78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3620 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4938  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  85.26 
 
 		 410 aa  749    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0549  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  84.28 
 
 		 410 aa  743    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3491  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  99.76 
 
 		 423 aa  883    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4625  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  83.29 
 
 		 410 aa  729    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4989  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  83.29 
 
 		 410 aa  729    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0668  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  92.25 
 
 		 419 aa  805    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0824  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  100 
 
 		 423 aa  884    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3620  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  100 
 
 		 423 aa  884    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3666  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  83.29 
 
 		 410 aa  729    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4939  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  83.54 
 
 		 410 aa  730    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524439 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4937  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  83.29 
 
 		 410 aa  729    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3608  transcriptional regulator, XRE family  83.54 
 
 		 410 aa  731    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4990  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  85.26 
 
 		 410 aa  749    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4831  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  85.26 
 
 		 410 aa  749    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4904  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  85.26 
 
 		 410 aa  749    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4992  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  85.01 
 
 		 410 aa  748    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5904  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  83.29 
 
 		 410 aa  729    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.793869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3471  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  82.97 
 
 		 419 aa  739    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04231  hypothetical protein  83.29 
 
 		 410 aa  729    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3590  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  84.18 
 
 		 418 aa  749    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.124928  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0448  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  86.31 
 
 		 417 aa  757    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0217552  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0545  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  85.33 
 
 		 417 aa  749    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04266  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  83.29 
 
 		 410 aa  729    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0087  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  52.03 
 
 		 425 aa  468  1.0000000000000001e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3133  cytidyltransferase-related domain protein  41.94 
 
 		 344 aa  277  2e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2058  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  36.93 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.256082 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2213  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  36.9 
 
 		 346 aa  210  3e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2778  cytidyltransferase-like protein  30.86 
 
 		 340 aa  159  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1095  cytidyltransferase-related domain protein  31.36 
 
 		 336 aa  149  7e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000750674  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10214  AsnC family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 323 aa  138  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.909628 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1443  putative NadR-like transcriptional regulator  28.25 
 
 		 350 aa  134  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459335  normal  0.714233 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0517  primase/topoisomerase like protein  32.96 
 
 		 371 aa  124  5e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1517  NMN adenylytransferase and ribosylnicotinamide kinase, NadR ortholog  29.78 
 
 		 380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2174  transcriptional regulatory protein NadR  30.61 
 
 		 337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.384615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32270  cytidyltransferase-related enzyme  26.45 
 
 		 395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.399426  normal  0.498832 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0466  transcriptional regulator  29.38 
 
 		 350 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00195709  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2249  transcriptional regulator  25 
 
 		 379 aa  113  6e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5743  cytidyltransferase-related domain protein  27.79 
 
 		 341 aa  113  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000167926  normal  0.526346 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0896  transcriptional regulator  28.09 
 
 		 397 aa  107  4e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0772254  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0514  NAD metabolism ATPase/kinase  29.71 
 
 		 334 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.301381  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4491  cytidyltransferase-related domain-containing protein  26.88 
 
 		 359 aa  103  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0898942  normal  0.0640263 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0694  transcriptional regulatory protein NadR  24.86 
 
 		 369 aa  89.4  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1542  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  27.8 
 
 		 346 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.658428 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2567  cytidylyltransferase  25.28 
 
 		 368 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000543542 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0750  NAD metabolism ATPase/kinase  31.94 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1586  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  27.01 
 
 		 704 aa  74.3  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1088  NadR-like protein  26.16 
 
 		 182 aa  72  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00476458  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1459  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  29.71 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390673  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0013  NAD metabolism ATPase/kinase-like  31.43 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0719  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  26.59 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.584998 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01540  possible transcriptional regulatory protein nadr (probablyasnc-family)  29.48 
 
 		 184 aa  65.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1414  NadR-like protein  31.13 
 
 		 202 aa  65.1  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.698837  normal  0.400938 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2171  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  25.82 
 
 		 183 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00107801  hitchhiker  0.00555799 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0121  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  27.1 
 
 		 176 aa  57  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3130  NAD metabolism ATPase/kinase-like protein  27.98 
 
 		 172 aa  56.2  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2859  hypothetical protein  25.95 
 
 		 189 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2830  hypothetical protein  24.59 
 
 		 189 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0770617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3340  hypothetical protein  25 
 
 		 175 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39210  hypothetical protein  25.7 
 
 		 175 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377969  normal  0.239365 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2761  hypothetical protein  25.99 
 
 		 183 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3010  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase, putative  23.6 
 
 		 181 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.640969  normal  0.901412 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3143  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase, putative  25.18 
 
 		 178 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.012587  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2922  hypothetical protein  25 
 
 		 189 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4443  DNA-binding protein  38.78 
 
 		 181 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3080  XRE family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 181 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.995144  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4209  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 194 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4258  DNA-binding protein  38.78 
 
 		 181 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0256  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase, putative  23.81 
 
 		 187 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4442  DNA-binding protein  38.78 
 
 		 181 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0755  DNA-binding protein  38.78 
 
 		 181 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4481  DNA-binding protein  38.78 
 
 		 181 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4493  DNA-binding protein  38.78 
 
 		 181 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4094  transcriptional regulator  38.78 
 
 		 181 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4105  transcriptional regulator  38.78 
 
 		 181 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4590  DNA-binding protein  38.78 
 
 		 181 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3247  transcriptional regulatory protein NadR  24.64 
 
 		 194 aa  45.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.602889  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2599  hypothetical protein  22.47 
 
 		 174 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.177122  normal  0.320415 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2655  phosphopantetheine adenylyltransferase  26 
 
 		 174 aa  43.1  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121775 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>