104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0221 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0221  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 115 aa  226  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4921  XRE family transcriptional regulator  58.59 
 
 		 260 aa  102  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320603  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2397  XRE family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 110 aa  92  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00284023 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2772  XRE family transcriptional regulator  71.01 
 
 		 250 aa  89.7  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0696  XRE family transcriptional regulator  68.66 
 
 		 228 aa  89.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2125  XRE family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2171  XRE family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.864046  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2112  XRE family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0643  XRE family transcriptional regulator  68.66 
 
 		 191 aa  89  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605698  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3937  helix-turn-helix domain protein  69.12 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3988  XRE family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 104 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475712  normal  0.319411 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12758  transcriptional regulator  53.19 
 
 		 112 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000234539  normal  0.119719 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2810  transcriptional regulator, XRE family  61.11 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143995  hitchhiker  0.0000258946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7081  transcriptional regulator, XRE family  63.24 
 
 		 245 aa  85.5  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.642165 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2198  helix-turn-helix domain protein  59.72 
 
 		 116 aa  85.5  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3303  transcriptional regulator, XRE family  66.18 
 
 		 127 aa  84  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158159  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4898  transcriptional regulator, XRE family  60.87 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.680756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0798  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  55.42 
 
 		 119 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.529915  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07210  Helix-turn-helix protein  56.58 
 
 		 101 aa  82  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.217016  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2455  transcriptional regulator, XRE family  57.69 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2176  putative transcriptional regulator, XRE family  54.88 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4260  transcriptional regulator, XRE family  60 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34478  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1098  XRE family transcriptional regulator  64.71 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380138  normal  0.0621931 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0211  transcriptional regulator, XRE family  54.22 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1487  helix-turn-helix domain protein  61.43 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.735589  normal  0.4627 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23240  Helix-turn-helix protein  60.29 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0729263  normal  0.0373097 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3537  XRE family transcriptional regulator  63.24 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1457  XRE family transcriptional regulator  56.41 
 
 		 116 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00956808  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1459  transcriptional regulator, XRE family  56.41 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000265254 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1238  transcriptional regulator, XRE family  57.89 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2325  helix-turn-helix domain-containing protein  60.29 
 
 		 89 aa  77.8  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665096  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1539  transcriptional regulator, XRE family  57.89 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.12851  normal  0.11889 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1208  XRE family transcriptional regulator  60.29 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00990984  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10510  Helix-turn-helix protein  57.69 
 
 		 101 aa  77  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1037  transcriptional regulator, XRE family  56.58 
 
 		 99 aa  76.6  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2735  helix-turn-helix domain-containing protein  52.81 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1777  helix-turn-helix domain protein  58.21 
 
 		 91 aa  75.1  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  57.35 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.277192 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1357  XRE family transcriptional regulator  57.35 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17970  Helix-turn-helix protein  53.95 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.162477  normal  0.719261 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5797  helix-turn-helix domain protein  56 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5209  transcriptional regulator, XRE family  58.46 
 
 		 148 aa  72  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2037  transcriptional regulator, XRE family  43.36 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00457383  normal  0.0572202 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25140  Helix-turn-helix protein  54.41 
 
 		 158 aa  70.1  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2180  transcriptional regulator, XRE family  43.27 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165219  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8637  putative transcriptional regulator, XRE family  47.12 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4259  helix-turn-helix domain-containing protein  65.67 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0867385  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1480  transcriptional regulator, XRE family  52.17 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0654  transcriptional regulator, XRE family  53.66 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213362  normal  0.631068 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25230  Helix-turn-helix protein  64.15 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3701  transcriptional regulator, XRE family  56.36 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.831068 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1647  helix-turn-helix domain protein  45.79 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.230686  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1148  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.406355  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0282  Xre family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 169 aa  51.6  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00774991  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0273  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0025  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 183 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 505 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0379  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 191 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2305  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0843666 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0336  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000000838003  normal  0.0169736 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0316  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 191 aa  44.3  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1000  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 		 504 aa  44.7  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 256 aa  44.3  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2021  transcriptional regulator, XRE family  28.99 
 
 		 500 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 219 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  39.34 
 
 		 201 aa  43.9  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1846  XRE family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 183 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.677123  hitchhiker  0.00632075 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5085  XRE family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 251 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00667568  normal  0.553791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 197 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 230 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 252 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  41.51 
 
 		 255 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5593  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4832  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2948  transcriptional regulator, XRE family  35.53 
 
 		 225 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211039  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 212 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 		 189 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1998  hypothetical protein  34.72 
 
 		 119 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.503515  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 197 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1223  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  44.62 
 
 		 316 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117145  normal  0.0124179 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0868  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 263 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.471001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0986  transcriptional regulator, XRE family  29.51 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8227  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1326  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  39.53 
 
 		 309 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783299  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0604  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 171 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 192 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 192 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5702  transcriptional regulator, XRE family  30.99 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4036  transcriptional regulator, XRE family  34.72 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  32.31 
 
 		 75 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3342  putative transcriptional regulatory protein  35.94 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0179651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  29.85 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0072  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 488 aa  40.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0809805 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 193 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 192 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 192 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 192 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>