76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5593 on replicon NC_009340
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009340  Mflv_5593  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 118 aa  235  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1953  transcriptional regulator, XRE family  32.52 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_217  hypothetical protein  38.03 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0962  transcriptional regulator, XRE family  31.48 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0119843  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1142  transcriptional regulator, XRE family  32.61 
 
 		 111 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000709447  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1064  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 206 aa  48.9  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0300833  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2662  XRE family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2854  XRE family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770075  normal  0.3412 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2614  XRE family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.105443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1148  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.406355  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5157  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.086798  normal  0.235984 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3309  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 209 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  35.29 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.277192 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10482  transcriptional regulator  34.21 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2735  helix-turn-helix domain-containing protein  43.75 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  33.66 
 
 		 505 aa  44.3  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0101  XRE family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 182 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0310115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 67 aa  43.5  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0807  XRE family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1357  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0635  XRE family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03070  predicted transcriptional regulator  42.59 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0655  XRE family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0642  XRE family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112362  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3236  transcriptional regulator, XRE family  28.85 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.355166  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 252 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0389  XRE family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.762812  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 192 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5209  transcriptional regulator, XRE family  39.74 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0211  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2373  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.859226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0960  DNA methyltransferase  38.1 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143973  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0025  transcriptional regulator, XRE family  30.84 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 192 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0221  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4719  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 156 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0549  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  38.18 
 
 		 410 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 72 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1778  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 88 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.815074 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0316  XRE family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 191 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  31.58 
 
 		 128 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 		 191 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0364  phage repressor  28.43 
 
 		 117 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0663  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4841  cupin 2 domain-containing protein  36.62 
 
 		 202 aa  41.2  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2894  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0379  XRE family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 191 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2147  peptidase S24 and S26 domain protein  32.79 
 
 		 227 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2180  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165219  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17240  predicted transcriptional regulator  44.44 
 
 		 242 aa  40.8  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.928492 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2198  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2927  transcriptional regulator, XRE family  40.51 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.298234 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0734  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 282 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 78 aa  41.2  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4921  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 260 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320603  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0798  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  35.48 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.529915  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3025  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 188 aa  40.4  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314698  normal  0.932142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 192 aa  40.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28980  predicted transcriptional regulator  31.15 
 
 		 382 aa  40.4  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.645932 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 191 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  35.62 
 
 		 192 aa  40.4  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 212 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3620  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  38.18 
 
 		 423 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0824  nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase  38.18 
 
 		 423 aa  40.4  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 193 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0643  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 191 aa  40.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605698  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 192 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 192 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 192 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1263  XRE family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 117 aa  40.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.197496  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7693  transcriptional regulator MerR family  36.92 
 
 		 271 aa  40.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4019  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 72 aa  40  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0671372 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  34.33 
 
 		 223 aa  40  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2039  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 		 187 aa  40  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>