43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1318 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1318  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 135 aa  270  5.000000000000001e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0148  transcriptional regulator, XRE family  62.12 
 
 		 134 aa  166  9e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1745  XRE family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000375519  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0962  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0119843  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3945  transcriptional regulator, XRE family  47.27 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0336  DNA-binding protein, putative  36.49 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00628261  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1263  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.197496  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4271  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.313399 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0482  XRE family transcriptional regulator  59.46 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0889934  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0826  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000131659  unclonable  0.000000470251 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0663  transcriptional regulator, XRE family  39.71 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3219  XRE family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2894  XRE family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28370  predicted transcriptional regulator  27.27 
 
 		 475 aa  45.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_277  DNA-binding protein  35.14 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000765574  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 175 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0315  helix-turn-helix domain-containing protein  33.78 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138688  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0372  transcriptional regulator, XRE family  32.5 
 
 		 209 aa  43.9  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00901848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4613  helix-turn-helix domain-containing protein  56.76 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4592  helix-turn-helix domain protein  56.76 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4255  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 333 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000524025 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3114  XRE family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4216  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 333 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0931  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1028  XRE family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 464 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2601  putative transcriptional regulator  40.68 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0680466  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2406  hypothetical protein  36.51 
 
 		 99 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2174  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 99 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0012  transcriptional regulator  34.55 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388282  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0214  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1223  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  26.96 
 
 		 316 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117145  normal  0.0124179 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4589  helix-turn-helix domain protein  54.05 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4609  transcriptional regulator  54.05 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.273253  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1326  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  38.18 
 
 		 309 aa  40.4  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783299  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2824  XRE family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.829687  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1953  transcriptional regulator, XRE family  29.36 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3046  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 201 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  32.39 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0695  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3931  transcriptional regulator, XRE family  31.82 
 
 		 253 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1998  hypothetical protein  27.27 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.846621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>