46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1953 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1953  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 131 aa  271  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_217  hypothetical protein  41.98 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5593  XRE family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0962  transcriptional regulator, XRE family  33.98 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0119843  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0214  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0372  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 209 aa  50.4  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00901848  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0379  XRE family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 191 aa  50.1  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2614  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.105443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2662  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2854  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770075  normal  0.3412 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  37.86 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0316  XRE family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 191 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2894  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1064  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 206 aa  48.9  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0300833  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1142  transcriptional regulator, XRE family  26.13 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000709447  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2373  XRE family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.859226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0663  transcriptional regulator, XRE family  31.19 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  33.75 
 
 		 223 aa  48.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8227  transcriptional regulator, XRE family  33.93 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02480  Helix-turn-helix protein  36.59 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.251654  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  30.43 
 
 		 175 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6774  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.314572  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10482  transcriptional regulator  31.09 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2147  peptidase S24 and S26 domain protein  28.43 
 
 		 227 aa  43.5  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0635  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0655  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0642  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112362  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0101  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0310115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0025  transcriptional regulator, XRE family  28.44 
 
 		 183 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0460  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 325 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0773  helix-turn-helix domain protein  37.68 
 
 		 141 aa  41.6  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  35.37 
 
 		 128 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0750  transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 		 181 aa  41.2  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0884701 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0840  transcriptional regulator, XRE family  34.07 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2395  XRE family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 239 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1263  XRE family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 117 aa  41.2  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.197496  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3659  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0807  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 176 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1318  transcriptional regulator, XRE family  29.36 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3620  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  35.94 
 
 		 423 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0824  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  35.94 
 
 		 423 aa  40.8  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6157  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 277 aa  40.4  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.540338  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0148  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3491  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  37.93 
 
 		 423 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2782  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.77 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.821719  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0079  Cro/CI family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 196 aa  40.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>