 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 292 aa  50.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  48.21 
 
 		 236 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 189 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  38.46 
 
 		 180 aa  48.5  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  48.21 
 
 		 179 aa  48.5  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1702  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 218 aa  48.5  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0437  transcriptional regulator  36.07 
 
 		 212 aa  48.5  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5748  transcriptional regulator  36.62 
 
 		 219 aa  48.1  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0807  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 176 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  48.21 
 
 		 179 aa  48.5  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  48.21 
 
 		 179 aa  48.5  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  48.21 
 
 		 179 aa  48.5  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  48.21 
 
 		 179 aa  48.5  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  48.21 
 
 		 179 aa  48.5  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0101  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 182 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0310115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 191 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 193 aa  48.5  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2305  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 130 aa  48.1  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0843666 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 193 aa  48.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 300 aa  48.1  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 190 aa  48.1  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_217  hypothetical protein  40.28 
 
 		 132 aa  47.8  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3720  XRE family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 200 aa  47.8  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.310668  normal  0.0265405 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0642  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 161 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112362  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0655  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 161 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0635  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 161 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3659  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 128 aa  47.8  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02480  Helix-turn-helix protein  34.58 
 
 		 156 aa  47.8  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.251654  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10482  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 140 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8227  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6157  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 277 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.540338  normal  0.674007 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>