130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2176 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2176  putative transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 119 aa  230  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1098  XRE family transcriptional regulator  81.45 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380138  normal  0.0621931 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3303  transcriptional regulator, XRE family  69.53 
 
 		 127 aa  151  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158159  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0798  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  72.36 
 
 		 119 aa  149  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.529915  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0654  transcriptional regulator, XRE family  71.19 
 
 		 118 aa  125  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213362  normal  0.631068 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1457  XRE family transcriptional regulator  76.92 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00956808  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1459  transcriptional regulator, XRE family  76.92 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000265254 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1539  transcriptional regulator, XRE family  76.92 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.12851  normal  0.11889 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1238  transcriptional regulator, XRE family  76.92 
 
 		 114 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2325  helix-turn-helix domain-containing protein  75.64 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665096  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1208  XRE family transcriptional regulator  75.95 
 
 		 106 aa  110  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00990984  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1037  transcriptional regulator, XRE family  72.29 
 
 		 99 aa  110  6e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2455  transcriptional regulator, XRE family  75.64 
 
 		 104 aa  110  9e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3537  XRE family transcriptional regulator  74.68 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2125  XRE family transcriptional regulator  71.25 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2171  XRE family transcriptional regulator  71.25 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.864046  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2397  XRE family transcriptional regulator  71.25 
 
 		 110 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00284023 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2112  XRE family transcriptional regulator  71.25 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23240  Helix-turn-helix protein  74.36 
 
 		 109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0729263  normal  0.0373097 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10510  Helix-turn-helix protein  56.14 
 
 		 101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  73.08 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.277192 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1487  helix-turn-helix domain protein  74.36 
 
 		 179 aa  103  9e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.735589  normal  0.4627 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3988  XRE family transcriptional regulator  60.64 
 
 		 104 aa  102  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475712  normal  0.319411 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1357  XRE family transcriptional regulator  70.51 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07210  Helix-turn-helix protein  75.68 
 
 		 101 aa  101  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.217016  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3937  helix-turn-helix domain protein  60.82 
 
 		 134 aa  97.1  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17970  Helix-turn-helix protein  60.98 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.162477  normal  0.719261 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2198  helix-turn-helix domain protein  65.38 
 
 		 116 aa  94.4  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0643  XRE family transcriptional regulator  49.58 
 
 		 191 aa  93.6  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605698  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1777  helix-turn-helix domain protein  67.14 
 
 		 91 aa  93.6  8e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0696  XRE family transcriptional regulator  66.22 
 
 		 228 aa  92  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5797  helix-turn-helix domain protein  70 
 
 		 138 aa  90.1  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7081  transcriptional regulator, XRE family  69.01 
 
 		 245 aa  89.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.642165 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2810  transcriptional regulator, XRE family  68.57 
 
 		 135 aa  89.4  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143995  hitchhiker  0.0000258946 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25140  Helix-turn-helix protein  64.79 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12758  transcriptional regulator  61.84 
 
 		 112 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000234539  normal  0.119719 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2772  XRE family transcriptional regulator  54.65 
 
 		 250 aa  80.9  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0221  transcriptional regulator, XRE family  54.88 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4259  helix-turn-helix domain-containing protein  54.7 
 
 		 153 aa  80.1  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0867385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4921  XRE family transcriptional regulator  50.49 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320603  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4898  transcriptional regulator, XRE family  52.33 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.680756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4260  transcriptional regulator, XRE family  55.56 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34478  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0282  Xre family transcriptional regulator  71.01 
 
 		 169 aa  72  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00774991  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0211  transcriptional regulator, XRE family  65.52 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5209  transcriptional regulator, XRE family  48.19 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2180  transcriptional regulator, XRE family  60.66 
 
 		 101 aa  67  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165219  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2037  transcriptional regulator, XRE family  45.83 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00457383  normal  0.0572202 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2735  helix-turn-helix domain-containing protein  46.58 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1480  transcriptional regulator, XRE family  47.14 
 
 		 116 aa  52.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8637  putative transcriptional regulator, XRE family  50.82 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25230  Helix-turn-helix protein  47.37 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1148  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 99 aa  51.6  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.406355  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1702  transcriptional regulator, XRE family  42.65 
 
 		 218 aa  50.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 189 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2038  transcriptional regulator  41.54 
 
 		 230 aa  47  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.547476  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2581  DNA-binding protein  34.29 
 
 		 209 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.449808  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2272  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.29 
 
 		 201 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306888  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0872  transcriptional regulator  33 
 
 		 192 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.62802  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2416  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 259 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2948  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 225 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211039  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 220 aa  45.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3030  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 259 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3049  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 259 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0258201 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 198 aa  45.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  42.42 
 
 		 236 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 171 aa  45.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 191 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 192 aa  45.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  42.42 
 
 		 236 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6377  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 286 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 255 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3469  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 197 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 191 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3075  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 269 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 189 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1647  helix-turn-helix domain protein  50 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.230686  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  42.42 
 
 		 179 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  42.42 
 
 		 179 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  42.42 
 
 		 179 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  42.42 
 
 		 179 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  42.42 
 
 		 179 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  42.42 
 
 		 179 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3025  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 281 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.925102 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3471  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 197 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0766  helix-turn-helix domain protein  37.31 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 193 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0165  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 200 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  35.06 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  36.89 
 
 		 255 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 193 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 252 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 190 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 192 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 192 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0980  XRE family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 192 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3701  transcriptional regulator, XRE family  58.97 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.831068 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 292 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>